-_109472_110874_111017_112193_112290_112999_113148_113986_114104_114740_114810_116141_116309_117209_117261_128897_128996_130115
935131	contig_6102_pilon	-	3357	27	Intergenic	novelGene_31891	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.192307692307692	1	185	18	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCTCTGACCTGGGTGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395264	373243	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_373272_373402_373476_373632_373725_373902_373960_374388_374499_374585_374777_374902_374988_375443_375531_375634_375730_375966_376037_376205_376308_378893_379031_379329_379485_379615_379793_379953_380046_380169_380214_380327_380408_380537_380630_380894_380968_381061_381132_393030_393143_393275_393433_393538_393643_393734_393853_393927_394027_394212_394271_394465
935132	contig_5302_pilon	-	2244	7	Intergenic	novelGene_81425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	131.834070794398	1	94	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	247	744	325	1068	209238	176743	FALSE	25	TTTCCTTTTCAAAACCTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWPSPPLYPLSPSCGYRQHFPAPTAAPGAPYPRFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAIDSNCSEWWGSDVLMYHLMTGIPCAFYHLSC	209562	175566	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176836_181231_181374_181904_182025_182930_183024_185037_185126_185963_186076_209142
935133	contig_1452_pilon	+	1951	3	Intergenic	novelGene_115160	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTGCATTTCCAGGTCCATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698319	715401	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_699951_700533_700692_715239
935134	contig_14441_pilon	+	1052	7	Intergenic	novelGene_100492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	19.3620476419435	1	46	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	462	1037	125667	126728	FALSE	5	TGGCCGTGTGTCCGGGGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGKGDGGTPEPESTHPNWPPEKLIPCTLTWVSSPSPLCSPRVLSPLASLHGHLLHLCFPEIQLPALNPNQMNQ	92196	126743	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92487_92567_92708_121183_121235_125517_125902_126159_126299_126526
935135	contig_9345_pilon	-	1397	14	Intergenic	novelGene_24553	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	225.42425484973	1	31	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	414	950	729379	727162	TRUE	10	CTGGTACGTGTGGGCATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDFEQECGVDVVVTPEQIEEAVEAAINRHQPQLLVERYHFNMGLLMGEARAVLKWADGKMIKHEVDMQVLHLLGPKTESDLDKKSKVVKARPEAADRRKAKDVVENGVAAGQALALMEQLRGEALKFHKPGENYKTPGYVTTPHTMNLLKQHLEITGGQVCAYPVPTRAQWNPSHWTC	730143	726000	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_726129_726226_726336_726417_726497_726598_726699_727130_727218_727389_727480_727600_727673_728013_728075_728214_728269_728799_728865_729088_729165_729316_729427_729657_729919_730038
935136	contig_4388_pilon	-	1787	3	Intergenic	novelGene_162001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	91	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AAGCAGAAAAAGAAAAAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2022921	2020876	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4388_pilon_-_2021521_2021559_2022167_2022385
935137	contig_2710_pilon	+	3436	2	Intergenic	novelGene_161793	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	26	81	262	342	1062392	1062472	TRUE	75	CAAAAAAAAAAAAAATCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WYNNRCIDQWNRIENPDINSSTYKQLVFDKGPKSVNWGKDSLFNKWYWHNWISISKKLKQDSYLTPCTKTNSKWIKDLNIKSKTIKIMEEKTGTMLGALIHGINTIRSISNNA	1062130	1065714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2710_pilon_+_1062705_1062852
935138	contig_17074_pilon	+	2174	13	Intergenic	novelGene_145117	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	221.340408395957	1	71	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	104	1105	212372	221624	TRUE	35	ATTAACATTTCAGACCGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRQEATGLRSSTLAEQSEAAATSQYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFVQIGRFFLSAGLIDKVDNFKPLSLSKLEDPHVDIVRRGDFFYHSENPKYPEVGDLRVSFSYAGLSGDDPDLGPAHVVTVVARQRGDQLVPYSTKSGDTLLLLHHGDFSAEEVFHREQKSNSLKTWGLRATGWIAMFMGLNLMTRILYTLGWSSGGVCRAAHLA	207933	224456	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208007_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216355_216493_216616_216903_216979_217591_217694_220892_221011_221580_221690_223452
935139	contig_20951_pilon	-	796	2	Intergenic	novelGene_43047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	9	21674	junction_1	0	30	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCAAGGAGTGGCTCTGTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27562	26554	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_-_27293_27504
935140	contig_10930_pilon	-	2436	1	Intergenic	novelGene_37054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTGTTTTCACAGAAATCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280391	277955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_278000_280400
935141	contig_1275_pilon	-	1288	13	Intergenic	novelGene_108788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	626.325305962396	2	58	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1038	250	1287	485958	448468	FALSE	75	CAGAAAAAACAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGWSERPARLFRTRSRGEDARLGRVVLLKSGGAQGLTLRQFPDPAFGGKHEAPSSPLSGQPCGDDQNASPSKLSKEELIQSMDRVDREIAKVEQQILKLKKKQQQLEEEAAKPPEPEKPVSPPPVEQKHRSIVQIIYDENRKKAEEAHKIFEGLGPKVELPLYNQPSDTKVYHENIKTGVPARRMMKNQVMRKKLILFFKRRNHARKQREQKICQRYDQLMEAWEKKVDRIENNPRRKAKESKTREYYEKQFPEIRKQREQQERFQRVGQRGAGLSATIARSEHEISEIIDGLSEQENNEKQMRQLSVIPPMMFDAEQRRVKFINMNGLMEDPMKVYKDRQFMNVWTDHEKEIFKDKFIQHPKNFGLIASYLERKSVSDCVLYYYLTKKNENYKALVRRNYGKRRGRNQQIARPSQEEKVEEKEEDK	546909	448466	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1275_pilon_-_448522_456870_456973_457653_457709_459285_459465_463445_463537_464410_464584_468121_468189_470238_470266_470593_470647_471140_471198_480387_480502_485892_486076_546777
935142	contig_3155_pilon	-	1882	4	Intergenic	novelGene_26388	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	68	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCTTCCTGTTCGGAGTCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	262532	258101	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_-_258166_259207_259328_259729_259978_261082
935143	contig_14970_pilon	+	2009	10	Intergenic	novelGene_44988	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	13	junction_6	5932.04959479114	1	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	394	1185	127	1311	136145	231550	FALSE	15	TAACTCTTTGTGCTGTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATNMDSSHSTTLQPTTDPDGGLDLDRTGPLAMATRHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136018	232248	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_210762_210859_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
935144	contig_3956_pilon	+	1450	7	Intergenic	novelGene_15271	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1028.83101139108	1	60	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	440	928	1289515	1290491	FALSE	20	TGTGGAGCCTACGCGACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1286546	1291013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1286606_1287276_1287536_1287968_1287993_1289152_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935145	contig_1244_pilon	-	1541	14	Intergenic	novelGene_38031	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1038.43517345449	1	33	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	486	1458	83	1540	948448	923125	FALSE	25	CTCTGCTCAGTTCTTAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEADIALIGLAVMGQNLILNMNDHGFVVCAFNRTVSKVDDFLASEAKGTKVVGAHSLKEMVSKLKKPRRIILLVKAGQAVDDFIEKLVPLLDAGDIIIDGGNSEYRDTTRRCRDLKAKGILFVGSGVSGGEEGARHGPSLMPGGNKEAWPHIKTIFQGIAAKVGTGEPCCDWVGDEGAGHFVKMVHNGIEYGDMQLICEAYHLMKDVLGMDHNEMAEAFEEWNKTELDSFLIEITASILKFRDTDGKHLLPKIRDSAGQKGTGKWTAISALEYGVPVTLIEAVFARCLSSLKDERIQASKKLKGPQKIQFEGDKKSFLEDIRKALYASKIISYAQGFMLLRQAATEFGWTLNYGGIALMWRGGCIIRSVFLGKIKDAFDRNPELQNLLLDDFFKSAVENCQDSWRRAVSTGVQTGIPMPCFTTALSFYDGYRHEMLPANLIQAQRDYFGAHTYELLAKPGQFIHNSINQDIPFATQHCLRGPLPY	948530	923123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_-_923187_923263_923331_923428_923552_923726_923827_924214_924349_924583_924712_927036_927227_928758_928894_931617_931688_933736_933856_934499_934566_946439_946620_947578_947655_948440
935146	scaffold_12124_pilon	+	2022	8	Intergenic	novelGene_22307	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3814.4942639616	3	103	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1201	1851	1508755	1509405	FALSE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473592	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1489013_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497127_1508010
935147	contig_10930_pilon	-	2257	6	Intergenic	novelGene_37027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1549.72289135832	3	107	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	616	1464	276835	268388	FALSE	10	TGATTTTCCAGTTTTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVLPLLTAIEFHSAWAMGMRVNLLVANTHHVSLNMTGSGIYAPHSPKVYHYDMETASGKLLLSEVDSHPRVSPAYPAAINWSAYARTIKPFPIQKNTFGGFISRDEFNFTELYESAGNLTVCQKELCCHLSYRMLEKEENEVYVLGAFTGLHGRRRLEYWQVCTMLKCKTANLTTCGQPVETASTRFEMFSLSGTFETKYVFPEVLLSKIHLSPGKFEVLKDGRLVNKNGTSGPILTVSLFGRWYTKDLLYNSGRTSNSARSYLLISILLMITALQNIVMA	279096	267594	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_268580_272837_273009_273950_274325_276723_277211_278443_278637_279049
935148	contig_3414_pilon	+	1360	1	Intergenic	novelGene_80959	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	65	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	987	1352	3527	3892	NA	10	CTTGTTTATTGATTGTGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFFINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	2540	3900	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3414_pilon_+_2500_3900
935149	contig_11052_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_115457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	4525	junction_1	270	4	36	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	95	526	102902	107529	FALSE	10	CTTCTCGACTTGTTCACTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASLRAPLFLLAALALAGMLSAATSARTPRLLGGIMDAEENEEGVQHALDFAISEYNKASNDKFHSRVMQVVRARKQIVSGVNYFLDVEIGRTVCTKSQPNLATCPFHDQPHLKKKALCSFQIYTVPWLGTTSMTKSSCQDA	102807	107798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11052_pilon_+_103136_106346_106461_107445
935150	contig_3095_pilon	+	1246	5	Intergenic	novelGene_74974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	3	40	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	74	838	147241	151151	TRUE	15	TAGGTGGAGTTTTCAGTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147167	152245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935151	contig_7730_pilon	+	1426	1	Intergenic	novelGene_156294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	62	6	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	TAAAATAAAATTAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	403495	404921	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7730_pilon_+_403500_404900
935152	contig_8330_pilon	+	1431	10	Intergenic	novelGene_71823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	179.225494218255	1	58	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	74	790	853343	856687	TRUE	45	TACAAGAAGTACGAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	853269	857542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_853348_853989_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
935153	contig_5033_pilon	-	2258	6	Intergenic	novelGene_28915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1559	junction_2	616.522635431985	2	129	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	565	1014	464569	450673	FALSE	25	GGAGAGAAGTACGGTGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLQVQTGKEASSKCIAYPPSPQESENITAAALATGACIVGILCLPLILLLVYKQRQAASNRRAQELVRMDNSNIQGIENPGFETSPPAQGILEAKPRVPLSYMAQRQPSESGRRLLSEPNTPLSPPGPGDVFFPSLDPVPDSPNSEAI	465133	449428	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5033_pilon_-_450711_451536_451734_453095_453124_456495_456604_462973_463031_464547
935154	SIRV6	+	770	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	6	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	45	2	TRUE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GGGAAAGAGCAATCAACTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10243	11330	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10812_11031_11109_11205
935155	contig_13888_pilon	+	2913	1	Intergenic	novelGene_151817	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTGCTGCTGTGCACGTCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	361666	364579	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13888_pilon_+_361700_364600
935156	contig_6488_pilon	-	2742	2	Intergenic	novelGene_44708	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	496	junction_1	0	1	87	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	76	444	6608	2875	FALSE	15	TGGCTGCCACCACTGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIEIESSDVIRLIMQYLKENSLHRALATLQEETTVSLNTVDSIESFVADINSGHWDTVLQAIQSLKLPDKTLIDLYEQVGVVVIRIPCVGLLWNHCLGSISEHSLQSYMAVTACRSYLVLL	6683	576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6488_pilon_-_3218_6582
935157	contig_2204_pilon	+	1903	6	Intergenic	novelGene_71670	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	125.714597402211	1	13	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	591	905	38839	50221	FALSE	10	GGGCATCATGCCTGGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGRPHWRKRNIEGKQYLSNMGTRSTYLLPSMATFVTSNKPDLQVTIKEESCPMPYNSSWPTFADLPLAPSVTAAPSSSRPDQETRASVIKKTSDITQPRVKSC	13176	51219	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2204_pilon_+_13277_14740_14918_15433_15470_25596_25715_38679_38845_49912
935158	contig_15666_pilon	-	1916	6	Intergenic	novelGene_70186	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	649.46889070994	1	101	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	95	766	110619	108819	TRUE	25	TCAGGGAAAGTGATGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQARSLGVQRYYS	110713	107158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108579_108854_109098_109378_109948_110246_110558
935159	contig_19402_pilon	+	3707	13	Intergenic	novelGene_80814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1388.5646065872	2	86	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	231	696	535	1230	97756	143056	TRUE	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGPPLVKTQTVTISDSANAVKSEIPTKDVPIVHTETKTITYEAAQTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	72683	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_72691_79130_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_130468_130598_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802_145822_146261
935160	contig_14513_pilon	+	1209	4	Intergenic	novelGene_70393	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTCTATCTGTAGGGGAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11365	19056	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_+_12158_13087_13136_14952_15001_18735
935161	contig_8712_pilon	-	1689	2	Intergenic	novelGene_58820	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	405	1283	1687	321940	318073	FALSE	15	CGGCAACTGGTGGGAGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGVWRFVTFDDGPLEREDHLNRTSTRVGLGESWKGLLSAHGRLHVGRVLQTLVGAQESFAVGTVVVHILQGVHAEGDEAAARHAPQQAQASAGEPGEGTSIVGEPRHDHLVAGGTAHLDRAVEKRDGLLHIHGL	323222	318070	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8712_pilon_-_318221_321683
935163	contig_17144_pilon	-	866	5	Intergenic	novelGene_29374	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	364.181273543822	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	26	784	167982	166152	FALSE	20	AATTCTTGAGTGTGCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGGTTSAVTPLSPSWGASPPAPSPMRTSGSRPALWEPQCPHPQARRMTVSLGHCWTSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	168007	166069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166581_166752_166843_167248_167331_167581_167676_167918
935164	contig_18081_pilon	+	1376	4	Intergenic	novelGene_23778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	548	junction_1	671.571788170607	1	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	183	552	67	618	90717	112338	FALSE	95	AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MENGAVYAPTTEEAPGPARGARSGLTAFFSPGRLQWYRRALKGLQLLLSLLAFICEEVVSQCTMCGGLYFFEFVSCSAFLLSLLILTVYCTPVYDRVDAEKVKLSDFYITLGTGVVFLLASIIFTTTHDRTSAETAAVVFGFLASLMFLLDFAIMLHGKHQETQLRKPEMTTRAEALTEPLNT	90650	113096	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18081_pilon_+_90855_104503_104681_108417_108517_112200
935165	contig_11512_pilon	+	2845	15	Intergenic	novelGene_43365	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	108	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	155	468	1789	2256	556850	580118	TRUE	5	GGTTTGTTTATGTCCCCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAEGMYPMPCTKYLKASASLAGCKRTPLFRLYLEEGGLRGVQLRVALHLTASTAGESSPTTNNDSLQGDGVGARHGPLDLQVPPAVVGVDEQVQVGGVHVVHDVLAVGVDHLHVVMHFFLPEEVRHHHVRQGLGPPRDLGERPSPSSLLHKGSR	554961	622338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_556127_556226_556866_561325_561389_567731_567802_570036_570079_571041_571107_573287_573391_576894_576961_580075_580156_581645_581711_582719_582776_586511_586637_592797_592903_609586_609669_622219
935166	contig_3018_pilon	-	1805	12	Intergenic	novelGene_78880	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	436.021077661722	2	72	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	184	552	1253	1804	570362	563010	FALSE	20	ATCCAGAGTGCCCTGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRYEEANNNQYSEGVQKEAQRIALRLGNGNDKKEMNKSDLNTNNLLFKPPVESHIQKNKKILKSAKDLPPDALIIEYRGKFMLREQFEANGYFFKRPYPFVLFYSKFHGLEMCVDARTFGNEARFIRRSCTPNAEVRHEIEDGTIHLYIYSIQNIPKGTEITIAFDFDYGNCKYKVDCACLKE	625099	563008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570435_572321_572361_576713_576887_580063_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_624772
935167	contig_19459_pilon	+	1180	7	Intergenic	novelGene_59868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTGAATAATTTTGTGGGCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6668	19120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_+_7120_7789_7945_10267_10330_12582_12707_15506_15700_16201_16265_18988
935168	contig_1301_pilon	+	1603	13	Intergenic	novelGene_47321	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACAGCGCCTACGTGTGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	269184	322877	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_269263_270309_270402_278296_278465_279344_279452_283355_283450_284683_284903_292184_292308_296606_296765_296920_297008_297691_297766_305263_305408_309750_309931_322798
935169	contig_7119_pilon	+	1939	1	Intergenic	novelGene_40986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	96	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	200	603	195	797	139196	139798	NA	30	TGATGAACACTGATGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	139001	140940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_139000_140900
935170	contig_12605_pilon	+	1000	5	Intergenic	novelGene_64207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2967.48853199132	2	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	624	376	999	4816	6230	FALSE	20	TCAGGTAGAGAGGGGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWVHHGNCCWPGCLWTAGCWSCGGCSCDLEEEE	3876	6231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_6005_6138
935171	contig_7119_pilon	-	2383	3	Intergenic	novelGene_40955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	1328	2074	139626	138880	TRUE	35	ACAAAGACCTAGCCCATGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140953	127535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127601_136974_137041_138701
935172	contig_5020_pilon	-	3855	1	Intergenic	novelGene_27787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	124	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAACAGAACATTGCTTGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	33898	30043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_-_30000_33900
935173	contig_14925_pilon	-	1663	5	Intergenic	novelGene_55289	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	928.495389056941	1	78	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	67	480	116065	114666	TRUE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	129477	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821_116101_129446
935174	contig_8138_pilon	+	1708	4	Intergenic	novelGene_52437	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_3	503.483862700683	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCCCTATTTCTGATGATGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280093	307459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280331_288507_288616_304973_305098_306220
