Details for gene set HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	P53_collapsed_symbols.P53.cls#MUT_versus_WT
Phenotype	P53.cls#MUT_versus_WT
Upregulated in class	MUT
GeneSet	HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION
Enrichment Score (ES)	0.2717964
Normalized Enrichment Score (NES)	0.77809626
Nominal p-value	0.63461536
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	SLIT2	na	87	0.360	0.0100	Yes
2	FBLN2	na	155	0.328	0.0204	Yes
3	SGCB	na	159	0.326	0.0371	Yes
4	MEST	na	166	0.325	0.0535	Yes
5	EDIL3	na	230	0.305	0.0630	Yes
6	PRSS2	na	449	0.256	0.0545	Yes
7	SCG2	na	457	0.255	0.0671	Yes
8	DST	na	469	0.253	0.0792	Yes
9	COL11A1	na	523	0.246	0.0867	Yes
10	CD59	na	544	0.243	0.0973	Yes
11	PTHLH	na	551	0.241	0.1093	Yes
12	LOX	na	580	0.237	0.1189	Yes
13	ITGA2	na	833	0.206	0.1043	Yes
14	COL7A1	na	851	0.205	0.1133	Yes
15	NT5E	na	864	0.203	0.1227	Yes
16	PFN2	na	1035	0.189	0.1155	Yes
17	DPYSL3	na	1056	0.188	0.1232	Yes
18	FUCA1	na	1109	0.184	0.1276	Yes
19	MMP1	na	1127	0.183	0.1354	Yes
20	DKK1	na	1140	0.181	0.1437	Yes
21	POSTN	na	1144	0.181	0.1528	Yes
22	MYL9	na	1148	0.180	0.1619	Yes
23	MMP3	na	1169	0.178	0.1692	Yes
24	GPX7	na	1201	0.176	0.1752	Yes
25	TPM4	na	1281	0.171	0.1762	Yes
26	MGP	na	1340	0.166	0.1790	Yes
27	TGFBI	na	1348	0.165	0.1869	Yes
28	PDLIM4	na	1349	0.165	0.1955	Yes
29	GEM	na	1370	0.164	0.2021	Yes
30	MMP2	na	1489	0.156	0.1984	Yes
31	RGS4	na	1582	0.150	0.1969	Yes
32	GADD45A	na	1592	0.149	0.2038	Yes
33	SDC4	na	1619	0.147	0.2089	Yes
34	VEGFC	na	1656	0.145	0.2128	Yes
35	MFAP5	na	1666	0.144	0.2195	Yes
36	ACTA2	na	1688	0.143	0.2248	Yes
37	TNC	na	1695	0.142	0.2316	Yes
38	PMP22	na	1754	0.138	0.2329	Yes
39	CDH2	na	1761	0.137	0.2395	Yes
40	GADD45B	na	1763	0.137	0.2466	Yes
41	CDH11	na	1811	0.135	0.2489	Yes
42	NOTCH2	na	1854	0.132	0.2515	Yes
43	LAMC2	na	1861	0.130	0.2577	Yes
44	TGFBR3	na	1978	0.122	0.2524	Yes
45	COL6A2	na	1981	0.121	0.2585	Yes
46	EFEMP2	na	2044	0.117	0.2584	Yes
47	IL6	na	2075	0.115	0.2614	Yes
48	PTX3	na	2187	0.110	0.2559	Yes
49	THBS1	na	2250	0.106	0.2552	Yes
50	LOXL2	na	2271	0.105	0.2587	Yes
51	TGFB1	na	2285	0.105	0.2629	Yes
52	ANPEP	na	2306	0.103	0.2662	Yes
53	TGM2	na	2366	0.100	0.2655	Yes
54	FLNA	na	2420	0.097	0.2653	Yes
55	SFRP1	na	2436	0.096	0.2688	Yes
56	IGFBP2	na	2456	0.095	0.2718	Yes
57	CAP2	na	2510	0.092	0.2712	No
58	CALD1	na	2703	0.082	0.2562	No
59	GPC1	na	2706	0.081	0.2602	No
60	PVR	na	2754	0.079	0.2596	No
61	TPM1	na	2805	0.076	0.2585	No
62	ITGB1	na	2909	0.071	0.2519	No
63	TAGLN	na	2932	0.069	0.2533	No
64	ENO2	na	2975	0.067	0.2525	No
65	SLC6A8	na	2981	0.067	0.2555	No
66	SDC1	na	3012	0.066	0.2559	No
67	COL6A3	na	3038	0.064	0.2568	No
68	MATN2	na	3058	0.064	0.2582	No
69	COL16A1	na	3109	0.061	0.2563	No
70	TPM2	na	3234	0.054	0.2467	No
71	LOXL1	na	3236	0.054	0.2494	No
72	ADAM12	na	3243	0.054	0.2516	No
73	TNFRSF11B	na	3245	0.054	0.2544	No
74	GJA1	na	3249	0.054	0.2569	No
75	COL1A2	na	3283	0.052	0.2563	No
76	ITGB5	na	3321	0.050	0.2551	No
77	PLOD2	na	3385	0.046	0.2512	No
