Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	P53_collapsed_symbols.P53.cls#MUT_versus_WT
Phenotype	P53.cls#MUT_versus_WT
Upregulated in class	MUT
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.19308642
Normalized Enrichment Score (NES)	0.74810517
Nominal p-value	0.8333333
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	COL17A1	na	40	0.398	0.0144	Yes
2	PCDH1	na	49	0.386	0.0314	Yes
3	ITGB4	na	82	0.363	0.0450	Yes
4	SLIT2	na	87	0.360	0.0613	Yes
5	SYK	na	163	0.325	0.0688	Yes
6	VASP	na	165	0.325	0.0837	Yes
7	RSU1	na	378	0.271	0.0750	Yes
8	CTNND1	na	406	0.264	0.0845	Yes
9	RRAS	na	470	0.253	0.0898	Yes
10	CALB2	na	474	0.252	0.1012	Yes
11	ACTN1	na	640	0.228	0.0952	Yes
12	ACTG2	na	713	0.220	0.0981	Yes
13	ITGA2	na	833	0.206	0.0957	Yes
14	KCNH2	na	1010	0.192	0.0869	Yes
15	CRAT	na	1019	0.191	0.0949	Yes
16	ACTN4	na	1082	0.186	0.0973	Yes
17	MAPK13	na	1134	0.182	0.1006	Yes
18	MYL9	na	1148	0.180	0.1076	Yes
19	DLG1	na	1151	0.180	0.1158	Yes
20	DSC1	na	1174	0.178	0.1218	Yes
21	ICAM4	na	1240	0.173	0.1233	Yes
22	CLDN4	na	1341	0.166	0.1209	Yes
23	TGFBI	na	1348	0.165	0.1279	Yes
24	JUP	na	1368	0.164	0.1336	Yes
25	CDH3	na	1378	0.163	0.1403	Yes
26	AMH	na	1455	0.159	0.1400	Yes
27	MMP2	na	1489	0.156	0.1439	Yes
28	MAPK14	na	1494	0.156	0.1507	Yes
29	EGFR	na	1500	0.156	0.1574	Yes
30	TUBG1	na	1590	0.149	0.1554	Yes
31	GNAI2	na	1606	0.148	0.1607	Yes
32	VCL	na	1745	0.138	0.1533	Yes
33	TAOK2	na	1769	0.137	0.1573	Yes
34	CLDN9	na	1781	0.136	0.1625	Yes
35	CDH11	na	1811	0.135	0.1658	Yes
36	MYH9	na	1820	0.134	0.1712	Yes
37	TRAF1	na	1833	0.133	0.1761	Yes
38	LAMC2	na	1861	0.130	0.1795	Yes
39	NFASC	na	1886	0.129	0.1830	Yes
40	ZYX	na	1962	0.122	0.1811	Yes
41	PTK2	na	1965	0.122	0.1866	Yes
42	TRO	na	2008	0.119	0.1879	Yes
43	CLDN7	na	2032	0.118	0.1910	Yes
44	ACTB	na	2106	0.114	0.1889	Yes
45	GRB7	na	2177	0.110	0.1870	Yes
46	MVD	na	2179	0.110	0.1920	Yes
47	LAMB3	na	2219	0.108	0.1931	Yes
48	ICAM5	na	2365	0.100	0.1831	No
49	MAP4K2	na	2386	0.098	0.1857	No
50	HRAS	na	2536	0.090	0.1749	No
51	RASA1	na	2566	0.089	0.1761	No
52	THBS3	na	2574	0.088	0.1795	No
53	IRS1	na	2605	0.087	0.1805	No
54	TIAL1	na	2733	0.080	0.1715	No
55	CD86	na	2811	0.076	0.1672	No
56	AKT2	na	2818	0.075	0.1701	No
57	YWHAH	na	2897	0.071	0.1655	No
58	ITGB1	na	2909	0.071	0.1677	No
59	CDH4	na	2917	0.070	0.1703	No
60	CTNNA1	na	3022	0.065	0.1628	No
61	ITGA3	na	3044	0.064	0.1637	No
62	ADAM9	na	3084	0.062	0.1627	No
63	NF1	na	3106	0.061	0.1634	No
64	COL16A1	na	3109	0.061	0.1660	No
65	ADRA1B	na	3161	0.058	0.1635	No
66	TNFRSF11B	na	3245	0.054	0.1577	No
67	MDK	na	3278	0.052	0.1569	No
68	CAP1	na	3300	0.051	0.1571	No
69	B4GALT1	na	3427	0.044	0.1465	No
70	NF2	na	3611	0.036	0.1298	No
71	ADAM15	na	3660	0.034	0.1266	No