935175	contig_3627_pilon	+	2028	10	Intergenic	novelGene_78581	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	11	junction_4	36.2525435463534	1	108	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	555	1668	121	1788	1315436	1343837	FALSE	15	TCAGGGTTTGTTCTTGGTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KAEYLKRYLSGADLGVDGVPESGRKRRKKRPKPGGVAGKGMRIVDDDVSWTAISTTKPEKEEEEDDGDLPVVAEFVDERPQEVKQMEAFRSSDKWKLLGGHSEDLASHRHFRHDTSDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDTPDSSPPRRVRHDSPDPSPPRRIRHDSPDPSTPRRVRHDSSDISPPRRTRHDFPDPSPPRKPPRNSSDVSPRKARHDSPDPSPPRRARHDSSDISPPRRARHDSPNLSANAPHSLPRTKSSKAPERGSSRSSPHRKGPGPSHSSLPKNSKRSSPSHRKFHLSSSPRRHQGHTLDSSSYPSNSWKASDSDLSPPRHKHKQSPGHQDSGSDLSPPRNRPRHRSSDSDLSPPRRKQRTKSSDSDLSPPRRSQPSGKKAARMFSGAKTGLVLTDIQREQQELKKRDQEAMEFKAEFQYAETVFRDKSGRKRNLKLERLEQRRKAEKDTERDELYAQWGKGLAQSRQQQQNVEDTMKEMQKPLARYIDDEDLDRMLREQEREGDPMANFIKKNKAKENKNKKVRPRYSGPAPPPNRFNIWPGYRWDGVDRSNGFEQKRFARLASKKAVEELAYKWSVEDM	1313533	1344077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3627_pilon_+_1313653_1315434_1315529_1319935_1320021_1322849_1323423_1324677_1324989_1327429_1327536_1327916_1328056_1328374_1328560_1328799_1328882_1343743
935176	contig_854_pilon	+	765	6	Intergenic	novelGene_36299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_5	2338.45612317187	1	26	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	71	517	556108	562402	TRUE	20	CTCATGTTACTGCAGTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	545943	563275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
935177	contig_16185_pilon	-	2290	12	Intergenic	novelGene_144739	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	105.592229866901	1	114	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	324	975	123	1097	127403	87233	TRUE	15	CGTTGGTATCAATCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METSSDCTISESPQEQEAAVEHSEEKTLQEGVQPEEFVAIADYSATDETQLSFLRGEKILILRQTTADWWWGERAGCCGYVPANHVGKHWEEDDPEDTWQDEEYFGSYGTLKLHLEMLADQPRTTKYHNVILQNKDSLKDKVILDVGCGTGIISLFCAHHAQPRAVYAVEASEMAQHTGQLVLQNGFADTITVFQQKVEDVVLPEKVDVLVSEWMGTCLLFEFMIESILYARDMWLKEDGIIWPTTAALHLVPCSADRDYHSKVLFWDNAYEFNLSALKSLAIKEFFSKPKYNHILKPEDCLSEPCTILQLDMRTVQISDLELV	134385	81715	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16185_pilon_-_82419_83278_83451_86018_86156_87051_87242_87641_87772_96623_96800_104048_104214_105305_105468_110481_110665_111387_111499_127364_127464_134323
935178	contig_6445_pilon	-	2166	17	Intergenic	novelGene_76941	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_14	790.14763009437	1	108	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	428	1287	654	1940	91325	43105	FALSE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPLLPPPVLLTPDKMSSKASVVLAYSGGLDTSCILVWLKEQGYDVIAYLANIGQKEDFEEARKKALKLGAKKVYIEDVSEEFVEEFIWPAIQSGALYEDRYLLGTSLARPCIARKQVEIAQREGAKYVSHGATGKGNDQVRFELTCYSLAPQIKVIAPWRMPEFYNRFKGRNDLMEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96391	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85477_88146_88216_88473_88584_91282_91841_95931_95985_96306
935179	contig_15118_pilon	+	2315	9	Intergenic	novelGene_74611	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	275.899777999186	1	111	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	920	1690	393544	398743	FALSE	15	GCCATGTTCATTGGTTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTDPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	391998	399368	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392547_392644_392970_393415_393680_393942_393991_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
935180	contig_7457_pilon	+	948	1	Intergenic	novelGene_31630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	42	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CCCCTTCCGGCTGCTGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	955570	956518	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_+_955600_956500
935181	contig_12019_pilon	-	755	3	Intergenic	novelGene_87662	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	58	1181	8	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AGGAGAGAAAACGAAGAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8659	5116	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12019_pilon_-_5400_6114_6226_8298
935182	contig_16622_pilon	+	2237	8	Intergenic	novelGene_48478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	132	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1272	1607	115175	118876	TRUE	10	AGCTGGTCCCTGCTACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELALQLSMLGPQGPPVLLQSLVLGPPLFTLLLCQGQGPLIPIPVCSAVAALHSFSPPALSAVTLWPSAHSCFSGLPSPVAPFSSPKGSISGYRCTAGFLRISVCPSTCLH	111924	126403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_+_113038_113597_113741_115159_115294_115406_115561_118813_118883_125274_125399_125752_126120_126270
935183	contig_11512_pilon	+	2094	5	Intergenic	novelGene_43343	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	112	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGGCAGGGAGAGAAGCGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	554958	570090	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_+_556866_561325_561374_566275_566318_567757_567802_570037
935184	contig_610_pilon	+	1515	1	Intergenic	novelGene_76767	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GAGTTGTATCCAAGTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	227109	228624	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_227100_228600
935185	contig_13211_pilon	+	3387	1	Intergenic	novelGene_123150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	98	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	164	495	1207	1701	313983	314477	NA	10	GTTTGGCTTAGTTTTTCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MILGKFSVSSSSVILSVFSVFSPCSGIPITQKFLLLIVSHIILRVSSFFFVLFSEYSSNRVVSKCLSSILLILSSTISDLLLSPSVTLSIYEILLFIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSIFWPVFSMNLSAFSMNLCIFSTVLSAFSFNSWIILSI	312776	316163	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_312800_316200
935186	SIRV7	-	1224	2	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	112141	-324	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	46	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GAAGTGGAAGTGGTAGTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2597	1329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_2163_2206
935187	contig_14970_pilon	+	1312	1	Intergenic	novelGene_45096	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	62	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GGCAAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	231542	232854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_231500_232900
935188	contig_10437_pilon	+	1536	2	Intergenic	novelGene_38168	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGTCTTGTCTTGCCTTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	162327	163918	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_163736_163790
935189	contig_14925_pilon	-	1627	4	Intergenic	novelGene_55341	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	112.961153598138	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	36	449	116065	114666	TRUE	5	GTGCACTTGCCTTTGGCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	116100	112099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821
935190	contig_20641_pilon	+	2313	7	Intergenic	novelGene_52825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	69	junction_6	1301.4167920642	2	102	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	302	909	63	971	14599	85306	FALSE	45	AATTATGAAACCAGATGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APSALQLLAHFLQPFSAAANMGPWPRLLLAALLLLLAGVGMVLCDTPANCTYPDLLGTWVFEVGPGSSNRDVNCSAMGPPEKKVVVHLQKLDTAYDDLGNSGHFTIIYNQGFEIVLNDYKWFAFFKYKQEGSRVTSYCQETMPGWVHDVLGRNWACFTGRKLGTTSEYVSVNAAHLENLQEMYSNRLYKYDPNFVKAINAIQKSWTATTYMEYETLSLRDMIRRSGGHSQGIPRPKPAPVNNEIQQKILHLPASWDWRNVHGINFVSPVRNQASCGSCYSFASMGMLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGVPWTS	14536	86648	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_16769_16916_38522_38690_41462_41619_45848_45965_54835_54968_85286
935191	contig_3956_pilon	+	2538	15	Intergenic	novelGene_14923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1331.89436403146	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	579	1740	586	2325	1284252	1290491	FALSE	15	CCGCGGAAATGGCCTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290704	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1284000_1284170_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286595_1287505_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935192	contig_7963_pilon	+	538	3	Intergenic	novelGene_58405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1808.5	2	27	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	5	352	51450	63047	FALSE	20	CTGGTGTGTATATAATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RMFQIKDIILRTLALISLLSLQRAGAIKADHVSTYEKFVQTYSPSGEYMFELDEDEMFYVDLDKKETVWHLPEFGRAFSFDAQGGLADLAILKSNLKIMIQRSNHTQATNEDLRDI	51445	63233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_51532_56717_56964_63027
935193	contig_3081_pilon	+	4740	2	Intergenic	novelGene_133920	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	7	147	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	2518	2901	181955	182338	FALSE	5	CTGATCCTTTTTTTGTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWSILENIPCALEKNVYFAAVEYRVLYLPVRSSWLIVPFRSSVSLLSFFLDVLSFTKSGVSKSPTIIVELSIPLFNAVRVCFMYFGACHWVRRCLLWYIFMMDCHLNQCIVSFFVFYGRFCFKVCFI	179328	184177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_181128_181236
935194	contig_4604_pilon	-	2836	12	Intergenic	novelGene_19157	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAAAATGACTGTTCCTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	381082	364565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_364634_365238_365454_367055_367196_367287_367451_372054_372163_372785_372961_373587_373701_374804_374940_377381_377527_378438_378604_379334_379468_379806
935195	contig_10011_pilon	-	2005	7	Intergenic	novelGene_68108	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	175	528	1276	1803	332188	328311	TRUE	10	TGCACTTCCGATTCTGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEEVDLLFHLWRGGPWLRDGHCLGPGDFPDLANGLTQLLQPGHKELLLFLQKLAQLLHLMPNLLLLGFSLFRSWLSPYPPGISAPPQIFSTPSDAPAARSIYLEFQGDFLDGAHLVASVLLTQAADEADKLPVVLTEEQAGLLHVTLTRGRRLGAEAVQQLLLWERGLAPGATG	334158	326291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10011_pilon_-_326402_328218_328541_328978_329060_330806_330940_332104_332219_332399_332480_332993
935196	contig_233_pilon	-	1901	11	Intergenic	novelGene_14656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1333.2667587546	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	473	1422	117	1538	108727	78579	FALSE	35	TAAAACTCCATTCCATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVNQPGQDRSLTCPNPPRTRSTCRECVELGPGCAWCQKMNFTGLGEPDSVRCNTRQQLLMKGCPANDIVDPRSLAEAQDNLAGAGKQLSPQSVKLYLRPGQAAMFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	126988	78215	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92294_101688_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107472_108401_108583_108724_108780_126924
935197	contig_233_pilon	+	2079	11	Intergenic	novelGene_14630	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	99	300	331	630	78477	91539	TRUE	30	AGGAGCCAAAGCCTGAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRGAGLRPMLEETWFAGAPIWLFLLAVVFFKCSLTLGKLGVHDRGGGTLEKGVIIVPLGLELLLLESLVLPEVAQVGQGLPDAQQEDADQHDPCHLYS	78146	105691	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78641_78973_79099_91528_91687_92165_92359_93764_94003_94742_94914_98310_98454_99781_99870_101673_101769_104151_104288_105453
935198	contig_408_pilon	-	1605	2	Intergenic	novelGene_84918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTACCCTCAAGAAACGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133433	131747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_131874_131954
935199	contig_17144_pilon	+	1970	10	Intergenic	novelGene_29514	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	59	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1654	1965	173658	174912	FALSE	5	CGGTCCTGGCTCCCACTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSESTDSLAGLGPPQGWGPGSPVWGAPVSRGLWDESTFVGTSWSPVHSLPAPRRPDSGTTVGVFVGWSSDFAWPQAHIPEWAPLGSGICPGKLFRVKLVGR	166082	174917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166861_168248_168310_168996_169099_170744_170933_172527_172742_173130_173211_173306_173463_173583_173751_174572_174759_174879
935200	contig_9313_pilon	+	3643	4	Intergenic	novelGene_86476	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	809	junction_1	766.050041881512	1	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	122	445	387329	461613	FALSE	45	AAGATATTCTGAAAATGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLPRRECSAGRWRLLGGFCLCVRTSLKPLEAEGRPGRGERMVIRVFIASSSGFVAIKKKQQDVVRFLEANKIEFEEVDITMSEEQRQWMYKNIPPEKKPAQGNPLPPQIFNDDRYCGDYDTFFESKESNTVFSFLGLKPRLASTAET	387207	464811	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9313_pilon_+_387374_432396_432583_457278_457360_461601
935201	contig_15407_pilon	+	3339	3	Intergenic	novelGene_123047	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	169	510	484	993	333130	333639	TRUE	50	TCCACAAACAAAAGGAATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEEKIETTLGALIHGINTIQTISNNAQAPEERLDKWELLKIKHLCSSKDFTKRVKRQPTDWEKIFGYDRSNQHLMSKIYKILQNLNNKKTNNPIKKCAKHKNRHFAKEDIQAANRHVKKCSQSLAIREMQIKTTMRYHLIQTRLASIQKTQNNKCWRGCGETATLIHCW	332646	375170	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15407_pilon_+_334996_373659_373751_374271
935202	contig_5988_pilon	-	1528	3	Intergenic	novelGene_15915	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	998	junction_2	624	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	104	1354	653670	651962	FALSE	5	GGTTTTTGACTCCTGTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLISQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRSIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY	653773	651787	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_652943_653272_653422_653549
935203	contig_5797_pilon	+	2128	1	Intergenic	novelGene_56957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AGACAAAAACAGAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	378691	380819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5797_pilon_+_378700_380800
935204	contig_13740_pilon	-	1547	10	Intergenic	novelGene_34702	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	4014.55634742703	2	43	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	329	990	167	1156	165243	157474	FALSE	45	AAAAAATGCCTTTGAGACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGQGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGNYGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165409	157082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158394_158640_158721_160067_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162031_165237
935205	contig_3986_pilon	-	2130	7	Intergenic	novelGene_52687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	86.4150192707006	1	79	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	214	936	47670	35282	FALSE	20	GTCACGTGAGTCTGATATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYYISPRITFPSLQDLVQHYSKKGDGLCQRLTLPCVSLALQNPWVQDEWEIPRQSLKLVRKLGSGQFGEVWMGYYKNNVKVAIKTLKEGTMSPEAFLGEANMMKTLQHERLVRLYAVITKEPIYIVTEYMARDEGSRLSLPRLIDMSAQIAEGMAYIEQRNSIHRDLRAANILVSETLCCKIADFGLARIIDSEYTAQEGAKFPIKWTAPEAIHFGVFTIKADVWSFGILLMEIVTYGRVPYPGMSNPEVIRSLERGYRMPRPDLCPPELYSGIISECWRSRPEERPTFEFLQSVLEDFYTATERQYELQP	48316	34087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3986_pilon_-_35488_39678_39811_41346_41498_44833_44884_46118_46299_47666_47820_48252
935206	contig_5623_pilon	-	1685	10	Intergenic	novelGene_154849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	343.206449045857	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	594	1241	210793	207845	FALSE	5	GGTGCCCCCAGGCTGCCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLQMIQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKEGI	220905	207400	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207857_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210210_210728_210808_211004_211108_217968_218140_218220_218450_220829
935208	contig_19775_pilon	+	1499	1	Intergenic	novelGene_147745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	50	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	140	420	1079	1498	184005	184424	NA	35	GTCTTATAACACGGAGGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQIKPTMRYHLTPTRLALIQKTQNNKHWRGCRETGTLTHCCWECKMVRSRWKSIWRFLKKLEIGVPYDPAIPLLGIYPREIRAVTQVDICTPVFIAAPFTIAKRWKQPRGPSIEEWIHKLWYIHTMEYYTTIKNNDEAVK	182926	184425	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19775_pilon_+_182900_184400
935209	contig_10225_pilon	+	2073	13	Intergenic	novelGene_86815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	495.736236991676	1	90	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	965	1960	41486	47636	FALSE	20	TGATCCTAGACTTGACTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNISCPEVLALPAAHTDYMPLWVYGVITGVAILLVSSVILFVVCMTWRLPGSHHEKCGNNTKYTDVLSTADLTPPPLRPRKVWIVYSADHPLYVDVVLKFAQFLLTVCGTEVALDLLEEQVISEVGVMTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20700	47749	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40973_41053_41437_41523_42611_42726_45216_45259_46110_46679_47401
935210	contig_7627_pilon	+	1459	1	Intergenic	novelGene_175555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	75	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	713	1078	2221	2586	NA	0	GGCTGTTTTGTCTCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	1508	2967	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7627_pilon_+_1500_3000
935211	contig_4091_pilon	+	1439	1	Intergenic	novelGene_173027	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	90	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	145	438	605	1042	13212	13649	NA	55	ACTTCAGCACCACAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAGEKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKSDGEIRSFPDKQKLREYVKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQLTGRI	12607	14046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4091_pilon_+_12600_14000
935212	contig_7025_pilon	-	2684	18	Intergenic	novelGene_104379	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	891.047297957427	1	157	15	FALSE	0	NA	NA	A	coding	296	891	81	971	95047	74021	TRUE	10	TATTTTGTCTTTCTTTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSNSSFKVFNFDSSTTSHSGLKSPSYMEKYLQKEEAKKDLDSQSNLHLPETKLPEFSKLKNNNDTEKANHIESVLKPNLPNVGNSDTGFTGLFKSSRYEPNMSFSGMSLSDTMTFRGSVQNKINPRPGKVVIYSEPEVSEDCIEVFSDIQDCSSWNLSPVILVRVVRGCWILYEKPNFEGHSIPLEEGELELSGLWGIEDNLERNDEAESAKPVVIGSIRHVDYRISQIDLFTEPEGLGLQNSYFDDTEEMQVFGIMQKTCSIKVHWGTWLIYEQAGFQGVPFILEPGEYPDLSLWDTEEAYIGSMRPLKMVKMKQNNMPLE	95127	49034	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7025_pilon_-_49328_54443_54607_58741_58901_59317_59442_59939_60080_62977_63108_65716_65830_66741_66775_66975_67103_72952_73103_73191_73319_73866_74025_76425_76585_85337_85478_88030_88191_90763_90883_90969_91018_94786
935213	contig_15092_pilon	+	2350	3	Intergenic	novelGene_57788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	283	1	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	462	911	325159	351050	FALSE	25	TCAGCCAACCTGCAACCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVQIAPLRAWDDFFPGSDRFARPDFRDISKWNNRVVSNLLYYQTNYLVVAAMMISVVGFLSPFNMMLGGVVVVLVFTGFVWAAHNKDILRRMKKQYPTAFVMAVLLASYFLISMFGGVMVFVFGITFPLLDVYPCVFETSELQEQAGE	324697	352489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_+_325335_348139_348356_350992
935214	contig_5686_pilon	+	2219	13	Intergenic	novelGene_45284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1826.55736443057	1	122	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	360	1083	841	1923	199843	211355	FALSE	15	CTCTGGGTCGTATAATGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKDNKHLEDQKLIDAASWTEITEGE	93823	211651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_93904_170215_170343_171643_171800_172507_172587_175535_175560_176667_176722_182638_182789_189033_189139_199777_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208722_211283
935215	contig_17144_pilon	-	1790	8	Intergenic	novelGene_29425	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2675.65817956583	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	430	936	174965	167588	TRUE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LKRRGEERQGGLVGAWLAAPAGVIHGPFSSTPGLAECGHISLSDSIVRLGDPVTASCVIGQNCNHLDPESEILWKLESELQPGGRQQRLPDGTRVSTITLPHLNHTQARLSCCILWGNSLQILDQVELQAGYPPPTPYNLSCLMNLTTNSFICQWEPGPDPHLPTNFTLKSFKSRGKCQTQEEPIQECVPEARQSHCSIQRKHLLLYQSLVVWVQAENALGTSLSPQMCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVSCPSALAHLPLWGCLALL	183220	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167328_167581_167643_173575_173751_174572_174761_174876_175001_175973_176306_183158
935216	contig_20819_pilon	+	2456	8	Intergenic	novelGene_55634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	404	junction_3	380.921010613133	1	73	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	449	1350	21	1370	29817	42531	FALSE	5	CCGGGCCTCTTATTCTTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLLPVLLTVAFGLATAVSAGPTVLECWFVEDVKGGGLDKRPAALVLRQGPGGPPPRPDLDPKLYLSVHDPAGALQAAFRRYPRDAPAPHCEMSSYVPLPASANWARGLTPEHSCPRALDGTWLMVSMSSPVLSLSSLLQPQPESQQEPVLITVATVVLTVLTYTPAPRIRLGQDAKLDLSFAYMPPSSEAATSLALGPPPFGLEWRRQHLGKGHLLLAATPGLGGQMPAAQEGAVTFTAWDDNEPWGPWTGNGTLQLPAVQPFQEGTYLATIHLPYLQVQVTLELAVYQPPKVSLMPAPLVWAAPGKAPPELVCLASHFYPSEGLEVEWELRGGPKGGSRKTEGQKWLSALRHHSDGSVSLSGHLQLPPATSEQHGTRYACRIHHPSLPASGRSAEVTLEVAGLSRPSLEDGIGLFLSAFLLLGLIKALGWVAAYQSTSKDSKEKKVQ	29796	43617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20819_pilon_+_29854_29983_30155_30381_30643_40122_40522_40867_41210_41309_41400_41530_41569_42519