78	CD44	na	3423	0.045	0.2498	No
79	APLP1	na	3465	0.042	0.2479	No
80	SERPINE1	na	3565	0.038	0.2399	No
81	ECM2	na	3694	0.032	0.2287	No
82	PPIB	na	3721	0.031	0.2278	No
83	NID2	na	3756	0.029	0.2259	No
84	AREG	na	3773	0.029	0.2257	No
85	SLIT3	na	3807	0.027	0.2238	No
86	NNMT	na	3821	0.026	0.2239	No
87	WNT5A	na	3883	0.024	0.2190	No
88	IGFBP4	na	3884	0.024	0.2202	No
89	LUM	na	3965	0.020	0.2132	No
90	COPA	na	4050	0.015	0.2055	No
91	LAMC1	na	4063	0.014	0.2051	No
92	SNTB1	na	4140	0.011	0.1980	No
93	CALU	na	4156	0.010	0.1970	No
94	LRRC15	na	4168	0.010	0.1964	No
95	SPARC	na	4245	0.006	0.1891	No
96	BASP1	na	4261	0.005	0.1879	No
97	ITGA5	na	4303	0.004	0.1840	No
98	MATN3	na	4390	0.000	0.1753	No
99	LGALS1	na	4400	-0.001	0.1744	No
100	FBN1	na	4506	-0.005	0.1641	No
101	PRRX1	na	4518	-0.006	0.1633	No
102	GREM1	na	4621	-0.010	0.1536	No
103	SERPINH1	na	4637	-0.011	0.1527	No
104	SGCG	na	4665	-0.012	0.1506	No
105	COMP	na	4679	-0.013	0.1500	No
106	LAMA2	na	4687	-0.013	0.1500	No
107	JUN	na	4816	-0.019	0.1381	No
108	ITGB3	na	4846	-0.021	0.1363	No
109	MYLK	na	4925	-0.023	0.1296	No
110	ITGAV	na	4999	-0.026	0.1237	No
111	SNAI2	na	5067	-0.029	0.1184	No
112	PDGFRB	na	5093	-0.030	0.1175	No
113	PLAUR	na	5152	-0.033	0.1134	No
114	FAP	na	5208	-0.036	0.1097	No
115	IGFBP3	na	5261	-0.038	0.1065	No
116	COL1A1	na	5327	-0.041	0.1020	No
117	FGF2	na	5511	-0.049	0.0862	No
118	COL5A2	na	5516	-0.049	0.0884	No
119	FBLN1	na	5540	-0.050	0.0887	No
120	FBN2	na	5647	-0.055	0.0809	No
121	MCM7	na	5667	-0.056	0.0819	No
122	ID2	na	5868	-0.064	0.0651	No
123	COL3A1	na	6111	-0.075	0.0446	No
124	CRLF1	na	6346	-0.085	0.0255	No
125	LAMA3	na	6394	-0.088	0.0254	No
126	TFPI2	na	6483	-0.092	0.0213	No
127	FOXC2	na	6537	-0.095	0.0209	No
128	CDH6	na	6564	-0.096	0.0233	No
129	FN1	na	6579	-0.097	0.0269	No
130	EMP3	na	6633	-0.099	0.0268	No
131	VIM	na	6687	-0.101	0.0268	No
132	MSX1	na	6692	-0.102	0.0317	No
133	TIMP1	na	6699	-0.102	0.0364	No
134	LRP1	na	6778	-0.106	0.0341	No
135	SERPINE2	na	6830	-0.108	0.0346	No
136	BDNF	na	6854	-0.109	0.0380	No
137	DAB2	na	7002	-0.117	0.0293	No
138	BMP1	na	7029	-0.118	0.0328	No
139	PLOD3	na	7106	-0.122	0.0315	No
140	TIMP3	na	7131	-0.123	0.0355	No
141	ELN	na	7179	-0.125	0.0373	No
142	MMP14	na	7280	-0.130	0.0340	No
143	COL4A1	na	7355	-0.133	0.0335	No
144	PCOLCE	na	7479	-0.140	0.0284	No
145	INHBA	na	7533	-0.143	0.0306	No
146	VCAM1	na	7537	-0.143	0.0377	No
147	CXCL12	na	7581	-0.146	0.0410	No
148	THBS2	na	7737	-0.154	0.0334	No
149	IL15	na	7969	-0.167	0.0189	No
150	RHOB	na	7981	-0.168	0.0266	No
151	FSTL3	na	8211	-0.182	0.0130	No
152	GAS1	na	8271	-0.185	0.0167	No
153	SFRP4	na	8321	-0.188	0.0216	No
154	CAPG	na	8445	-0.196	0.0194	No
155	SGCD	na	8544	-0.203	0.0201	No
156	ECM1	na	8632	-0.209	0.0223	No
157	TNFAIP3	na	8660	-0.211	0.0306	No
158	SPP1	na	8788	-0.219	0.0292	No
159	COL4A2	na	8846	-0.223	0.0351	No
160	FMOD	na	9001	-0.233	0.0318	No
161	CXCL1	na	9567	-0.292	-0.0098	No
162	CXCL6	na	9619	-0.301	0.0007	No
163	FBLN5	na	10025	-0.419	-0.0182	No
164	FAS	na	10075	-0.489	0.0024	No