72	ICAM1	na	3668	0.034	0.1274	No
73	SHC1	na	3698	0.032	0.1260	No
74	EPB41L2	na	3935	0.021	0.1032	No
75	PKD1	na	3995	0.018	0.0982	No
76	SDC3	na	4177	0.009	0.0804	No
77	ARPC2	na	4179	0.009	0.0807	No
78	FSCN1	na	4359	0.002	0.0628	No
79	ICAM2	na	4428	-0.002	0.0561	No
80	CDH8	na	4437	-0.002	0.0554	No
81	FBN1	na	4506	-0.005	0.0488	No
82	INPPL1	na	4513	-0.006	0.0484	No
83	PIK3CB	na	4599	-0.010	0.0404	No
84	TSC1	na	4694	-0.014	0.0315	No
85	SLC30A3	na	4839	-0.020	0.0180	No
86	GNAI1	na	5051	-0.028	-0.0019	No
87	CLDN8	na	5060	-0.029	-0.0013	No
88	FLNC	na	5098	-0.030	-0.0037	No
89	CD99	na	5267	-0.038	-0.0188	No
90	JAM3	na	5357	-0.042	-0.0258	No
91	PBX2	na	5358	-0.042	-0.0238	No
92	SYMPK	na	5378	-0.043	-0.0237	No
93	CDH1	na	5427	-0.045	-0.0264	No
94	MSN	na	5551	-0.051	-0.0364	No
95	DHX16	na	5980	-0.069	-0.0763	No
96	DSC3	na	6005	-0.070	-0.0754	No
97	SGCE	na	6024	-0.071	-0.0739	No
98	PFN1	na	6162	-0.077	-0.0842	No
99	CDK8	na	6172	-0.078	-0.0815	No
100	LAMA3	na	6394	-0.088	-0.0996	No
101	ARHGEF6	na	6433	-0.089	-0.0993	No
102	NRXN2	na	6501	-0.093	-0.1017	No
103	CDH6	na	6564	-0.096	-0.1035	No
104	RAC2	na	6641	-0.100	-0.1065	No
105	CDSN	na	6713	-0.103	-0.1089	No
106	PLCG1	na	6742	-0.105	-0.1069	No
107	CX3CL1	na	6949	-0.114	-0.1223	No
108	IKBKG	na	7022	-0.118	-0.1241	No
109	BMP1	na	7029	-0.118	-0.1192	No
110	PTPRC	na	7214	-0.126	-0.1319	No
111	AKT3	na	7356	-0.133	-0.1399	No
112	PTEN	na	7359	-0.133	-0.1339	No
113	CDH15	na	7376	-0.134	-0.1293	No
114	MPZL1	na	7444	-0.138	-0.1297	No
115	VCAM1	na	7537	-0.143	-0.1323	No
116	PIK3R3	na	7590	-0.146	-0.1307	No
117	WASL	na	7647	-0.149	-0.1295	No
118	TJP1	na	7697	-0.151	-0.1274	No
119	GTF2F1	na	7751	-0.154	-0.1256	No
120	VWF	na	7902	-0.163	-0.1331	No
121	MMP9	na	8098	-0.175	-0.1446	No
122	CLDN5	na	8132	-0.177	-0.1398	No
123	DMP1	na	8225	-0.183	-0.1406	No
124	COL9A1	na	8433	-0.195	-0.1523	No
125	VAV2	na	8504	-0.200	-0.1501	No
126	GAMT	na	8514	-0.200	-0.1418	No
127	MYH10	na	8581	-0.205	-0.1389	No
128	INSIG1	na	8794	-0.220	-0.1500	No
129	AMIGO2	na	8834	-0.222	-0.1437	No
130	BAIAP2	na	8953	-0.230	-0.1449	No
131	ADAM23	na	8991	-0.232	-0.1379	No
132	ATP1A3	na	9076	-0.240	-0.1352	No
133	ITGA9	na	9085	-0.240	-0.1249	No
134	MADCAM1	na	9226	-0.251	-0.1273	No
135	NRTN	na	9314	-0.261	-0.1240	No
136	ACTN2	na	9322	-0.262	-0.1126	No
137	PECAM1	na	9325	-0.262	-0.1006	No
138	CD34	na	9446	-0.276	-0.0999	No
139	ACTA1	na	9477	-0.281	-0.0899	No
140	ACTG1	na	9503	-0.284	-0.0793	No
141	ALOX15B	na	9700	-0.315	-0.0844	No
142	CNTN1	na	9804	-0.333	-0.0794	No
143	ACTN3	na	9829	-0.338	-0.0661	No
144	CLDN14	na	9869	-0.348	-0.0539	No
145	SRC	na	9908	-0.362	-0.0410	No
146	MAPK11	na	9955	-0.384	-0.0279	No
147	ITGA10	na	10043	-0.441	-0.0162	No
148	CLDN18	na	10064	-0.470	0.0035	No