935217	contig_5020_pilon	+	2328	8	Intergenic	novelGene_27829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	889.218413976624	31	23	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	309	930	470	1399	122915	125772	FALSE	30	CAGGAGCAAACTTCTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVGFKATDVPPTATVKFLGAGTAACIADLITFPLDTAKVRLQIQGESKGPVQAMATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118461	126701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119332_119596_122812_123041_123152_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
935218	contig_15112_pilon	-	2867	2	Intergenic	novelGene_124745	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	101	306	2338	2643	4062	3757	FALSE	25	ATTTTTTTAATGTGATACTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFILYPATLLNLSISSSRFLVESLGFSKYSVISSANRDSLTSSLPIWMPFISFSCLIALARTSRTMLNRSGDKGHPCLVPVFKGNVFSLSPLRMMLAVGFA	11547	3532	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15112_pilon_-_5582_10729
935219	contig_6898_pilon	+	2371	3	Intergenic	novelGene_35780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1755.5	1	111	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	41	376	124837	125646	TRUE	30	AATACTTTACTGTGACTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	124796	127697	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_126247_126302
935220	contig_14353_pilon	-	850	1	Intergenic	novelGene_82109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	37	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGGAATTAAAGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80682	79832	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_79800_80700
935221	contig_20527_pilon	+	2240	7	Intergenic	novelGene_138562	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1226.75825065722	1	83	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	208	627	713	1339	13527	27453	TRUE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVVALSVIIVERKQEPVLDVSVCAACPESWIGFRGKCYYFSEETRNWTFSQTFCASMEASLAQFEILEELNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTDGTEHNNSFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	12814	37343	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_25023_25434_25614_26238_26346_27308_27471_36171_36243_36530
935222	contig_1244_pilon	+	1506	9	Intergenic	novelGene_37987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	58	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	914	1279	924591	928810	TRUE	40	ACTCCCCACAAACAAGATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSRNDFLSPSNWIFCGPFSFLLACILSSFSDDKHRAKTASPIRVTGTPYSRAEIAVHLPVPFCPALSLIFGSRCLPSVSRNLRILAVISIRNESSSVLFHSSNAYAISLWSMPRTSFIKW	922784	933807	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1244_pilon_+_923330_923428_923549_923717_923810_924199_924348_924582_924714_927035_927231_928762_928900_931621_931690_933737
935223	contig_7119_pilon	+	2140	4	Intergenic	novelGene_40902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	413.321505207105	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	149	450	1009	1458	139776	140225	FALSE	20	GGCCTGGTATAGCGCAGGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127458	140907	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_138855_139177
935224	contig_11338_pilon	-	2042	9	Intergenic	novelGene_6340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	81	junction_4	299.192637568173	1	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	131	396	300	695	319426	307334	TRUE	65	CAAAAAGAAAAGGCAATGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGGRPRADCDHLHGARPLSPLPSSGGPHLCPV	323315	294421	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_300825_300893_306727_306964_307230_307429_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
935225	SIRV7	-	2020	5	NNC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	105	-17	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	121	3	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AACCTATTCTTCCAAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147813	1022	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV7_-_1135_1416_2676_2993_3130_114680_114989_147608
935226	contig_17976_pilon	+	2628	4	Intergenic	novelGene_32465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	4	98	junction_3	1173.59542527322	1	149	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	849	269	1117	41843	47385	FALSE	35	AAGTTGGTTGAAGCCAATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEDSARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41574	48896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46443_46742_46909
935227	contig_854_pilon	+	4031	23	Intergenic	novelGene_36623	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3936.97932409444	1	103	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	671	2016	1259	3274	1701301	1715249	FALSE	30	TGATAGAATTCCAAGTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKKQKKFDQLLAEEKTISAKYAEERDRAEAEAREKETKALSLARALEEAMEQKAELERLNKQFRTEMEDLMSSKDDVGKSVHELEKSKRALEQQMEEMKTQLEELEDELQATEDAKLRLEVNLQAMKAQFERDLQGRDEQSEEKKKQLVRQVREMEAELEDERKQRSMAMAARKKLEMDLKDLEAHIDSANKNRDEAIKQLRKLQAQMKDCMRELEDTRASREEILAQAKENEKKLKSMEAEMIQLQEELAAAERAKRQAQQERDELADEIANSSGKGALALEEKRRLEARNLIPKSQGPGPRPGKE	1692686	1716006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1692794_1693134_1693232_1694454_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699038_1700788_1700913_1701177_1701348_1701990_1702204_1702545_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748_1706998_1709122_1709336_1709508_1709722_1709991_1710154_1710542_1710672_1711566_1711656_1711754_1711795_1715198
935229	contig_16103_pilon	-	1938	7	Intergenic	novelGene_118878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	3765.38491466086	1	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	219	660	65	724	743628	723597	FALSE	20	CTTCTGGGGGCCAACGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGITTIEAVKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAESRCREMDEQIRLMDQSLKCLSAAEEKYSQKEDKYEEEIKILNKLKCTKEEHLCTQRMLDQTLLDLNEM	743692	722382	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733559_733606_734953_735030_735661_735733_735856_735975_737495_737630_743496
935230	contig_12079_pilon	+	2505	3	Intergenic	novelGene_67532	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	103	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	TGACACAAAACGAAACTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860605	864868	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_862632_863468_863581_864501
935231	contig_13899_pilon	-	1881	1	Intergenic	novelGene_165575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	122	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AAGAGTGGTCTTCATGGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	59866	57985	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13899_pilon_-_58000_59900
935232	scaffold_12124_pilon	-	3033	9	Intergenic	novelGene_22363	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	27	17	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	2192	2527	1508404	1508069	TRUE	80	CCTAAAAAAAAAAAAAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCPWQTAEVRLLTQL	1510595	1486529	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1486561_1489029_1489074_1490361_1490408_1491904_1491974_1494268_1494314_1496346_1496387_1497005_1497121_1506628_1506684_1508007
935233	contig_6958_pilon	-	1687	5	Intergenic	novelGene_69942	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	337.609982079914	1	105	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	150	896	183238	149618	TRUE	25	AGCCCTTTTGTAAACGGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLKPLKDAINSCLHEIHSKDGSLQQIKENQLVVLATTTTDLGVTTSVPEMPIMEKILQKFSSMHKAYSPEKKIAVLLKTCKLIYDSMALGNPGKLYGADDFLPVLMYVLARSNITEMLLDVEYMMELMDPALQLGEGSYYLTTTYGALEHIKNYDKITVTRQLSVEVQDSIHRWERRRTLNKARASRSSVQDFICVSYLEPEQQSRTLASRADTLAQALCEQCAEKFEVAQPQDHRLFVLVDGRCFQLADEALPHHIKGYLLRSEPKRDFHFVYRPLDGGGGSGSPPCLVVQEPNFL	183387	148598	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6958_pilon_-_148618_148845_149939_154425_154590_160928_161061_183108
935234	contig_5846_pilon	+	966	1	Intergenic	novelGene_178905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	CAAATAGAAAAACAATTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723219	724185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5846_pilon_+_723200_724200
935235	scaffold_12124_pilon	+	2085	8	Intergenic	novelGene_22278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2298.26166784323	1	109	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1264	1914	1508755	1509405	FALSE	35	ACTTGACTGGAAATTATATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473576	1509576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473673_1489013_1489126_1491920_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
935236	contig_610_pilon	-	1899	7	Intergenic	novelGene_76846	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1118	1573	363972	361078	FALSE	40	TGCAGAGACAGAAGAGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSGPAIAGSRQSLLIMDVLNIQTTFSMSRLTGTVRDRVTDSPSVPTTVSPTVRPLEALRSTQNCWAWIGLEVLWLTGFLAVQVYATSGSQGIQEMVRVELSKDLKEWVSTQVQLYRTLFSALSTEHTRVRLQEVLSDMVCFTVTRGFCNCS	376072	360751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_361082_363028_363298_363789_364137_366343_366595_368137_368279_374080_374155_375585
935237	contig_17144_pilon	-	1754	11	Intergenic	novelGene_29526	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2628.47557530976	1	79	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	882	1475	173640	166363	FALSE	25	TTTCTTTCTTAAGAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGKVGWQAPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183232	166083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166432_172508_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173724_174568_174758_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183184
935238	contig_6102_pilon	+	1795	8	Intergenic	novelGene_31849	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	408.008003122788	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	325	978	70	1047	370803	394507	FALSE	20	CTCAAACCAGCTGTGGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAAVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	370733	395255	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371117_393066_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
935239	contig_6047_pilon	+	2670	18	Intergenic	novelGene_24211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	600.676003266032	1	164	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	645	1938	482	2419	109227	123624	FALSE	25	CCCAAATACCCAGTGTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTREELVKNLGTIAKSGTSEFLNKMTEAQEDSQSTSELIGQFGVGFYSAFLVADKVIVTSKHNNDTQHIWESDSNEFSIIADPRGNTLGRGTTITLVLKEEASDYLELDTIKNLVKKYSQFINFPIYVWSSKTETVEEPVEEEESAKEEKEESDDEAAVEEEDEEKKPKTKKVEKTVWDWELMNDIKPIWQRPSKEVEEDEYKAFYKSFSKESEDPMGYIHFTAEGEVTFKSILFVPTAAPRGLFDEYGSKKSDYIKLYVRRVFITDDFHDMMPKYLNFIKGVVDSDDLPLNVSRETLQQHKLLKVIRKKLVRKTLDMIKKIADEKYNDTFWKEFGTNIKLGVIEDHSNRTRLAKLLRFQSSHHATDLTSLDQYVERMKEKQDKIYFMAGSSRKEAESSPFVERLLKKGYEVIYLTEPVDEYCIQALPEFDGKRFQNVAKEGVKFDESEKTKENREAIEKEFEPLLNWMKDKALKDKKIEKAVVSQRLTESPCALVASQYGWSGNMERIMKAQAYQTGKDISTNYYASQKKTFEINPRHPLIRDMLRRVKEDEDDQTVSDLAVVLFETATLRSGYLLPDTKAYGDRIERMLHIVHKVEEEPEEEPEDTTEDTTEDTEQDEEEMDAGTDEEEQETTKQSTAEKDEL	105196	123875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6047_pilon_+_105270_106266_106370_107150_107302_107820_107927_109178_109511_114652_114765_115034_115155_115886_116004_117940_118079_118160_118239_118356_118423_119278_119549_119762_120009_120536_120677_122420_122500_122584_122709_122967_123102_123594
935240	contig_5021_pilon	+	1621	1	Intergenic	novelGene_167109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGTTCAAGGTTTGAGTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	576239	577860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5021_pilon_+_576200_577900
935241	contig_15087_pilon	-	1248	9	Intergenic	novelGene_37161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	389.414544540904	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	1	366	52628	41823	TRUE	25	TGCCAATGCCACCCACAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KQVTDLEGEREQKQRDFDRKLLLAKSKIETEEADKEKLTAEAKELRQKVKYLQDQLSPLTQQREYQEKEIQRLNKALEEALSLQTSPSSPPAAFGSPEGAGGLLRKQELVTQNELLKQQDL	52628	33531	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15087_pilon_-_33838_34004_34121_38965_39056_40455_40648_41127_41194_41710_41832_42914_43047_49137_49267_52532
935242	SIRV4	-	701	1	Antisense	novelGene_SIRV4C_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	31	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGCGACTGGCATGCAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3401	2700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Antisense_SIRV4_-_2700_3400
935243	contig_12729_pilon	-	1633	1	Intergenic	novelGene_149934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	32	34	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	137	414	43	456	117766	117353	NA	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KNTGNNKCWRGCGEMGTLMHCWWECKMIQPLWKMIWRFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPMFMAALFTIAKQWKQRRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYATRKNNNESVNHRITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLL	117808	116175	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12729_pilon_-_116200_117800
935244	contig_9706_pilon	-	1450	1	Intergenic	novelGene_20755	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCAAAGTGGTCAATGAACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1588	138	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_-_100_1600
935245	contig_12677_pilon	-	1740	1	Intergenic	novelGene_110676	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	2	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1741	1	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_0_1700
935246	contig_233_pilon	-	2818	16	Intergenic	novelGene_14512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_3	1459.97229197452	1	151	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	525	1578	407	1984	107460	91635	TRUE	5	GCTGGGCTCTGTGACCTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYLLCRVPEIPKGPL	126955	78135	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92140_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107467_108389_108583_108724_108814_109914_109976_126898
935247	contig_15114_pilon	-	1745	7	Intergenic	novelGene_121129	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	193.698003775637	1	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	347	1044	110	1153	123696	100551	FALSE	25	TCTGTACGTGTTCATAAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AVAPVAGSPSQQRRGHGADSRDLAGRLPAADSTALGMVPPPENVRMHSVNLKNVLQWEPPAFPEGNLTYTAQFQSYNSFQDKCKYTTLTECDFSSLSKYGDHTLRVRTEFADEHSDWVNITFCPVDDTIIGPPGIQVEALADSLHMRFLAPKVVDEPETWTMKNFYTLWVYNVQYWKNGTDEKFQITAPYDFEVLRNLELWATYCVQVQGFLPDLNKTGEWSQPVCEQTTDDETTPSWIIAIILIASVFMVFLLLLGCLALVWYIYKKTKYTFAPGNSLPQHLKEFLSRPHHSALLFFSLPPSGEDEVFDKLSVITADLESSKQSPGDICSLGASSQQESLQPVSEEGTQATGHSDPPHLSRLPLRGTRAPNKGREPLSKPQL	125308	99958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15114_pilon_-_100848_106815_106974_109493_109642_112541_112709_115280_115439_123580_123710_125212
935248	contig_9609_pilon	-	1567	1	Intergenic	novelGene_23016	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	91	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	ACTTACCGAAGGAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319740	318173	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_318200_319700
935249	contig_8057_pilon	-	1042	1	Intergenic	novelGene_176642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTATTTTTTTGCTATGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	94092	93050	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8057_pilon_-_93000_94100
935250	contig_14441_pilon	+	984	5	Intergenic	novelGene_100622	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.931197470413	6	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	370	798	116728	117610	FALSE	15	CTACGAGTGTCTCATTTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111215	117796	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_112109_112154_116578_116963_117220_117344_117539
935251	contig_9484_pilon	+	1852	12	Intergenic	novelGene_105612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	547.038382323889	2	108	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	427	1284	64	1347	95848	103511	TRUE	15	TTTTCTGTAGTTAGTGTGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCPSQSGSCCCTAAVRGEVAEMLSVRVAAAVARALPRRAGLVSRNAFGSSFIAARNLHASNTCLQKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKNRRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVVP	95784	105108	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9484_pilon_+_95908_97148_97228_98440_98611_100389_100564_100655_100823_101231_101369_101603_101756_101854_102080_103265_103377_103502_103641_104260_104412_104883
935253	contig_11512_pilon	-	2091	8	Intergenic	novelGene_43382	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1434.1176338624	1	64	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGATATTTGTATTTATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	581696	555004	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_556126_556226_556866_566278_566315_567751_567800_570036_570089_576895_576953_580068_580156_581645
935254	contig_6102_pilon	+	2124	14	Intergenic	novelGene_31922	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	427.876330084002	2	118	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	283	852	519	1370	380930	394507	FALSE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLSLWETLPIKPRLFPRLQPLSGMRVQPFSSRNQTLRAWSCRFGARGAGTLGSLSLPLSELLVADQLCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVQLDLAEIDLSQGAAQWYDLVDDKDKGSS	379420	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_379487_379617_379795_379955_380041_380160_380210_380525_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394272_394467
935255	contig_511_pilon	+	1209	1	Intergenic	novelGene_132727	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	GACACAATAAGCAAACATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	43874	45083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_511_pilon_+_43900_45100
935256	contig_15666_pilon	-	1897	6	Intergenic	novelGene_70164	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	426.971942872128	1	77	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	143	432	122	553	110619	109279	TRUE	10	TGTTGCTTTGATTCATTCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAIPLSFRYQLAVEYVLGKPQKASLKGRIKEQIS	110740	107145	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107952_108118_108198_108579_108859_109098_109378_109973_110246_110558
935257	contig_4783_pilon	+	4368	2	Intergenic	novelGene_108435	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	404	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	156	467	464143	464454	TRUE	20	CATTTTATTGATGGGGAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRTGIIQGCPLSPLLFNIVLEVLARATRQEKEIKGIQIGNEEVKLSLFADDMILYIENPKDSTRNLLELTERFSRVAEYKINIQKSVGFLYTNKENDEKEIRKTIPFIIAPKKIKYSGINLTRDVKTSTEKTTKHYCMKPKGIYINGKTYHAHG	463987	469565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4783_pilon_+_467721_468930
935258	contig_3410_pilon	-	2268	3	Intergenic	novelGene_58910	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	121	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACACGTTGAGCCTTGGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29805	13690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3410_pilon_-_15682_19446_19647_29728
935259	contig_10126_pilon	-	1835	1	Intergenic	novelGene_105703	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	100	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GGAGAGGTGAAAGACTATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	44339	42504	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10126_pilon_-_42500_44300
935260	contig_17144_pilon	-	1725	11	Intergenic	novelGene_29369	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2647.97387449348	1	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	935	1642	173640	166152	FALSE	15	ATTCTTGAGTGTGCCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183233	166068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166395_172559_172731_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174568_174761_174880_175001_175973_176271_179700_179786_181794_181850_183158
935261	contig_3747_pilon	+	1631	8	Intergenic	novelGene_24867	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	7595	junction_7	1620.19026345547	1	44	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	391	1176	272	1447	201313	203804	FALSE	15	GGGCAGCGCCAGTGTTGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVMFKKIKSFEVIFNDPEKVYGSGEKVAGRVIVEVCEVTRVKAVRVLACGVAKVLWMQGSQQCKQTLDYLRYEDTLLLEDQPTGENEMVIMRPGNKYEYKFGFELPQGPLGTSFKGKYGCVDYWVKAFLDRPSQPTQETKKNFEVMDLVDVNTPDLMAPVSAKKEKKVSCMFIPDGRVSVSARIDRKGFCEGDEISIHADFENTCSRIVVPKAAIVARHTYLANGQTKVLTQKLSSVRGNHIISGTCASWRGKSLRVQKIRPSILGCNILRVEYALLIYVSVPGSKKVILDLPLVIGSRSGLSSRTSSMASQTSSEMSWVDLNIPDTPEAPPCYMDIIPEDHRLESPTTPLLDDVDSSQDSPIFMYAPEFKFMPPPTYTEVDPCIVNNNVQ	201041	203988	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_+_201563_202132_202206_202309_202458_202636_202740_202870_203128_203228_203386_203498_203651_203768
935262	contig_11338_pilon	-	1654	11	Intergenic	novelGene_6371	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	270.042218921412	1	74	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	299	946	319426	300286	TRUE	15	TAGATTTCTTCATTTCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTGAVHHHRWCLTLPLPGCLRLDAAGGPPPFPHCEKPDSGQLLQHEKTHEEAHVPCGLRSPSLDRGNFCSIQTSSLWNICPLLASPRKGIYMELPWTSLFLSDDLLDFEKQTLVPQQ	323314	294958	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300344_300839_300893_306727_306964_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
935263	contig_11088_pilon	+	556	2	Intergenic	novelGene_85049	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3183	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGAGAAGTTTTCTGACCTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	14663	17402	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11088_pilon_+_14937_17119
935264	contig_1452_pilon	+	1899	3	Intergenic	novelGene_115159	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	AGAGCAATAATTGCAAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	698308	715332	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_+_699952_700533_700690_715232
935265	contig_854_pilon	-	1618	3	Intergenic	novelGene_36728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGAGACAGGTGGCCAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1716388	1713306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1713477_1714856_1715332_1715415
935266	contig_14925_pilon	-	1667	5	Intergenic	novelGene_55295	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	895.406716246868	3	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	79	522	116065	113240	FALSE	10	CTTGCCTTTGGCTTGATTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLIFGKGTHVTVEPKSQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFLLTGMRMLHPLK	129479	112094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114672_114779_115150_115208_115821_116101_129436
935267	contig_12837_pilon	+	939	5	Intergenic	novelGene_57331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3497	junction_1	2162.7321118206	4	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	20	352	154005	166049	FALSE	45	AGAGAATGGAAATTGGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HWQATIMGPNDSPYQGGVFFLTIHFPTDYPFKPPKVAFTTRIYHPNINSNGSICLDILRSQWSPALTISKVLLSICSLLCDPNPDDPLVPEIARIYKTDRDKYNRISREWTQKYAM	153985	166636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12837_pilon_+_154014_159321_159400_161387_161494_163874_163969_166003
935268	contig_13145_pilon	+	2063	8	Intergenic	novelGene_116617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1357.60324521878	1	104	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	77	913	35323	57392	FALSE	55	GGTAAAGTAAAATAGTAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLLPRLLLLLLLLFPATLVLRGGPGAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLAEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFVVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTIIEREDGIFMYMFLAGLGLLVVVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSNQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE	35246	58542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13145_pilon_+_35402_37922_38027_41026_41115_43396_43660_46346_46409_47201_47281_48800_48895_57324
935269	contig_401_pilon	-	4439	19	Intergenic	novelGene_42926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	132	38	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGGGCATTTACGTGGTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1975740	1944951	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_-_1945310_1945464_1945593_1946389_1947080_1948358_1948493_1948787_1948908_1952091_1952240_1952522_1952651_1955784_1956011_1957521_1957646_1960854_1960950_1961072_1961162_1961319_1961402_1961680_1961761_1964449_1964544_1965464_1965583_1966090_1966203_1968751_1968846_1972806_1973760_1975074
935270	contig_1450_pilon	-	2833	21	Intergenic	novelGene_27372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	1456	2034	345771	332006	TRUE	5	ACTGCTGCTGCCTGGGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEQGLDLREGGCLIVLLPQHGLFAVRPDLMDGGLLPELLCQVVEPLQPPDLIQHPFLIALLCLFQAAPSVVNVLDHPALGGHESGPVAEPQLGLQCVEVDLQLALLLHLGRLVQAPVVTEVLQLLLHGLHGVLGHPVLQPWDGATDPLQQITGQLLIIFHELLILLVDGQHLADAIGCCLRTFWAPEKAW	355951	244359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_-_244530_308885_309003_315760_315877_322453_322541_324995_325084_325652_325732_329044_329127_331945_332038_339442_339534_340844_341074_342471_342621_345693_345846_346444_346552_347010_347142_348123_348207_348940_349077_350343_350524_351264_351404_352388_352469_354166_354328_355587
935271	contig_11338_pilon	-	1593	10	Intergenic	novelGene_6358	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	314.767443058961	1	66	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	251	756	299	1054	319426	295354	FALSE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVWASCRWAQLPRSWPISSPSSTACRVSSSFWCTASSVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298915_299024_315217_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
935272	contig_11720_pilon	-	1106	10	Intergenic	novelGene_43843	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TGCCCCGGGCAGGGGAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	98517	68054	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_-_68137_76924_76959_78406_78520_82236_82282_86224_86415_87069_87162_93131_93260_94958_95059_95381_95486_98299
935273	contig_11720_pilon	+	864	6	Intergenic	novelGene_43768	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1403.4143222869	1	51	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	256	315	78465	95325	TRUE	40	CTAAGTATTTGAGTTCAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAGRGPGLSVRRRRRLGRRVQASGASRRHDPAGGEQPHHRGDARAQVRERGRRCRNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADE	67762	98688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76920_76961_78408_78522_95322_95486_98299
935274	contig_7963_pilon	-	2165	9	Intergenic	novelGene_58478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	436	junction_8	477.728986324883	2	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	520	1956	125592	120628	TRUE	80	AGAAAAAGGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126111	120295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
935275	contig_4604_pilon	+	2401	9	Intergenic	novelGene_19171	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1186.1092316372	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	892	1608	373631	379856	TRUE	25	TGAAATGAATCTTGTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVEYSLSKGKGNKVSAEKVNKTHSVNGITEEADPTIYSGKVIRPLRSVDPTQTEYQGMIEIVEEGDMKGEVYPFGIVGMANKGDCLQKGESVKFQLCVLGQNAQTMAYNITPLRRATVECVKDQFGFINYEVGDSKKLFFHVKEVQDGVELQAGDEVEFSVILNQRTGKCSACNVWRVCEGPKAVAAPRPDRLVNRLKSTTLDDASAPRLMVLRQPRGPDNSMGFGAERKIRQAGVID	371489	380714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_372165_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808_380232_380296
935276	contig_10756_pilon	+	2965	2	Intergenic	novelGene_170658	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	982	1347	19917	20282	TRUE	50	GAAATAGTAAAGATCAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILVFCSCIIFLNSSSFLSVFSMNLSIFSSCLSAFCLSFWRILSIRGLNSLSGSSSAFSSRGESSGVLFWTPTGTILSCFCKCFLIVCCLRGIQ	18935	36515	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10756_pilon_+_20774_35388
935277	contig_5954_pilon	-	2884	8	Intergenic	novelGene_28788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1893.2121176585	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	212	979	1462068	1392942	FALSE	20	CACGCAGGAATTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELSAATQSPSISSSSFGAEPSAPGGGRSSGACPTLGAKSCSSSCADSFVSSSSSQPVSLFSTSQVHDLIFWRDVKKTGFVFGTTLIVLLSLAAFSVISVVSYLILALLSVTISFRVYKSVIQAVQKSEEGHPFKAYLDVDITLSSEAFHNYVNAAMVHINRALKLIIRLFLVEDLVDSLKLAVFMWLMTYVGAVFNGITLLILAELLVFSVPIVYEKYKTQIDHYVGMARDQTKSIVEKIQAKVPGIAKKKAE	1462279	1391036	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5954_pilon_-_1392988_1394690_1394750_1395552_1395600_1396503_1396574_1396997_1397137_1401500_1401709_1443844_1443902_1461926
935278	contig_7357_pilon	-	2379	9	Intergenic	novelGene_36827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2178.67958506408	1	109	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	410	1233	298	1530	166824	136424	FALSE	55	TAACAATGCTAATAAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAPGDARRWQLLLLLLAGLMHGASSVFVVKNGNGTACIMADFSATFLMNYDTKSGSKNLTLDLPPDAEVLNTSSCGKENTSDPSLMIAFGSGHTLTLNFTRNATRYGVQMLSFVYNLSDTDVFPNASSKGLKTVESTTDIRADIDKKYRCVSSNQIHMNNITMTLRDATIQAYLSSNNFSKEETHCKQDDISPTTAPPSPKPTTRPPPSPVPENPSVSKYNVSGNNGTCLLANMGIQLNITYEKNDNTTVTRVFNINPNDTKASGSCTSHSVVLELRGGVVTLLVFSFGMNASSSRFFLQEIQLNTTLPDAREPTFKAVNSSLRALQATVGNSYRCNAEESIQVTKAFSVNVFKVWVQAFKVEVEECQLDENNMLIPIAVGGALAGLVLVVLIAYLIGRKRSHAGYQTI	167121	135574	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7357_pilon_-_136564_137583_137737_137820_137888_138933_139060_139775_139973_154561_154721_154861_155079_159911_160034_166772
935280	scaffold_12124_pilon	+	2113	10	Intergenic	novelGene_22234	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	2097	junction_6	2721.06421174592	2	89	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	198	575	1490385	1508039	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473570	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
935281	contig_610_pilon	-	4441	1	Intergenic	novelGene_76656	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	69	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	101	306	109	414	32436	32131	NA	20	GCAATGTCTGAGACTCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSTSPHSSLSTLGKGILSLGQRQPHTRKTGLASRMGTACQPSISLCPGTFVLNQPNHTRWHGCKSCGSQSCRHTLQMRKSLSVRIRLPGHFSSGSSSEAK	32544	28103	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_-_28100_32500
935282	contig_12886_pilon	+	3199	1	Intergenic	novelGene_135538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	88	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	163	492	1142	1633	881241	881732	NA	30	GCTTCTTAAAAAAGTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNIRDLNSLSVRSSASSSTGRPCGVLFWTPTGTILSCVCKCFDIVCCLQGIQWLFSSFTDCRFACFILLFYLVMSEQVGCAFFVVCLSVGTILFTSFSNRQGQSLRYGTAGQVQLKGSFWNRLFVARTRADSADWQSVQGRFQ	880099	883298	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12886_pilon_+_880100_883300
935283	contig_11548_pilon	+	2146	11	Intergenic	novelGene_66728	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1342.43353652984	1	88	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	312	939	545	1483	101984	119638	FALSE	25	AGATCTGTCATAGGGCAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGLFEKRRFRKFLVYVANFDEKDPRTFEGIDPKKTTMRDVYKKFDLGQDVIDFTGHALALYRTDDYLDQSCCETINRIKLYSESLARYGKSPYLYPLYGLGELPQGFASAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	63629	120301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_63860_84701_84810_86979_87080_96086_96188_101978_102178_102442_102575_112809_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
935284	contig_13097_pilon	+	2422	2	Intergenic	novelGene_107681	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	GTAAAGATTACAGCCAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80346	82845	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13097_pilon_+_80505_80581
935285	contig_14441_pilon	-	1114	7	Intergenic	novelGene_100501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	70	213	167	379	126577	125875	TRUE	5	CCTCTCTCCCCTGCCCTGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AAHHFYWFIWFGFRAGSWISGKQRWSRCPCREARGERTLGEHRGDGEETQVRVQGMSFSGGQFGWVLSGSGVLFLGHGHQHEGTDQHSVQGRFPQQDLVEDSGRQDPPLVGNWAGGSLHGPRPRH	126743	95924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_-_96014_96126_96223_96304_96438_121177_121228_125507_125900_126157_126282_126513
935286	contig_2770_pilon	-	1561	6	Intergenic	novelGene_107461	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1807.35818254158	6	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	113	342	325	666	746670	743833	FALSE	30	AAAGTCGTGTTAAATGCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK	750775	742937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_-_743862_744034_744171_744572_744680_746600_746745_747765_747788_750547
935287	contig_16098_pilon	-	1316	9	Intergenic	novelGene_46051	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1201.25709545251	1	39	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	390	1173	57	1229	352350	348413	FALSE	80	AAGAAAAAATAATAATAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTIYSVDWSHDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVIAVSGQGDSSIRYFEITSEAPFLHFLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRGLDTGRRRATTDTSGTPSSDAVSRLEEEMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQTK	354113	348325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349231_349346_349493_350224_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_354058
935288	contig_8377_pilon	-	1985	17	Intergenic	novelGene_34924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.45236875482778	1	100	8	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCACTTGCTAGCTACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	179665	68078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68139_68219_68329_131430_131569_136289_136378_137708_137737_140773_140974_142255_142386_143449_143587_154873_154990_161224_161386_164385_164588_169243_169315_172907_173011_176557_176697_177247_177343_177428_177535_179563
935289	contig_15491_pilon	-	1627	4	Intergenic	novelGene_75955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	127	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCCCATTTGGGAGTGGGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	46977	31254	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15491_pilon_-_32436_37396_37550_38883_39079_46879
935290	contig_1452_pilon	-	1789	3	Intergenic	novelGene_115145	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1147.5	1	92	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	36	401	715391	699652	FALSE	75	AGAAAAAAAAAATTAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715426	698263	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699772_700602_700690_715232
935291	contig_3956_pilon	+	1916	10	Intergenic	novelGene_15148	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1308.86199746003	1	61	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	554	1665	53	1717	1281682	1290816	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1281629	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283954_1287466_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297_1290443_1290521
935292	contig_7119_pilon	-	1534	2	Intergenic	novelGene_40909	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	40	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	146	441	459	899	140491	140051	TRUE	40	CTGTGAAAGAAGGAAGCGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQVGRWRGSLCAEAAELEEEVCFQVLLGRRGLAAHSPRMGLPVQLLRRPPAPGGSKKARPVEEKSGVWVAPSGRQRDVAGQVLLLDAQGYGRKLCKVWSSASRDSPGSGFGSWVLALGRPPLAAAGLGPSPPSGSRDEMQTISEGE	140949	127458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127512_139468
935293	contig_854_pilon	+	1156	7	Intergenic	novelGene_36277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2719.8609288385	1	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	140	423	176	598	556108	562402	TRUE	30	ATCTGCCCAGCCAATCAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543545	563585	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543624_545916_545989_556082_556201_557001_557053_557591_557752_562283_562405_563029
935294	contig_8447_pilon	+	2070	2	Intergenic	novelGene_69428	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	94	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTTTTTTGCATTTTTGGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82254	84491	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8447_pilon_+_83608_83774
935295	contig_10323_pilon	+	3252	4	Intergenic	novelGene_123595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	112	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	1901	2515	459964	460578	TRUE	20	CCTGGTACATGAAGTTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLTLPQHLYGFLQGLAIFSSCFSSSWSLSSSVMCPRSPPVGCSFLHGFVSDLGVHFHSPPYLHLLADGCSWLLENKEWFGLLWVFHPLIQFCCLRHWAPYLLLHSESGPPWARLLPGWQVPSLSYTLCLGIQGHLLHDFHPDSLGLHYTLEDLRPLGPLAPQHELPLPHPHSLWGCHTARQCLYHLPFQRLVCAKEQIPDTVGC	458063	468687	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_461003_463314_463453_467386_467477_468602
935296	contig_6102_pilon	+	2311	16	Intergenic	novelGene_31900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	399.089875703317	1	91	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	210	633	77	709	373928	380445	TRUE	15	GCAGGCCATGAGCTGCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLSPQMGSSVDALPRPCHTTPDSHFGTENVLRIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVRKETGGGWSG	373673	394952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_373726_373903_373960_374383_374472_379408_379487_379617_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393856_393929_394036_394221_394272_394467
935297	contig_15449_pilon	-	3713	13	Intergenic	novelGene_33595	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	TAAGCAATTTTAGTCATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55646	36975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_38067_43214_43279_44648_44758_45010_45073_45573_45699_46861_46987_47159_47329_48211_48345_49036_49081_49185_49553_51103_51329_51808_51930_54568
935298	contig_3956_pilon	-	2438	11	Intergenic	novelGene_15247	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	13	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	327	984	794	1777	1289815	1286583	TRUE	20	CAGCCGTGGAGGCCAGACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLLGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLDGDTGVVLLQVLQADLQVQLASPRDDVLARLLDDALHHGVRLGQALQALHQLGQVGGVLGLHGNPDHRADAELHHAHVVGVLKGGDGACLHQELVDAHQAHNVPAWHILDGLHIATHHQDRSLDWLQV	1291014	1284734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1284863_1285065_1285171_1285710_1285825_1286082_1286223_1286408_1286604_1287274_1287533_1287965_1288075_1288872_1289227_1289491_1289675_1289756_1289891_1290296
935299	contig_9955_pilon	-	2898	4	Intergenic	novelGene_21306	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	477.915148210317	1	128	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	160	483	216	698	49317	47670	TRUE	40	ATAAATGCCATTGTTAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSNYVNDMWPGSPQEKEPPTTDHSSRLSSSRTSSRSSSRSSRSGISVSSRSSSRSRSLLRRRDRSRSRSRRRHQRNFRRYSRSYSRSRSRSRSRRYRERHYGSSGSYYRPSSRHRSRSRSRSRGTSYYRRAYALTRGRRSNGAVRNSKSQCSKSFRNSQP	49845	44905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_-_45360_45923_47737_48901_49380_49692
935300	contig_16622_pilon	-	1826	7	Intergenic	novelGene_48487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1407.04778604787	1	62	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	687	1079	115450	112684	FALSE	80	TTAAGAAAAAAAAAAACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQDQLKRSEEEKLTLVAKVQEMQRKMNTIL	121975	111936	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112707_112977_113041_113602_113739_115153_115292_115417_115454_118845_118884_121330
935302	contig_11574_pilon	+	2587	9	Intergenic	novelGene_64069	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	153	462	1533	1994	451502	452918	TRUE	65	TAAAAGGAAAACAAAATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIGLLENLEQELELLTGFTAAILRLLQLMGFLGSHQPMGKVHLILTKNLQISNLFIFNGERTGRKTAVRLLVTWFFRNFLLLTLEKPVFQAFSVAPDITEEIVGSGRSLTIIQGLLLGEPVLGVGAGYVRSLMTLGRFASKKPFTERDSCGAG	449197	456542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11574_pilon_+_449898_450252_450391_450807_451826_452780_452925_453433_453523_454080_454191_454477_454567_454747_454887_456382
935303	contig_15092_pilon	-	1427	3	Intergenic	novelGene_57814	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	47	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCTCTCGGCCTCGCGTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	352022	325157	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15092_pilon_-_325334_348138_348358_350990
935304	contig_10225_pilon	+	2664	13	Intergenic	novelGene_86792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	1	117	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	388	1167	1382	2548	46299	47636	FALSE	15	TCCTAGACTTGACTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTWVGRQKQEMVESNSKIIILCSRGTRAKWQAILGWEEPVIQLRCECCKPAGDLFTAAMNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEENLCSADNQDLPSLDEEVFEEPLLPSGRGIVKQKPLVQEPASEGCQVVDLLVGKEEGGVSRLEPQLQLQGELAAQTLQTVVLPVEKVLPTQAVQPMPLADGSGTASRLAVVEEREACPLLEAPGPQRNNVLFLPVDPEASPLGSTPVVSPDHLPDDVREQLEGLMFSLFQQSLSGQTQEVVKDPHTPYEEKQRQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDPEH	20679	47752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41540_42618_42726_45216_45259_46110_46620_46790
935305	contig_18545_pilon	+	3151	1	Intergenic	novelGene_161884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	109	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	ACAACACCTGTCTACATCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	271314	274465	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18545_pilon_+_271300_274500
935306	contig_408_pilon	-	2133	1	Intergenic	novelGene_84916	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCTCCTAGTGCTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	133525	131392	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_408_pilon_-_131400_133500
935307	contig_854_pilon	+	1063	1	Intergenic	novelGene_36744	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	54	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGTACCATGTGCTACATGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715327	1716390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1715300_1716400
935308	contig_1230_pilon	+	2157	8	Intergenic	novelGene_28876	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1308.73324015154	2	97	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	584	1755	165	1919	405421	408754	FALSE	20	CCATATAGTTGTTTCATGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFVVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVSSKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQKELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD	405256	408992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1230_pilon_+_405446_405707_405914_406132_406280_406375_406932_407148_407352_407588_407788_408003_408237_408568
935309	contig_15118_pilon	+	1490	10	Intergenic	novelGene_74620	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	273.063281229014	1	67	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	245	735	755	1489	394141	398674	FALSE	15	CTGCTGAGAGCCCTGCTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLPVLEGQSLRLVCVSDSSPPATLSWVGGRQPVSLSQSSDPGVLELPQVQKEDEGKVTCRAQNPLGSGQVSLLLSVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSI	392452	398675	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392554_392644_392927_393224_393283_393429_393680_393942_393983_394117_394369_394474_394749_395049_395141_395233_395346_398644
935310	contig_16098_pilon	+	1487	11	Intergenic	novelGene_46052	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	61	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	670	1083	349987	350770	TRUE	10	TCGCTGAGGATGCTCTTGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRLKPVVRIFPSDTNTARTGRVPSWGRSFSYHSAFAGLDDAHTLVTAGGADEATVMAPVHAVDCVRVHVRAQRQHSRPSAHVPHQNHVPATAPALSSTFWAVGCQVTMPTRLVWPSRVTTGSRRGSVKPPSGISHTC	348405	354075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_+_348517_348844_349064_349174_349233_349348_349492_349603_349712_349956_350076_350238_350414_350499_350647_350767_350912_352173_352351_353989
935311	contig_7963_pilon	+	1844	10	Intergenic	novelGene_58477	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	80	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	27	84	217	300	120635	120718	TRUE	30	CTAGTACGAAAGCAGTCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSSAWAWILGLGTRLPVVHALPEAVPVVLPSDEPFLPLSQSFHSLLLPHPPLPPPLPPRSSHCYFPHWRTQKMIWPDQGGKAVETGKGPGSRGSSGILA	120295	125735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_120366_120488_120759_120994_121069_121583_121959_122054_122274_122355_122489_122993_123130_123407_123502_123748_124053_125566
935312	scaffold_12124_pilon	+	1980	9	Intergenic	novelGene_22285	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3678.49408725908	1	101	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1200	1850	1508755	1509405	TRUE	40	TAAACTTGACTGGAAATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473578	1509573	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1496988_1497122_1506646_1506687_1508010_1509461_1509498
935313	contig_9668_pilon	-	2333	15	Intergenic	novelGene_58195	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	877.008703095997	2	119	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	597	1791	542	2332	605373	503722	FALSE	50	ACCAAAGAGGCAAGAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRFPRLHILLVLFSLRSRDRWNHPRITCQPLVTRTSKRPEPITFPSPASRRLHLYDDHQTPAAVRCYPPSPRVPPESSQPRQTIFCRPRRRRPWKRSISRSRLRLRPRIFTKHPRTLCLPHRLRLPGSWGLYCLLPRPHPPSPLNPGSCPTLSPESYPF	670493	503720	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512062_522339_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_669866_670221_670306
935314	contig_17976_pilon	+	1591	3	Intergenic	novelGene_32516	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1115	1	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	336	1011	180	1190	41843	47385	FALSE	45	TGGATTATCTAATATAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESPQNENSDEHSDTIGSEPSRSEEARSPTEMQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41663	47786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41858_45524_45585_46449
935315	contig_11338_pilon	-	1520	11	Intergenic	novelGene_6226	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	101.963522889316	1	50	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	373	1122	269	1390	16734	12549	FALSE	25	TGGAAACCTGACTCCCACCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPNVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHVVVGTPGRILALVRNRSLNLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQCMMFSATLNKEIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDSEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYSKWAGWGQGAGVAGPFPVLTWPPLCLPVEQSR	21380	12418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_12795_12886_13032_13118_13229_13325_13458_13760_13880_14528_14713_15095_15189_16641_16770_17075_17114_17186_17288_21286
935316	contig_6058_pilon	-	1441	8	Intergenic	novelGene_172405	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	420.31008961072	2	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	1	963	398051	387837	TRUE	15	CTGTATTCTCCCTTCTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKRIAEKELTDRNWDQEDEAEEVGTFSVASEEVLKNRAIKKAKRRNVGFESDSGGAFKGFKGLLVPSGGGGGFSGFGNVAGAKLSGLSNGNSITSAPVPTSAKAATETKTTFGSIATNGPTSLVEKNIPDPKTNSDSQQPSGFSASTACHGSSAYHKQLAALNCCVRDWIVKHVNTNPLCDLTPIFRDYEKHLANIEQQHGNGSGSSSESDTDKVLVEAQPPSLFGSTKLQQEIDSAVLGSLSSGPLTGFSSSPGNAGSLFGKDTTQSKPVSSLFATRTLESQAEDGSSECRGGDQEESDEPPRVVVTEVKEEDAFYSKK	398051	385239	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6058_pilon_-_385618_386565_386666_387836_387923_390675_390854_390976_391339_392479_392667_395659_395744_397985
935317	contig_854_pilon	+	1316	8	Intergenic	novelGene_36280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3209.26126028011	2	56	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	53	541	543600	562332	TRUE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIVLSPHPAGPENRL	543547	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562291_562405_563041_563402_563440
935318	contig_16996_pilon	+	3544	2	Intergenic	novelGene_179252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	1	179	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	2197	2787	69503	70093	FALSE	55	TCAGCAAAAACAAAACCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNSKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	1743	70850	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16996_pilon_+_3718_69280
935319	contig_16303_pilon	-	2617	7	Intergenic	novelGene_34054	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	720.294769907123	15	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	278	837	85	921	47976	35759	TRUE	25	CCATTTTTATGTGTACAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALFLRIGVRTLLLLLFQGVPEDILARSHSLQYFYTAVSEPGPGVPSFTASGFVDDQLFIHYDSVEMKAKPCAPWLKEDLDYFDDETKIFTSRMKIFHLNLRNVQKYYNQTWEHSLKKENTEKSAEPPRTHVTHHPSPDGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	48060	32576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33554_35039_35764_35980_36029_37169_37302_37424_37701_40433_40731_47897
935320	contig_15666_pilon	-	1794	6	Intergenic	novelGene_70161	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	697.404158289869	1	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	264	795	78	872	110619	107816	FALSE	5	GTGTGTCTGTGGATGTGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFECLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSSSCYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110696	106893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107976_108103_108198_108714_108859_109098_109138_109948_110246_110558
935321	contig_7051_pilon	-	1993	10	Intergenic	novelGene_64294	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	131	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGAGCGGCCCGCGGAGCGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	207345	184120	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7051_pilon_-_184191_187539_187646_188680_188758_189136_189219_191801_191840_197583_197651_199210_199307_199967_200087_203027_203171_206150
935322	scaffold_12124_pilon	+	1275	1	Intergenic	novelGene_22397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	259	780	489	1268	1508626	1509405	NA	30	AGTTTTATGCTTTTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1508137	1509412	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1508100_1509400
935323	scaffold_12124_pilon	+	1982	9	Intergenic	novelGene_22218	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	3476.91860704274	4	122	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1287	1937	1508755	1509405	FALSE	25	CTCATTTAGGGTCACATGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473570	1509450	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494321_1496970_1497127_1506640_1506687_1508010
935324	contig_2078_pilon	+	1800	6	Intergenic	novelGene_100136	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	127.130798786132	1	130	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	27	392	266439	306347	TRUE	40	CTTTTAATGCAAAATACTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RWYFTQILMLKFSLILGVQTVKELHSPCTLNRTVGESAQLQLNSSLPLTIREIEWSWISEDEKNQLLVSWRPNTTDPAWYDFEDKYKHRFSLTELAFLSIRNLTAEMSGLYEAKIKFSSGKFQEDIVRL	266412	311791	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_266464_285919_286259_306345_306646_308295_308406_308815_308962_310937
935325	contig_854_pilon	-	2308	1	Intergenic	novelGene_36387	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	97	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCCAAGATGTTAATTATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	977094	974786	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_974800_977100
935326	contig_3956_pilon	+	1114	5	Intergenic	novelGene_14952	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1651.16708724466	2	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	73	222	81	302	1281682	1282916	TRUE	10	GTATGGTGGTGACTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSSPPSLARLASFVSAWENPLPSATMVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKST	1281601	1290998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282924_1284722_1284769_1289833_1289892_1290297
935327	contig_12079_pilon	-	1526	9	Intergenic	novelGene_67548	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	410.315655928457	1	37	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	291	876	23	898	871668	861522	FALSE	45	GAAACAGACAGCACTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GQSAQPLMKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLKSLGKTHRRLPALTFSCDWGLETEQDCVCFCGD	871690	860893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_861585_863504_863542_864511_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641
935328	contig_15047_pilon	+	1735	6	Intergenic	novelGene_52199	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	265.679807286892	3	99	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	20	643	2194	4178	TRUE	25	CAGAATCTGCATCTTTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAANPREEPRAPWIEREGPEYWDEQTRRVQGAAETFRVNLRTALRYYNQSDAGSHTFQRMYGCEVGPHGRLLRGYSQWAYDGADYIALNENLRTWTAADTAAQITQRKWEEARASENWKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPQRQM	2174	21659	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15047_pilon_+_2252_2555_2826_3221_3498_4158_4264_4325_4687_21013
935329	contig_6445_pilon	+	1645	15	Intergenic	novelGene_76939	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	154	462	1182	1643	85303	96338	FALSE	15	GGGCCGGCAGCGACGCGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRHILGSLPLGNFHLFAGNAGPSKRGAQEVAVLIQCARLDSRPDEFLHKLFADILNVHLFGSKLQRLLPGFLEVFLLANVSQVGNDIIALFLQPHEDAGGVQATTVGQNHGGFAGHLVWRELRKTPPARPWGPENRCCYCAHFAVPRRWWQVAE	42878	96340	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_43153_44514_44575_49729_49894_55493_55611_64137_64207_64855_65036_68004_68099_73962_74052_77855_77922_80502_80556_85287_85475_88144_88215_88472_88606_89658_89714_96306
935330	contig_4604_pilon	-	2458	8	Intergenic	novelGene_19170	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	53	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTTGGCTATGTGTATTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	380705	371489	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_-_372163_372785_372961_373587_373701_374804_374926_377353_377531_378438_378606_379334_379468_379806
935331	contig_14970_pilon	+	1995	10	Intergenic	novelGene_45001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	6804.96474714429	1	92	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	78	237	78	314	136145	182338	TRUE	20	TGTACTTCTGCCACCTTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSAGPRPVPRDPPALLTLSPVCPDTMNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFGTGS	136067	232232	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177423_182324_182459_188757_188830_191970_192205_213689_213860_216626_216674_221180_221253_224295_224375_231345
935332	contig_6059_pilon	-	1048	8	Intergenic	novelGene_44864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	8221	junction_1	2932.86324541847	1	29	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	284	855	75	929	573354	569146	TRUE	55	AAAAAGGAAAGGAAACTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGRSKGFGFVCFSSPEEATKAVTEMNGRIVATKPLYVALAQRKEERQAHLTNQYMQRMASVRAVPNPVINPYQPAPPSGYFMAAIPQTQNRAAYYPPSQIAQLRPSPRWTAQGARPHPFQNMPGAIRPAAPRPPFSTMRPASSQVPRVMSTQRVANTSTQTMGPRPAAAAAAATPAVRTVPQYKYAAGVRNPQQHLNAQPQVTMQQPAVHVQGQEPLTASMLASAPPQEQKQMLGERLFPLIQAMHPTLAGKITGMLLEIDNSELLHMLESPESLRSKVDEAVAVLQAHQAKEAAQKAVNSATGVPTV	573428	568126	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6059_pilon_-_568245_569144_569239_569825_569957_570660_570746_571300_571456_571539_571651_572866_572958_573165
935333	contig_10225_pilon	+	2251	13	Intergenic	novelGene_86783	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	492.923901045813	1	72	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	350	1053	97	1149	20776	45229	TRUE	30	TAAACATCTTGATTCTGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGAQRCVPPIFPGTPLGLLLLLQTMSALGRSSLRLLDHPKPDCSQPGLNCRVRNSTCLDDSWISPQNLTPSSPKNVQTQLWFVHTQDGGLVPVVHIEWTLQTDASILYLRGAELSVLQQDTNERLCVKFEFLSILEHHLKRWRFTFSHFQVEPGEKYEVIVHHLPKPYPYGDPNHQSSNFSVPGCEDPRMKTTIPCVSLGSLWNPNITVEKLENHQLLVSFTLWNESTDYQILLDSFPDTETLTCFEHRERIPVPRQENFHQRCNVTLPLSNYDWCCRHRVKIQPFFSSCQNDCIRHTMNISCPEVLALPGRRLHAPVGVRGHHGCRHPAGELCHPVRRLHDLEAAWVSS	20679	47734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35637_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41530_42623_42726_45216_45259_46110_46813_47363
935334	contig_1301_pilon	+	2492	13	Intergenic	novelGene_47335	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	36	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	CTACAAAATGAAAAGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	276689	322913	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1301_pilon_+_277906_278296_278429_279344_279452_283355_283450_284683_284819_284863_284893_292182_292308_296606_296765_296919_297008_297691_297766_305263_305413_309761_309816_322782
935335	contig_7870_pilon	+	1358	1	Intergenic	novelGene_109050	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GTATTTTCTCTCCCTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	636977	638335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_+_637000_638300
935336	contig_7416_pilon	+	2137	1	Intergenic	novelGene_134310	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	8	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	198	597	222	818	5920	6516	NA	35	TGGGGAGGAACACCTCAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFTKRVKREPTDWEKIFGHYKSDKGLISIIYKKIQHLYNKKTNNPIKKWAKEMNRHFTKEDIQMANRHMRKCSRSLDIREMQIKTTMRYHLTLALLARIKNTGNNKCWRGCGKTGTLMHCWWECKMIQPFWKMTWCFLRKLEIDIPFDPAIPLLGIYPREIRVVTRIDICTPVFMAALFTIAKRWKQPRCPSTDEWINKLWYIHTMEYYAMRKNNKESVKHLITWMKLEDIMLSEISQSQKDKYCMRPLV	5698	7835	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7416_pilon_+_5700_7800
935337	contig_10930_pilon	+	2123	5	Intergenic	novelGene_37009	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	81	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	GTTCAAAGTAAGTCAAATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	267441	279833	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268576_273945_274324_276722_277010_278440_278623_279691
935338	contig_3956_pilon	+	1456	8	Intergenic	novelGene_15189	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1566.18140842038	1	50	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	145	438	414	851	1285728	1286609	TRUE	30	TAAAAGGTTTATTTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQR	1282721	1290827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283895_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286739_1287270_1287431_1290511
935339	contig_3956_pilon	-	2173	12	Intergenic	novelGene_15201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	79	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	1391	1726	1285777	1284227	TRUE	20	TTGCAGACCAGGGAGTCGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSFSISFAVSSFLKFMIASNTFEDGVQDELAERPGQLLAIGAGSRLTELAVGWVKIPSPQSFFIMSSTFLARSANCFRVKAQPWRPDPKPTVPRTGSIMMLPMGPLSPSP	1291010	1282819	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1282913_1283793_1283973_1284051_1284266_1284683_1284758_1284811_1284862_1285065_1285172_1285710_1285811_1286063_1286237_1286423_1286604_1287274_1287509_1289833_1289891_1290297
935340	contig_34_pilon	+	1527	7	Intergenic	novelGene_40001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	114	345	595	939	212376	215323	TRUE	35	TGGGGAGGAACAAATCTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGGPAGALHTSYKLLLLRLLKWWRKSALQKVFHFISGLNAIHLMNLTVQEAFRIETWFLTQLFQSLLVIREIGPYNTQVKMTNRATEKKLRMLTVCKTGSIFPVPLVSGVLKW	211781	243354	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_212546_212976_213035_214069_214151_215287_215458_224659_224810_230223_230389_243215
935341	contig_11512_pilon	-	1449	4	Intergenic	novelGene_43304	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	473.560508864026	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	156	471	1	471	374650	367967	TRUE	50	AAAAAATGATGTGAATGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLSVRHRQVKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSIATPAVQAPSSPVTLRQKTFNWKKASRLQEEPEGAGSTLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTGDDNPSFSGRKKSVSVIYGENKRKSSFFSLPPYFED	374650	366937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11512_pilon_-_367195_367245_368181_368470_368604_374526
935342	contig_233_pilon	-	2745	15	Intergenic	novelGene_14610	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	1373.79302127581	1	138	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	656	1971	337	2307	107460	78579	FALSE	20	TAGAAGCTGGGCTCTGTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFNVTFQRAEGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLKNVKKLGGDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGEKRGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	127041	78140	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92359_93764_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300_107474_108694_108814_109914_109976_126898
935343	contig_15666_pilon	+	1713	5	Intergenic	novelGene_70175	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	102	309	1115	1423	108776	109324	TRUE	20	TCACGCGGAAGTTGAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEAGDVAHQQQMARTRSSTFGHPSFWLHLPFQFCLSCFKEACQESRASVTEKALHYFFNISVAIEHPADILGPTPCSWRRLPGIPLETQEICSLIRPFKEAF	107151	110185	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_107978_108105_108198_108579_108859_109098_109378_109948
935344	contig_10437_pilon	+	1266	7	Intergenic	novelGene_38317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1235.77182359852	1	63	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	183	572	439693	446987	TRUE	25	TTTCTATCATTGCCACATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRKWHGVSSGLVSLSAQNLVDCSNEKYSNKGCNGGFMTRAFQYIIDNKGIDSEASYPYKAMVRMESAGMTPKTELPRVPSTLSFPMAVRLPWQRPWLTKGPCLLVWMQVAQLSSSTKVASTLTHPALRM	431138	451702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_431193_432088_432216_439691_439723_443823_443982_445309_445476_446951_447055_451075
935345	contig_3956_pilon	+	1949	9	Intergenic	novelGene_14934	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	997.911310876372	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	476	1431	123	1553	1286220	1290491	FALSE	30	GGGACAAGGGTAGACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPSSPPSLARLASFVSAWENPLPKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1290887	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281673_1286168_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935346	contig_8312_pilon	-	3294	2	Intergenic	novelGene_152889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCCTTTTCCTGAAGCGTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	277096	273628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8312_pilon_-_275047_275220
935347	contig_19402_pilon	+	2482	5	Intergenic	novelGene_80836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1279.06340245509	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAAAAAAAAGGACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	139877	146713	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_139897_142957_143063_143802_143855_144265_146482_146623
935348	contig_34_pilon	-	1389	6	Intergenic	novelGene_40010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	744.723734011479	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	451	1125	214146	212049	FALSE	75	TAAGAATGAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDPVLQTVSILSFFSVALLVILTCVLWKKRIKPIVWPNLPDHKKTLEQLCKKPKKNLNVSFNPESFLDCQIHKVDGIQARDEVENFLQGTFPPPLEESEKQKLVGGVQGTSWPSEHAVLTPETFRGDSPLRCLPGNVRACNIHELPSSRSPNCRDDGKNWSRVYQGLLLSPGTTNGALLPPFPFQSEIVTLNPVPQGQPILTSLGSSQEEAYVTMSSFSKISEL	230387	211784	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_-_212559_212971_213048_214057_214152_215288_215417_224659_224818_230228
935349	contig_17976_pilon	+	1550	2	Intergenic	novelGene_32492	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	84	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	918	281	1198	46468	47385	FALSE	30	CAGTACCCAGCTCACAGCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQQDSLEREIPKESVEIQVQLVEMQQQLGAIHQESGEMQQKLGAIHQESGEMRQKLGAMQQESGDVRQQLGAIHQESGEMQQKLDAIQQESGDMRQQLGAIQQESGDMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMRQQLGAIQKESGEMQQELPEMRKESHAMWQELGKMLQELPEIRQQLGKMQQESGEMRQDLRVSERRQELRESEMRQELLQSEIWQELHEIWQELHEMQREFREKQQKLRETQPKSGSSCKKPTGPSGSARVRGSRISGRSL	41629	47737	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17976_pilon_+_41886_46443
935350	contig_19402_pilon	+	4304	12	Intergenic	novelGene_80804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	142	junction_8	1224.79797625757	1	106	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	403	1212	190	1401	57720	143056	TRUE	55	TTCAATAAACTTTCAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLQLRQDIVAGRLPCSFATLALLGSYTIQSELGDYDQELHGADYVSDFKLAPNQTKELEEKVMELHKSYRSMTPAQADLEFLENAKKLSMYGVDLHRAKDLEGVDIILGVCSSGLLVYKDKLRINRFPWPKVLKISYKRSSFFIKIRPGEQEQYESTIGFKLPSYRAAKKLWKVCVEHHTFFRLTSTDTIPKSKFLALGSKFRYSGRTQAQTRQASALIDRPAPYFERTASKRASRSLDGAAADSADRSPWPTSAPALAESQIPEDSDSGSQKKREEMPPEEVEPEPTEAWKKKRERLDGENIYIRHSNLMLEDLDKNQEEIKKHHASISELKKNFMESVPEPRPSEWDKRLSTHSPFRTLSINGQVPTGEGTDDNNGDLDPGVLLTAQTITSETTSGTTTTQITKTVKGGMSETRIEKRIVITGDTDIDHDQVLAQAIKEAKEQHPDMSVTKVVVHQETEIAEE	57530	146699	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_+_57743_70439_70528_79123_79277_81350_81449_83576_83750_97645_97801_102163_102227_107511_107689_138560_138663_139815_139897_142957_143063_143802
935351	contig_12624_pilon	+	1438	12	Intergenic	novelGene_60948	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	352.867076324385	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	679	1014	43123	55160	FALSE	25	GGAAAACTCTTCAGCTGTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGATGAVGSTYNYLGKKANQMLEAFEQKDFSSALNYQFCIQRFINFVVKLGFGVSQTKAIMTLVSGIPMGPPRLPLQKASREFTDNAEAKLKSLDFLPFTGLKDRNLEACS	6025	55584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12624_pilon_+_6095_11632_11708_32960_33049_38761_38820_39362_39412_39763_39840_41857_41951_42823_42973_43101_43149_46682_46768_50396_50437_54975
935352	contig_3956_pilon	+	2861	10	Intergenic	novelGene_14947	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1069.21113183713	2	116	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	969	865	1833	1287410	1289956	FALSE	40	GAATAATAAATTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVWSDFRGGEGFHARPQ	1281601	1290984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284255_1286554_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758
935353	contig_10930_pilon	-	1079	5	Intergenic	novelGene_37048	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1900.38160641488	1	44	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	26	415	280370	276958	TRUE	40	AGAAACTGCTTCGACAAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RSYQEVLAMIGSSFPTSAAVFALLALNVSALDTFLAAVYEHAVILPNKAETPVSQEDALLLMNKNIDILEKAITEAAEKGAQIIVTPEDALYGWDFTRETIFPYLENIPDPQVNWIPCQDTTSTLSLSLMSLKSRSW	280395	272952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_-_273009_273950_274325_276723_277013_279709_279832_280157
935354	contig_10345_pilon	+	1206	11	Intergenic	novelGene_158381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2553	junction_7	553.896741279455	3	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	297	959	14227	24141	FALSE	30	ACTACCCGAGAATGATGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KGGPGSAVSPYPGFNPSSDVAALHKAITVRGVDEATIIDILTKRNNAQRQQIKAAYLQEKGKPLDEALKKALKGHLEDVALALLKTPAQFDADELRGAMKNLGTDEDALIEILASRTNREIKEINRVYQEELKRDLAKDIISDTSGDFQRALVSLAKGDRSEDLCVNEDLADADARALYQAGEGRKGTDLKVFNTILTTRSYPHLRRVFQKYTKYSQHDMNKVLDLELKGDIEKCLTAIVKCASSKPAFFAEKLYQAMKGIGTRHKTLIRIMVSRSEIDMNDIKAFYQKKYGISLCQAILDETKGDYEKILVALCGGN	11847	24388	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10345_pilon_+_11941_13157_13253_14118_14233_14654_14746_16896_16977_17173_17231_18808_18903_20420_20517_21588_21648_23046_23170_24084
935355	contig_8377_pilon	+	2130	9	Intergenic	novelGene_35139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3588.37661763645	1	114	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	313	942	426	1367	191158	197939	FALSE	55	GAAATTCAATAAACTTAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKESEHDSDESSEDDSDSEETSRYVNASFIMSYWKPEMMIAAQGPLKETIGDFWQMIFQRKVKVIVMLTELKTGDQENCAQYWGEGKQTYGDIEIDMKDTNTSSAYTLREFELRHGKRKDTGTVYQYQYNKWNAELPAEPKELISMIQSLRQKLPMKKSTEGNKNHRSVPLLIHCRDGSQQTGLFCALLNLLESAETEEVVDVFQVVKSLRRARPGMVSSFEQYQFLYDIIASIYPAQNGQIKKGNKQEDKIEFDNEVDKPKQDVNSISPVDAVDKTQEENKEAKCSEPMSGTEEPESSANGPTSPALTQSA	182898	198702	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_183052_185657_185801_189180_189272_191119_191254_192216_192352_193993_194117_194346_194523_196081_196218_197663
935356	contig_9668_pilon	-	2558	16	Intergenic	novelGene_58187	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	896.792343113313	1	138	12	FALSE	0	NA	NA	A	coding	596	1791	450	2240	585955	503609	FALSE	20	GTTTTTCCTGAAAGTGGTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNKGKKEGKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSVIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGKSKTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669964	503290	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_551747_551892_553929_554017_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599044_604197_604274_605301_605365_610419_610510_669866
935357	contig_12079_pilon	-	3031	10	Intergenic	novelGene_67533	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	391.710210345466	2	121	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	385	1158	1115	2272	862522	861365	FALSE	45	GAAAGTACAAACGTTAACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	872380	860605	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864508_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641_871716_872314
935358	contig_3956_pilon	+	1592	7	Intergenic	novelGene_15154	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1562.38585360837	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	326	981	45	1025	1281682	1290447	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSNAAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPVVCSTTGRSCPETPSTPPAAPARWWPRPASAKA	1281637	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281697_1287451_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289665_1289758_1289908_1290347
935360	contig_17144_pilon	-	1370	6	Intergenic	novelGene_29555	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1967.6793031386	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	147	444	665	1108	166806	166363	FALSE	15	GTCTCTTAAACTGTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183235	166100	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166851_174896_175001_175971_176271_179700_179786_181794_181850_183158
935361	contig_4093_pilon	-	1541	6	Intergenic	novelGene_27634	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1919.96968726071	1	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	38	484	69182	45596	TRUE	20	GGACTTTTCAACTACTTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AKLAEQAERYDDMAACMKSVTEQGAELSNEERNLLSMAREYREKIETELRDICNDVLSLLEKFLIPNASQAESKVFYLKMKGDYYRYLAEVAAGDDKKGIVDQSQQAYQEAFEISKKEMQPTHPIRLGLALNFSVFYYEILNSPEKACSLAKTVCILPVL	69219	40735	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4093_pilon_-_40976_41016_41785_45546_45784_46300_46425_68951_69015_69110
935362	contig_5341_pilon	-	1279	3	Intergenic	novelGene_168034	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	705	1	59	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	309	833	339444	338480	FALSE	20	TCAATTTTTGTGTTTGAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLDALGITALINVSANCPNHFEGHYQYKSIPVEDNYKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSIPVHPTNSALSYLQSPITTSPSC	340893	338033	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5341_pilon_-_338851_339290_339501_340641
935363	contig_1225_pilon	+	2571	1	Intergenic	novelGene_44202	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	111	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274227	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_274200_276800
935364	contig_10990_pilon	-	2266	12	Intergenic	novelGene_7484	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	64	429	736241	731607	TRUE	95	AAAAAAAAAAACAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLVSGASTFFPSLWARLRFNGGSLSPPTETFRFPSLSVRLNLTNGSSPCLLDRVTVLTTVRTFSFSGPGTGWGWSKRLETPEEPSPCFLDFSFIFFDLISSRVFIPKFKHCFRAEATRNPL	738927	714806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715652_715701_715994_722232_722429_723510_723624_729669_729796_731217_731421_731544_731642_731916_731994_733026_733137_733942_734004_736158_736260_738882
935365	contig_7119_pilon	-	2181	4	Intergenic	novelGene_40949	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	89	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	1248	1865	139497	138880	TRUE	25	TAGCCCATGCCACAGTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPTGPLCPNVSIKNGGSVLTVTALRLCSGFSGESVPMYS	140925	127526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127600_136974_137046_138707_139512_139692
935366	contig_854_pilon	-	2736	9	Intergenic	novelGene_36139	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	5	junction_1	223.881665171581	1	159	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	290	873	195	1067	487156	471803	TRUE	0	GTGCCTGGGGCTCTGTCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLHPHCCPRPCSSCRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMETFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEEQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPKKPFCLELYNPSCQGQKIKACKTDGDGKVVEGKHESYRISAASAEERDQWIEAIRASITRVPFYDLVSARKKKIASKQCQLTMGQEAKLRRLGGSPPRLRVRQ	487350	470023	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_471653_471762_471882_471991_472061_473586_473742_474241_474314_474678_474756_476675_476788_483477_483627_486996
935367	contig_13863_pilon	+	1119	7	Intergenic	novelGene_42098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	306.56429450715	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	243	732	81	812	482028	490279	FALSE	100	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLNLSQNLKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGRGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFMSFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKPIMFRGEVRLNVEEKKTRAARERETRGGGDDRRDIRRNDRGPGGPRGIVGGGMMRDRDGRGPPPRGGMAQKLGSGRGTGQMEGRFTGQRR	481428	490586	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_481474_481992_482055_482092_482174_487480_487584_488867_488997_489556_489676_490006
935368	contig_15063_pilon	+	1509	5	Intergenic	novelGene_9512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3901.83619434491	2	25	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	240	1394	34808	36661	FALSE	60	ATTAGAAATAAAAATATCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSYWGQGILVTVSSESQSSPSLFPLISCESSDQSQVAFGCLARDFLPGSITFSWDYQNNSAINTEKFETFPSVLLEGKYMASSQVLLPSVEVHQSTDEYLVCKVQHPNQNKDLRVPFPVDNPTELPPNVSVYIPYQDAFSGTGQRTSKLICQATGFRPKEISLFWLRDGKSVESGIITGEVEPELKGSGPQTFQINSMLTISEIDWINQKVFTCLVRHNGLDFMKNVSSVCRLPPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	27129	36776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_27175_34613_34926_35034_35380_35839_36158_36287
935369	contig_2703_pilon	+	2519	16	Intergenic	novelGene_101709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	804.809018063016	1	130	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	574	1644	578880	610870	FALSE	30	AAAAAGTTTGGTGTCCTAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMINRRDRVSESLGLCFQGYQDVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAALAAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDHNEIPKIETDLWPGPPSVATIGTDMRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLNSGLGQLILKEEMEKESRERASLSASRYDSPINSASHAPSSKTSSLPGYGKNGLHRPVSTEFAQYNSYGDVSGGVRVSQTLPDGHMPGMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526175	611745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526413_559434_559523_564148_564208_577994_578073_578768_578915_584442_584592_594568_594674_596351_596400_599680_599822_602059_602143_603413_603520_605155_605221_606091_606153_607648_607732_609320_609402_610756
935370	contig_1225_pilon	+	2292	1	Intergenic	novelGene_44203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	112	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	CTCTGGCCTGGTATCCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	274506	276798	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_274500_276800
935371	contig_3956_pilon	+	1842	8	Intergenic	novelGene_14935	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1551.84902221676	1	70	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	174	525	81	605	1281682	1288974	TRUE	30	TCTCTGTGGACAGAAACTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKTRWSRTGRLSVRSRTCSASPSPRTSTTVCT	1281601	1290905	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1287429_1287536_1287968_1288077_1288881_1289213_1289418_1289677_1289758_1289892_1290297
935372	scaffold_12124_pilon	+	2004	8	Intergenic	novelGene_22303	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	3259.75576273025	3	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1182	1832	1508755	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473586	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491968_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010
935373	contig_233_pilon	+	1905	9	Intergenic	novelGene_14509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	546	1358	1903	105585	108799	FALSE	20	CCTGGGGCAGGACTAGGAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPEGKWGLARLLLVRAWVLQLLGVRVDKGQHRLVHKGAKADAARLGDLIEGLEQVAPQLLDVLEVVKHGVGEVHQVVQVDGVALGPLEGHIEHGGPTWSQVKLHTLWGQLLARSCQVVLGLCEAPGVHDVIGWTAFHQQLLPGVTADRVWLPQPCEVHLLAPGAARPQLHALPAGADLVLGA	78135	108801	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_+_78636_78966_79144_91475_91677_92138_92350_104163_104308_105460_105703_107299_107467_108396_108583_108724
935374	contig_5302_pilon	-	2536	9	Intergenic	novelGene_81438	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	703.720958548202	2	97	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	166	501	385	885	182005	177220	FALSE	20	GGTTTCCTTTTCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209271	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_182952_183024_185037_185126_185963_186076_209177
935375	contig_8330_pilon	-	1316	6	Intergenic	novelGene_71816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCACAGGGAGGCTGACCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857808	852643	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_852683_853000_853124_853232_853253_856352_856556_856665_856755_856966
935376	contig_7457_pilon	-	1756	6	Intergenic	novelGene_31442	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	159.480907948256	1	94	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGATATCTGGGAGATTTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	473227	468325	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7457_pilon_-_469384_470289_470492_470902_471003_471191_471391_471948_472039_473120
935377	contig_4625_pilon	+	2316	2	Intergenic	novelGene_179253	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	83	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	1363	1818	180188	180643	FALSE	45	ACGTAATCCACCACATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESKISKNQMRMKTHHTETFGTQQRQSSEGQFIAIDAHIKKDERDKNKTLTTELKQIQREQLKKKKKKKPTTTRRKEIVKIRTEINEIENTKTIERTNKTKSWFLERINKINKPLARLTKEKQERTEINQKRNEMGDITTDTTEIKRIITE	152995	181141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4625_pilon_+_154262_180091
935378	contig_3956_pilon	+	1854	8	Intergenic	novelGene_15231	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	1481.28186351676	1	70	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	274	825	182	1006	1287527	1290168	FALSE	20	GGAGCCTACGCGACTTATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAHRGERQRHHLHLRRGRERPHGQHHDRPCPWYRGLWAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKCWPACWSAVH	1284183	1291016	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284267_1284684_1284717_1287460_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289906_1290144
935379	contig_6137_pilon	+	4616	15	Intergenic	novelGene_59216	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1072.76962977679	87	71	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	359	1080	1531	2610	1313581	1337705	TRUE	10	ATTTTTTCTCCGTGGCATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNYEVFMHFNLKLMLLLLIFFPPHSMLWKATIVLSRGISVQYRYFKGCFLEPKTIGGPCQVIVHKWETHLQPRSITPLESEIVIDDGQFGIHNGVETLDSGWLTCQTEIRLRLHYSEKPPVSITKKKLKKSRFRVKLTLEGLEEDDDDRVSPTVLHKMSNSLEISLISDNEFKCRHSQPECGYGLQPDRWTEYSIQTMEPDNLELIFDFFEEDLSEPVVQGDALPGHVGTACLLSSTIAESGKSAGILTLPIMSRNSRKTIGKVRVDYIIIKPLPGYSCDMKSSFSKYWKPRTPLDVGHRGAGNSTTTAQLAKVQENTIASLRNAASHGAAFVEFDVHLSKDFVPVVYHDLTCCLTMKI	1312050	1349051	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1313740_1319528_1319605_1321460_1321503_1323816_1323941_1328105_1328338_1331697_1331861_1332174_1332308_1333463_1333519_1336698_1336787_1337697_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420
935380	contig_13211_pilon	+	2999	6	Intergenic	novelGene_123130	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	122	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGAGCCAGGTATTTGAGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3811	219013	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13211_pilon_+_4755_69864_71032_71212_71512_96014_96257_218539_218758_218883
935381	contig_3956_pilon	+	1586	8	Intergenic	novelGene_15131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	1451.1488481861	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	451	1356	70	1425	1281682	1290847	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNPGGGRDPQAQRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1281612	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285734_1290409
935382	contig_16496_pilon	-	1512	2	Intergenic	novelGene_5131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	2	67	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	288	305	1225	1208	FALSE	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3572	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
935383	contig_7119_pilon	+	2345	2	Intergenic	novelGene_40969	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_1	0	1	107	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	49	1203	137033	139798	FALSE	30	TGATGAACACTGATGGCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	136984	140940	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707
935384	contig_11285_pilon	+	1327	11	Intergenic	novelGene_5638	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	575.138800638594	3	38	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	361	1110	767140	769984	FALSE	10	TCTTGACTTGGCCACCCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FCSVACCLDPGGASYSCCNPILDKWPSLPTTWSRRLGPPCQTDAHCSAGSSCLLTVSGTSRCCPLPEAVSCRDGRHCCPRGFHCNADGWSCFRRQDANPLGAVRCPNSQFECPNSSTCCAMLDGSWGCCPMPQASCCEDKVHCCPHGTSCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAERLQPRKLWGSCVLSYRVTMNQNRLNGNEQGGGRASVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEPWGPCSEGAHCSGLPSTSLPPNSP	766131	770201	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_766198_766308_766444_766553_766639_767065_767179_767268_767405_767527_767636_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768671_769909
935385	contig_20527_pilon	+	1941	4	Intergenic	novelGene_138585	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	471.404520791032	4	96	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	43	444	13527	27453	FALSE	35	ATGACCATGCTAGCTGAAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAVDASWEMLQKDLAFGDKMLEKGSGRRKCLTITFSVTLAKILCCLLVIMFLTSTVNFLKRYKGPSDHWIGLSRESPRHSWKWTEFIIRGVGERAYLNDNGISSARIYTERKWICNKQNSYPQKCQIASRCK	13484	28950	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_13606_24905_24998_26238_26325_27308
935386	contig_12879_pilon	+	1948	3	Intergenic	novelGene_179254	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	762	1127	2198	2563	TRUE	20	GCCCCAGGATCCCACCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTPSISEILLLIFWISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSMNLSIFSSFLSAFCFSSWRILSIRDLNSLSGSSSAFSSTGKSSGVLFWMPTGTILSCFCKCFDIVCCLRGIQ	1436	3525	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12879_pilon_+_2732_2821_3350_3400
935387	contig_854_pilon	+	3630	20	Intergenic	novelGene_36587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3156.71111414582	1	163	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	1315	2919	1694500	1715249	FALSE	65	AAAGTAAAAATAAAAAGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKAFAKRQQQLTAMKVLQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVSRQEEEMMAKEEELVKVREKQLAAESRLTELETLQSQLMAEKLQLQEQLQAETELCAEAEELRSRLTAKKQELEEICHDLEARVEEEEERCQHLQMEKKKMQQNIQELEEQLEEEESARQKLQLEKVTTEAKLKKLEEDQIILEDQNCKLAKEKKLLEDRIAEFTTNLTEEEEKSKSLAKLKNKHEAMITDLEERLRREEKQRQELEKTRRKLEGDSTDLNDQIAELQAQIAELKMQLAKKEEELHAALARVEEEAAQKNMALKKIRELESQISELQEDLESERASRNKAEKQKRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRSKREQEVNILKKTLEEEAKTHEAQIQEMRQKHSQAVEELAEQLEQTAVTAPPKSPVPTRPRDLRPADACQSPRLPLLQSLQLHSFPSSQNLIPKSQGPGPRPGKE	1679255	1715960	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680812_1680904_1681764_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689443_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1696536_1696646_1697677_1697810_1698222_1698430_1698914_1699053_1700788_1700913_1701175_1701348_1701990_1702204_1702545_1702681_1715065
935388	contig_3155_pilon	+	1499	5	Intergenic	novelGene_26360	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1059.50752120974	1	86	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	245	571	259780	261211	TRUE	10	ATTTTGATTTTTGTTTTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVTPNRKRTKKITVRDAEPNRSRSHHEQQRQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258078	262324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258173_259226_259329_259731_259978_261082_261451_261635
935389	contig_34_pilon	+	1632	8	Intergenic	novelGene_40015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	85	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	334	702	212125	212493	TRUE	35	AATTGTCATTCTGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	211791	247043	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_212559_212971_213046_214061_214155_215289_215458_224659_224813_230223_230389_243213_243352_246969
935390	contig_5041_pilon	-	2731	19	Intergenic	novelGene_27072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	647.758947696585	1	91	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	240	723	1006	1728	576515	565931	TRUE	25	TTCATCCTAATAGTCTCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MITHFKEEIGRLQFCLAEKENLHRAFLLTTSNKEDTFVLKEQLRKAEEQVQATRQEVVFLAKELSDAVNVRDKTMADLHTTRLENEKVKKQLADAVAELKLNSVKKDQEKTDTLEHELRREVEDLKLRLQMAADHYKEKFKECQRLQKQINKLSEQSANNNSVLTKKIGSQQKVNDASINTDPATTASAAETESDMVTKGQVCEMTKEIAEKTEKYKKCKQLLMRKQNAINMLMNLQKWS	636087	525075	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_525658_526413_526497_532092_532242_532893_532940_554550_554623_565859_565986_569908_570009_570821_570919_572069_572217_572790_573016_576416_576603_580873_580965_581050_581103_581143_581200_594960_595120_598398_598587_605335_605439_616559_616729_635987
935391	contig_854_pilon	+	1962	14	Intergenic	novelGene_36577	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1606.39937336441	1	94	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	613	1839	123	1961	1679334	1706979	FALSE	35	AGAAGAAGTTTGACCAGGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YYLLSGAGEHLKTDLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEMRQKHSQAVEELAEQLEQTKRVKANLEKAKQTLENERGELANEVKVLMQGKGDSEHKRKKVEAQLQELQVKFNEGERVRTELADKVTKLQVELDNVTSLLSQSDSKSSKLTKDFSALESQLQDTQELLQEENRQKLSLSTKLKQMEDEKNSFKEQLEEEEEAKQNLEKQIATLHAQVSDMKKKIEDGLGCLETTEEAKRKLQKDLEGLSQHFEEKVAAYDKLEKTKTRLQQELDDLLVDLDHQRQSVSNLEKK	1678809	1706980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1678849_1679250_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692785_1702624_1702691_1704481_1704689_1704893_1704999_1705285_1705439_1706748
935392	contig_11548_pilon	+	1452	5	Intergenic	novelGene_66780	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	2683	junction_4	607.445059244044	1	63	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	30	620	112832	119638	FALSE	25	TCTGGAAACCATTACGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LSAIYGGTYMLNKPIEEIIVQNGKVIGVKSEGEIARCKQLICDPSYVKDRVQKVGQVIRVICILSHPIKNTNDANSCQIIIPQNQVNRKSDIYVCMISSAHNVAAQGKYIAIVSTTVETKEPEKEIRPALELLEPIEQKFVSISDLLVPKDLGTESQIFISRAYDATTHFETTCDDIKDIYKRMTGSEFDFEEMKRKKNDIYGED	112802	120470	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11548_pilon_+_112904_117683_117856_118975_119121_119346_119402_119491
935393	contig_1452_pilon	-	1636	3	Intergenic	novelGene_115162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1178	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	130	393	257	649	700626	699652	FALSE	25	GGAACCGACTCGACGGCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698664	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700673_715232
935394	contig_16125_pilon	-	2041	10	Intergenic	novelGene_155249	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1074.85662552366	1	91	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	433	1302	56	1357	236934	155607	TRUE	60	GCTGAAAAAGCAAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAKFNTGGNPTEEVSVNSRPFKVTGQNSPSGIQAKMNLFNNQGNASPPAGPSNVPKFGSPKPPLGVKPSSEEKPDKEPKPPFPKPTPGVNQRFGTLANSSNRDPEAKVGVLKPVGPKPINLPKEDSKPVFPRPPGNKPTLHSVNQDNDLKPPGPKPRSNPPAQENEQKQVFPKLAGVKGKFISASQDHDPKPLFPKPAFGQKPSLSTDASHEDESLTKNVSPQKGPPAPLGAKSKPGPLKPAREDPENKDQGGNTSSSPFPGVVLKPAASRGSPSLSKNAEGKKEERKIDAAKNIFLSKMNQEESASGAPPAKFPKASSKLTVGGPWAQSQEKEKGDKNPAIPKQKPLPPLFTLGPPPPKPSRPPNVDLTKYRKTASGNGTSKSQASYSTTSLPPPPPSHPASQPPLPASHPTQSAPPSLPPRNIKPTIDQAL	236989	135679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_-_135726_138906_138984_144626_144711_148094_148240_148782_148943_151764_151850_153016_153052_155554_155618_179444_179598_235796
935395	contig_5988_pilon	-	2080	2	Intergenic	novelGene_16113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	97	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	1305	1688	1225528	1225145	FALSE	50	TAGAATGGAGAAAAATCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYLAIPIQPFNKCLTRISLPFVLKSSHPVDGKQAESLRIRQGGWGGRREHTQICIPFVMATCKRVFARPAAQRKQSIHKQRLFIFFQGLTEAQIIMSLSNNGTSKLLSNGKHTAQPHWNCAQTKQC	1226920	1224752	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_-_1226115_1226202
935396	contig_16125_pilon	+	1398	6	Intergenic	novelGene_155273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCTGTGACTTTGAAGGGTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	151776	236860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16125_pilon_+_151850_153016_153054_153471_153486_155566_155620_179440_179596_235794
935397	contig_13740_pilon	-	5419	15	Intergenic	novelGene_34649	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	4559.78739882124	2	162	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	2770	3393	161718	158742	TRUE	65	ATAAAGTATTATAAAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGQWQFWR	178058	155129	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_155412_156015_157536_158270_158394_158640_158761_160067_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161722_161919_162027_165237_166215_170858_171002_173066_173230_176356_176452_176777
935398	contig_14353_pilon	-	1759	11	Intergenic	novelGene_82112	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	472.96507270622	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	121	366	252	617	88616	83298	TRUE	30	CGGAGACATGGAATTGTGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQNSGAAPIQPVFSTVQFSQPACFPPEAQGAQTETSRHLACQLSPCHSDDHPHNAQHPWTDVP	104359	79852	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82836_83230_83300_83901_83953_84505_84542_86256_86354_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
935399	contig_7119_pilon	+	2321	2	Intergenic	novelGene_40974	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_1	0	1	122	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	16	1170	137033	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQLQLMVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	137017	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707
935400	contig_16622_pilon	-	1670	5	Intergenic	novelGene_48468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	1366.22161452672	1	65	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGAACCCAGGATTTCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121921	111859	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_112708_112977_113041_113602_113739_115153_115292_121436
935401	contig_20641_pilon	+	1216	4	Intergenic	novelGene_52816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1374.86492265806	1	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	326	922	54874	56882	FALSE	30	AAGATCTCTGTGAAAGCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLEARLRILTNNSQTPILSPQEVVSCSQYAQGCEGGFPYLIAGKYAQDFGLVEEDCFPYTATDSPCKVGKDCFRYYTSDYHYVGGFYGGCNEALMKLELVSHGPMAVSFEVYNDFLHYHKGIYYHTGLRDPFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGLDYWIVKNSWGTTWGEDGYFRIRRGTDECGIESIALAATPIPKL	14535	57176	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_+_14771_45912_45965_54835_54968_56379
935402	contig_18055_pilon	+	1706	15	Intergenic	novelGene_117823	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	396.45707104764	1	63	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	341	1026	270	1295	73614	83089	TRUE	70	AGGAAGAAGAAGAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEHKSPDGRTYYYNTETKQSTWEKPDDLKTPAEQLLSKCPWKEYKSDSGKPYYYNSQTKESRWAKPKELEDLEGYQNTIVAGSLITKSNLHAMIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYN	41920	85628	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_42054_59718_59800_61361_61411_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83085_83184_83360_83470_84605_84757_85571
935403	contig_4964_pilon	+	2402	2	Intergenic	novelGene_157244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	1404	2204	1753	2553	FALSE	35	ACCAAGTAAGGGTAGACTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLQVIGIPEQGEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRAPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILGAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSIKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPNLQELLKGVLRSEDKQLQPSGRT	0	2751	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4964_pilon_+_447_795
935404	contig_16303_pilon	-	1878	5	Intergenic	novelGene_34109	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	745.113078666587	1	117	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	33	102	323	424	37218	35759	TRUE	25	TCTTTGTGAAAGCCATCCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKVALRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQNTELVETRPSGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLSEPFILTWEPPFQPTIPVKKQFPSLGLGAVVLTVVIMGAAVAGFALWRNKSSGTGKPGRESINSSVLKA	37663	33149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16303_pilon_-_33871_35025_35764_35980_36029_37169_37302_37424
935405	contig_9363_pilon	-	4030	25	Intergenic	novelGene_6597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	899.592422178881	2	229	13	FALSE	0	NA	NA	A	coding	244	735	2762	3496	757196	754431	FALSE	30	CAATGATAGACCTCCCTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPKTKKSEFQLELPVKYAVHTVVTSLEHSTKYLNFTASESTSRVVEHQYQFSNLGDRSVSISVVFWVPVLLNQVKVLKELQVDFNIYNSSYTEERFPPHTDFLAEIKKTSVVNCSIAVCKRIQYDIPSFSIQEEFTVTLKGNLSFDWYIKTSNNYLLVVSTAEILFNNSVFTLLPGQEAFVRAQTQTKVEQYEIHNPVPLIVGSSVGGLLLLALITVGLYKLGFFKRQYKDMMSEAAPQAAPPQ	780639	753896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012_755124_755360_755463_755549_755664_755804_755889_756094_756197_756718_756795_757122_757216_758078_758151_758720_758844_758930_759073_759296_759371_759532_759665_759760_759916_761687_761852_761944_762076_765791_765993_766089_766235_773175_773319_773610_773741_773893_773968_774893_775045_776037_776192_776977_777660_780570
935406	contig_14970_pilon	-	1432	6	Intergenic	novelGene_45060	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	91	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACCACTGCTCACGTCATCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	232251	192077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_-_192199_213681_213891_216611_216671_221175_221249_224291_224389_231378
935407	contig_7119_pilon	+	3054	5	Intergenic	novelGene_40900	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	437.763349311018	1	150	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	466	1401	203	1603	137033	140225	TRUE	35	TTATTGACAAGGAGACAGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127455	141901	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707_139455_139635_140971_141195
935408	scaffold_12124_pilon	+	1521	3	Intergenic	novelGene_22386	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	570	1349	1508626	1509405	FALSE	35	CTTGACTGGAAATTATATGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQIPCSLPGGLKMEHQARVSFLCAFSFTCFTTSGTGTPGTHMLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1497094	1509577	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1497102_1508010_1508487_1508539
935409	contig_19816_pilon	+	1865	5	Intergenic	novelGene_156509	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3	113	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CCGTCGGGCCCCACTTCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	123043	125804	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19816_pilon_+_123362_123631_123680_123795_124037_124443_124556_124658
935410	contig_10225_pilon	+	2019	14	Intergenic	novelGene_86782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	564.375237128653	1	68	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	600	1420	2019	46473	47627	FALSE	30	GAGCATTGAGAGAAGGCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNMILPDFKKPACFGTYIICYFSDISNEGDIPDLFNITSRYPLMDKFEEVYFRIQDLEMFEPGRMHRVGELTGENYLQSPSGWQLKKALERFREHQRQCSDWFERENLCSADNQSVQSDQGYISRSSPQPPDGLTEMEEEEEEQDQGKSAEQLSPEDLENLRSLQQQLLFQELQKTSGWDSVEMERLPAGWQGCRGLLDP	20679	47627	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_+_20914_34904_34930_35619_35785_37031_37145_38521_38649_39864_39913_40141_40306_40968_41053_41437_41523_42609_42726_45216_45259_46110_46246_46391_46815_47369
935411	contig_16775_pilon	+	2163	15	Intergenic	novelGene_107761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	329.599022004196	1	103	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	135	542	130489	145069	TRUE	30	GTACATTTGATTATACATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARAAAIAATVPQPLSPLLLLLVPFPSPLLPGAAFLLHCFPSVPAMPLYSVTVKWGKEKFEGVELNTDEPPMVFKAQLFALTGVQPARQKVMVKGGTLKDDDWGNIKIKNGMNLLMMGSADALPEEPSAKTVFVEDMTEEQLASAMELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKR	130354	174741	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134072_134219_137074_137108_143932_144038_144961_145102_156900_157055_158971_159028_159353_159436_160117_160233_164974_165041_165193_165276_168016_168125_172805_172867_173216_173325_173984
935412	contig_10134_pilon	-	2733	4	Intergenic	novelGene_16250	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	790.073976845769	1	158	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ATTAATGTCTGCTCTATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39611	32246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10134_pilon_-_33265_33320_33731_34922_35171_38554
935413	contig_15056_pilon	+	1140	2	Intergenic	novelGene_179063	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	86	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	594	495	1088	22295	79829	FALSE	45	CCTACAACTCAAACAAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNIPLSVKDRTTKKKLSKDTEDLKGTISQLDCIDIYRTLHPTAAKYTFFSNANGTFSRIDHILGHRAIFNKIQNTEIIQSIFSDHRAIKVEIYNRNSKEKKSTTWKLNNTLLTHHWVIEEIKDAIKKFIESNENKNISYQNLLDTAKAVFTVNL	21800	79881	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15056_pilon_+_22772_79712
935414	contig_19402_pilon	-	2167	6	Intergenic	novelGene_80855	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	297	junction_5	487.638636697299	1	104	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	501	1506	92	1597	193194	167101	FALSE	55	AAAAAAAGAAAATTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRVYIGRLSYQARERDVERFFKGYGKILEVDLKNGYGFVEFDDLRDADDAVYELNGKDLCGERVIVEHARGPRRDGSYGSGRSGYGYRRSGRDKYGPPTRTEYRLIVENLSSRCSWQDLKDYMRQAGEVTYADAHKGRKNEGVIEFLSYSDMKRALEKLDGTEVNGRKIRLVEDKPGSRRRRSYSRSRSHSRSRSRSRHSRKSRSRSGSSKSSHSKSRSRSRSRSHSQSKSRSRSQSRSRSKKEQSRSPSKDDKSRSRSRSADKSRSKSKDQAEEKIQNNDNIGKSKSQSPSRHKSKSKSRSRSQERRVEEEKQGSVSRSRSREKSRSQEQSLLESRSRSRSRSKGGSRSRSRSRSKSKDKRKGRKRSREESRSRSRSPSKSERSRKRGGKRDSKSGSSKKKKEDTDRSQSRSRSRSVSKEREHAKSESGQREGQGESENAGINQETRSRSRSNSKSKPNPSESRSRSKSASKTRSQSKSRSRSASRSPSRSRSRSHSRS	193285	166530	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19402_pilon_-_167939_168204_168295_170797_171013_174052_174166_175052_175196_193087
935415	contig_19258_pilon	-	1583	1	Intergenic	novelGene_179255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	108	327	67	393	18561	18235	NA	45	AATCTCAGTTGCAAAATCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEGIQSLYQKELVDVQPFKEVAYDQELMVLKEEVQAAQKALAKNKAPGIDGVSIELFQQMDAMLEVLIRLCQKFERQLPGQVTGGDPYLCLFPRKVIQPNAEIIKQYH	18627	17044	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19258_pilon_-_17000_18600
935416	contig_12638_pilon	-	2148	10	Intergenic	novelGene_33370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	108	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	1500	1913	1529501	1521235	TRUE	25	TTAAATATCTTCTTACTTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGTFRIPLAIILYRLWTPVVVSSEMPRMPEQELRVLGVNKVGEVTAIVQNHVEGPILEVQSLLDAPQVLLVCFALPGIHWNASLGNGSCGMVLGGEDVAAGPLHLTQGNEGLNEDSCLHSHVKASSDAGTLQWLGG	1539666	1515724	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12638_pilon_-_1515869_1521143_1521332_1522654_1522730_1524396_1524543_1529405_1529525_1529953_1530162_1530252_1530341_1530440_1530556_1534858_1535059_1538801
935417	contig_3077_pilon	+	1839	2	Intergenic	novelGene_26775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	76	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TGTGCGGCACTTGCTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16201	18086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_17630_17675
935419	contig_3956_pilon	+	795	3	Intergenic	novelGene_15277	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1701.5	1	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	178	603	1288971	1290816	FALSE	15	GACTGTGTGGAGCCTACGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVRRASRPWTTSWTNCRWPSLAAAAGSPGWDSASACPQPHVITFFSRLETSPRPACPSAWRRGPLCAIAPTSTLDAVLPDIYFKISEGRGNGLSAGTYLAGGGGTPDTFFFPFLQRETQTSKKI	1287995	1291008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1288077_1288874_1289027_1290446
935420	contig_20641_pilon	-	2032	7	Intergenic	novelGene_52865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	98	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCCCACTTCGAAGACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	86666	14732	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20641_pilon_-_14765_16765_16914_41460_41612_45837_45963_54832_54962_71457_71525_85286
935421	contig_2798_pilon	-	2556	5	Intergenic	novelGene_120025	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	732.861173756667	1	139	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	310	933	548	1480	116665	115733	FALSE	35	AAATAATATAGTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVDHNITRDHLVFRNCSYNPVGTPYLTWLYCVVLVGGLLGVISILFLLMKMNTRSVTTTAVVNLVVVHSVFLLTVPFRLIYLIKQTWIFGLSFCKFVSSMLHIHMYLTFLFYVVILVIRYLIFFKRKDKVEFYRKLHAVAASAGMWLLVIVIVVPLVVSQYGTKEKYDEKHCFTFHRELASKHVRVINYMIIIIVIAIAVILLAFQVFIIVSMVRKIRHSLLSHQEFWAQLKNLFFIGVIFTCFLPCQFFRIYYLQVVARPEPCGSNVFYNEIFLSVTAISCFDLLLFVLGGSHWFKQKIIDLRNCLLCR	193422	114656	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2798_pilon_-_116680_120448_120595_151071_151194_170381_170519_193294
935422	contig_17144_pilon	-	1924	10	Intergenic	novelGene_29182	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	700	junction_2	1723.24980097002	4	39	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	534	1605	23	1627	173384	166363	FALSE	10	CTTGAGTGTGCCTGAGTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	173406	166065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305
935423	scaffold_12124_pilon	-	1492	2	Intergenic	novelGene_22390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	85	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	104	315	1151	1465	1508404	1506661	FALSE	50	TCCCCTGAAAACAAGAAGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARSTGPGVPESAWYLNDWDFITVCLSHPTGNPRGPWRRGPSPLWLENSLLVNIIDPAGQQAERITVLKQTNKSPCEQTGGQDGAPPSLCVSACQRWCGSVLVP	1509554	1506633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1506684_1508112
935425	contig_2703_pilon	+	2246	15	Intergenic	novelGene_101737	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	894.674835470681	1	114	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	180	543	841	1383	602068	610870	FALSE	70	GGCAAAAAAAAAAAAAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRRSSGREEDEEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMLVFFPFFVIQLHMRHHLKPHLSRAMAKMGFTGLFPQSLLSITATGTRRPSRMATCLECGWTEECPCPTCWNQRQIFPYEMLMVTNRGRNKILRDVDRTRLERHLSPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF	526218	611733	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_+_526418_559454_559523_564148_564208_577994_578073_578768_578858_584433_584592_596359_596400_599680_599822_602059_602152_603413_603456_605125_605221_606091_606134_607650_607736_609320_609402_610756
935426	contig_2069_pilon	+	2363	11	Intergenic	novelGene_23278	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	343.353986433826	52	99	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	807	1523	341330	343975	FALSE	15	ACTGATGTGGTTTTTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	333932	344815	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_334097_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339562_339709_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
935427	contig_7963_pilon	-	2286	10	Intergenic	novelGene_58466	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	200	junction_8	641.696035883919	1	138	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	356	1071	998	2068	123098	120628	TRUE	80	AAAAAAAGAAAAAAAGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126131	120286	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123407_123500_123746_124051_125563
935428	contig_12644_pilon	+	1413	10	Intergenic	novelGene_44603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2527	junction_1	4221.33346786458	15	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	423	1272	54	1325	2675526	2680545	FALSE	15	TATGTGTTGGAGTGTGTAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACARPLISVYSEKGESSGKNVTLPAVFTAPIRPDIVNFVHTNLRKNNRQPYAVSELAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVRGGGTHRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRRWHRRVNTTQKRYAICSALAASALPALVMSKGHRIEEVPELPLVVEDKVEGYKKTKEAVLLLKKLKAWNDIKKVYASQRMRAGKGKMRNRRRIQRRGPCIIYNEDNGIIKAFRNIPGITLLNVSKLNILKLAPGGHVGRFCIWTESAFRKLDELYGTWRKAASLKSNYNLPMHKMMNTDLSRILKSPEIQRALRAPRKKIHRRVLKKNPLKNLRIMLKLNPYAKTMRRNTILRQARNHKLRVDKAAAALAAKSDEKGVPGKKPMGGKKGGKKAVGVKKPKKPVVGKKAAATKKPAPEKKKPAEKPTTEEKKPAA	2675472	2680633	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12644_pilon_+_2675529_2677223_2677396_2677585_2677693_2678054_2678194_2678720_2678846_2679073_2679204_2679507_2679665_2679878_2679963_2680107_2680229_2680311
935429	contig_12901_pilon	-	2083	1	Intergenic	novelGene_142987	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	140	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	984	1349	156080	155715	NA	85	AGGGAAAAAAAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFISEILLFNFCISNCCFCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINFSIFSSYLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPIGAILSCFRKSFDIVCCFRGIQ	157063	154980	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12901_pilon_-_155000_157100
935430	contig_8377_pilon	+	1862	16	Intergenic	novelGene_35081	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3348.05500153945	1	102	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1194	669	1862	154883	180485	FALSE	45	ATTCAGAAATTGAACATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRNKCAEYWPSMEQGTKTFGDVVVKINEHKRCPDYI	131428	180485	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_131552_140708_140976_142257_142384_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179666_180383
935431	contig_16103_pilon	-	2028	8	Intergenic	novelGene_118865	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3195.48854812914	2	98	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	62	189	246	434	735970	735658	TRUE	20	AACCAGTCCCTCCCACCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VKRKIQVLQQQADDAEERAERLQREVEGERRAREQAEAEVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIENRALKDEEKMELQEIQLKEAKHIAEEADRKYEEVARKLVIIEGDLERTEERAELAES	743603	722296	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723680_733297_733370_733542_733606_734953_735030_735657_735733_735856_735975_737495_737630_743496
935432	contig_5302_pilon	-	2419	9	Intergenic	novelGene_81439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	703.326204545231	2	143	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	271	816	217	1032	209238	177220	TRUE	20	GGTTTCCTTTTCAAAACCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYKETVYSAFNLLMHYPPPAGAGQHPQPQPPLHNKASQPPHGVPQLSPLYEHFSSPHPTPAPADISQKQVHRPLQTPDLSGFYSLTSGSMGQLPHTVSWFTHPSLMLGSGVPGHPAAIPHPAIVPPSGKQELQPYDRSLKTQAEAKVEKEAKKPTIKKPLNAFMLYMKEMRAKVIAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKRRSREKHQESNTGGKRNAFGTYPEKAAAPAQFLPMTVL	209454	175568	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5302_pilon_-_176909_177172_177300_179917_179967_180998_181107_181210_181374_181904_182025_185037_185126_185963_186076_209142
935433	contig_18145_pilon	+	2752	18	Intergenic	novelGene_37331	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	465.985297598384	1	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	806	2421	180	2600	86893	100744	FALSE	75	AAAAAATACAAAATAAAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG	86666	100896	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18145_pilon_+_86793_86839_86910_90460_90573_90764_90938_92019_92163_92692_92824_93352_93485_94907_95011_95954_96089_96164_96301_96655_96769_97169_97335_97426_97550_97824_98038_98231_98541_98826_98983_100326_100482_100638
935434	contig_5023_pilon	+	1650	8	Intergenic	novelGene_7372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1339.25327960725	1	71	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCTCAGCAGTGAGCTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	625773	647984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_625845_629210_629290_630199_630310_631421_631499_639072_639197_643413_643539_646857_647739_647801
935435	contig_16622_pilon	-	2398	6	Intergenic	novelGene_48469	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1531.31700179943	1	109	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	144	435	720	1154	115540	113120	FALSE	35	TTTCAATAAATTGATTCTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKVLLEMEDQKNSYEQKAKESLQKVLEEKMSAEQQLQSTQRSLALAEQKCEEWRTQYETLKEDWRTLGTQHRELESQLHVLQSKLQGADSRDVQMNQALRLLENEHQELQAKIECLQGDRDLCSSNTQDLQEVRQTEDKSVFI	121963	111875	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113158_113602_113739_115153_115292_115417_115559_118811_118878_121328
935436	contig_3956_pilon	-	2435	11	Intergenic	novelGene_15141	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	666	1601	1289815	1287298	TRUE	30	GGCGACGACGGCGGAAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASFPVQDTIDTTDHLLWTLDLHKVDRLHEAGLGGQHTGIEAAPGCGDDLPATTVDGISVQGHIMDIKAHTPHVLLTQRPLHGGPLKAGHHAVLDLVEVLHTLGDVSQDVGASAVGPKAPYLAGLSHVPLVLLCQVTGPLLELLAGRHLTLVDVLCQAVREGPRLHVQTVVLVRGLGEAEHVRLLTDSLPVRDHRVGFLMGIQAWSSSRSFRQISRCSSPAPAMMCSPDSSMMHCMGSDLARRFRPSTSLGRSAGFLASTATLTTGLTLNFITRMLWACSKVVMVPVFTRNWSTPTRPTMFPHGTSSMGST	1290886	1281617	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1281684_1282696_1282913_1283793_1283973_1284051_1284266_1284683_1284820_1287274_1287530_1287965_1288077_1288875_1289224_1289488_1289675_1289756_1289891_1290296
935437	contig_17833_pilon	+	2154	3	Intergenic	novelGene_174598	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TGCCGGAAGTCTGCCTCATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4	3068	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17833_pilon_+_214_326_1966_2762
935439	contig_9098_pilon	-	2030	12	Intergenic	novelGene_75847	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	173.508758442329	1	91	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	716	1585	345261	335775	FALSE	20	TATTTATATCTATGGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAVIYPFMQGLREAAFPAPGKTVTLKSFIPDSGTEFISLTRPLDSHLEHVDFNSLLQCLSFEQILQIFASAVLERRIIFLAEGLSTLSQCIHATAALLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCERTFLMSVGDEKDILPPKLQHDILDSLDQGTKHLQTSEQINEHVSGPFVQFFVKTVGHYASYIKWEANGHGHFQERSFCKALTSKAKRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKSPPAGYFQRKILEYEEQKKQNKPGKRL	355834	335329	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9098_pilon_-_335846_336315_336556_337030_337116_337545_337588_340615_340794_343617_343767_345156_345285_346957_347036_347761_347832_348546_348660_349535_349712_355579
935440	contig_233_pilon	-	1829	9	Intergenic	novelGene_14621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1894.43248428124	2	99	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	732	1394	93778	78579	FALSE	15	TCCTAGAAGCTGGGCTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRRREGKCECGKCQCSPEFEGSACQCLKSTKGCLNKQKAVCSGRGRCRCNVCECDPGYQPPLCEECPGCPSPCSRYVSCAECLKFLKGPFEKNCSKECPGMKLSEVPLSGWLCKERDSEGCWINYTVARRDGRDNYLIQVMDTRECVEGPKVAAIVGGTVAGIVLIGILLLSIWKALTHLSDLREYKRFEKEKLKSQWNNDNPLFKSATTTVMNPKFAES	101769	78143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92355_93764_94003_94725_94914_98318_98452_99779_99870_101673
935441	contig_6102_pilon	-	2504	20	Intergenic	novelGene_31882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	93	7	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCGTCGTCCAGCAGCTGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395237	371137	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_371185_372698_372746_372938_373074_373198_373272_373402_373476_373632_373722_373899_373955_374378_374499_374585_374766_374890_374975_375259_375312_375445_375531_375634_375728_375965_376037_376205_376285_378875_379031_379329_379368_393748_393855_393928_394079_394465
935442	contig_10324_pilon	-	2202	8	Intergenic	novelGene_7759	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	83	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	1676	2182	75870	73587	TRUE	40	AGTAGGCGATGCAAAGACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNFSRHQKQHLRQVMTNLANLFCAAFRRWSKYSRITRMICTMARMRAPKASEPVWYRPAEGGEEREGRQVVGLAQSPIVGGEGPSQRDLAQRQHEVGQPEEHEGIEDLQAQQRPVVARLTTIEGELAAGTWAQLGFIRGGESLRVAGSPSNWAGSVIKDLVDSFVGSR	80764	73405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10324_pilon_-_73422_73582_73666_74485_74746_74831_74925_75795_75901_76008_76064_78352_78449_79270
935444	contig_14408_pilon	+	1823	1	Intergenic	novelGene_179256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	196	591	652	1242	105605	106195	NA	55	AATGAAAGAGGGAATAAACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTISKLLRKQDRMAPIGVQTKTPDNSPVEENTLEVPDRELKSLILGIFQELRQKADKHEEKIDKLMENTDKKLEEFRKMMQEQNAKINSQLEIIQKQQLEIQKLNNKISEMDDVIEGLRSRFETVEDRISGTEDKHLDTTLFQENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNLRVIGIPEQGRKQKTQRGSLRNC	104953	106776	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14408_pilon_+_105000_106800
935446	contig_17144_pilon	-	1419	7	Intergenic	novelGene_29518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2533.58628671341	1	81	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	651	1139	167257	166363	FALSE	25	TTCTTTCTTAAGAAATTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183191	166082	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167650_174876_175001_175973_176271_181794_181850_183158
935447	contig_17144_pilon	-	1875	10	Intergenic	novelGene_29478	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2236.81478783151	1	123	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	381	1589	173384	166363	FALSE	30	CTTAAGAAATTCTTGAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWVPTIMAETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183402	166076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166840_167248_167269_168258_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173391_181715_181846_183158
935448	contig_4974_pilon	+	2009	1	Intergenic	novelGene_161406	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	10	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	113	342	422	763	76650	76991	NA	40	CTTCACCTGAAGTACAATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIKGHSLQYGLHLNIKKTEILTTGPISNIMINGEKIEVVKDFILLGSTINTHGNSSQEIKRHIALVKLAAKDLFKVLQGKDVTLKTKVRLTQAMVFSIASYACESWTMNKED	76228	78237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4974_pilon_+_76200_78200
935449	contig_3095_pilon	+	1106	5	Intergenic	novelGene_75113	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	31	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	37	801	147241	151151	TRUE	30	GTAATCTTCTGAACATTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALLTPIKSPLKTMAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147204	152142	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935450	contig_11720_pilon	+	1100	11	Intergenic	novelGene_43782	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	2436.88855715644	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	205	618	52	669	68064	93212	TRUE	20	TGAGCTGCGCTTGCAAGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GGGGSAGGFRLPGPAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQKDAEPATQPHRSSLATGNLLLS	67796	98479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67840_68055_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93143_93261_94959_95061_95383_95486_98299
935451	contig_6654_pilon	+	1174	1	Intergenic	novelGene_85725	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	41	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGAGTGAGTGCTTTCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	346146	347320	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6654_pilon_+_346100_347300
935452	contig_5023_pilon	+	1316	11	Intergenic	novelGene_7261	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	2312.56893735084	2	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	389	1170	79	1248	607279	647201	FALSE	20	ACTTTCCCCAGAACTGGGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARGSVSDEEMMELREAFAKVDTDGNGYISCNELNDLFKAACLPLPGYRVREITENLMTTGDLDKDGRISFDEFIKIFRGLKSTDVAKTFRKAINKKEGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEKYAFVNWINKALENDPDCRHIIPMNPNTNDLFSSVGDGIVLCKMINLSVPDTIDERTINKKKLTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWSI	580850	647269	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625829_647189
935453	contig_14357_pilon	+	2400	1	Intergenic	novelGene_121687	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	4	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	119	357	2043	2399	575536	575892	NA	55	CAGAATACATAAAGCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTALNSYLSIITLNVNGLNAAIKRQRVADWIKKHNPSICCLQETHLKDTNKLKLKGWTKIYQANNTQKRAGVAILIADKIDIQVKSTTKDKKGHYIMLKGSIHQEDTTVINIYAPNDRA	573493	575893	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14357_pilon_+_573500_575900
935454	contig_12079_pilon	+	2604	8	Intergenic	novelGene_67505	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCCAGCAGAGGAAGTTCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860594	871141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_861382_861599_862630_863468_863581_864501_864700_866538_866649_867246_867409_868245_868420_871110
935457	contig_5020_pilon	+	851	4	Intergenic	novelGene_27919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1812	junction_1	527.11942564175	1	38	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	234	536	124540	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	124224	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_124363_124444_124547_124909_125091_125657
935458	contig_5020_pilon	+	1214	7	Intergenic	novelGene_27882	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	978.835021849954	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	220	663	237	899	123294	125772	FALSE	0	GTGTCTCCTCCCTCTCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118486	126087	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119438_119576_123273_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
935459	contig_5020_pilon	+	1571	8	Intergenic	novelGene_27881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	2	junction_3	1106.55719071656	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	256	771	487	1257	123186	125772	FALSE	0	GGTGTCTCCTCCCTCTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATTQYRGVLGTILTMVRTEGPRSLYNGLVAGLQRQMSFASVRIGLYDSVKQFYTKGSEHAGIGSRLLAGSTTGALAVAVAQPTDVVKVRFQAQARAGGGRRYQSTVDAYKTIAREEGFQGLWKGTSPNVARNAIVNCAELVTYDLIKDALLKANLMTDDVPCHFTSAFGAGFCTTVIASPVDVVKTRYMNSALGQYSSAGHCALTMLQKEGPRAFYKGFMPSFLRLGSWNVVMFVTYEQLKRALTAACTSREAPF	118482	126086	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5020_pilon_+_118566_119475_119596_122812_123041_123130_123364_124167_124363_124444_124547_124909_125091_125657
935460	contig_5499_pilon	+	2495	11	Intergenic	novelGene_57014	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	268.542007887034	5	10	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	348	1047	110	1156	816576	840037	TRUE	35	TTATTAACTATGAGGAATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARHPRTAFRRHQHGCGPARCGRSAPRPAKPKTGILMLNMGGPETLGDVHDFLLRLFLDRDLMTLPLQNKLAPIIAKRRTPRIQEQYRRIGGGSPIKMWTSKQGEGMVKLLDKMSPHTAPHKYYIGFRYVHPLTEEAIEEMERDGLERAIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYRYYNGVGKKPTMKWSTIDRWPTHPLLIQCFADHILKELDHFPLEKRSEVVILFSAHSLPMSVVNRGDSYPQEVGATVQRVMDKLGYSNPYRLVWQSKVGPISWLGPQTDEAIKGFCERGRKNILLVPIAFTSDHIETLFELDIEYSQVLANKCGVEKIRRAESLNGNPLFSKALADLVLTHIQSNERCSRQLTLSCPLCANPVCGEMKSFFTN	803434	841479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5499_pilon_+_803522_816553_816674_818145_818295_825082_825218_827918_828026_831323_831423_834837_834946_835345_835511_839385_839446_839911_840222_840324
935461	contig_1450_pilon	+	754	5	Intergenic	novelGene_27402	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	347.317128140839	1	30	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	229	687	66	752	342538	351374	FALSE	15	GAACGAGTTCCGGGCCTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRSGGWSGSTTWQRSSGRRPPSMRSGRTVRPAQPSLLPLQAFWLSYSLSPATSELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALERTEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLEGDHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQ	342472	351376	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1450_pilon_+_342696_346444_346554_347012_347145_350345_350526_351266
935462	contig_20951_pilon	+	667	1	Intergenic	novelGene_43046	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	998	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AAGGTGGACAGCGAGGCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	26554	27221	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20951_pilon_+_26600_27200
935464	contig_12427_pilon	-	1474	6	Intergenic	novelGene_40465	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2225.05960369605	6	56	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	139	651	316061	314393	TRUE	25	GAGTTTGACTAAAGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325977	313519	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314308_314357_314511_315365_315565_315748_315842_315958_316079_325856
935466	contig_8330_pilon	-	2035	13	Intergenic	novelGene_71801	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	418	12	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAGAGGGGAGGGAAGGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857808	837609	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_837681_852602_852684_853009_853124_853232_853306_853914_854058_854993_855090_855283_855348_855432_855535_855624_855714_856194_856271_856362_856558_856665_856755_856966
935468	contig_5023_pilon	+	2311	15	Intergenic	novelGene_7257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2255.03390738795	1	104	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	848	1936	618569	646990	FALSE	40	TAGAGCTAACACATCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATDVVRGNPKLNLAFIANLFNRYPALHKPENQDIDWGALEGETREERTFRNWMNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISTKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	580849	647365	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_580905_607254_607343_607935_608100_609594_609725_611686_611824_616352_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639189_643417_643539_646857
935469	contig_7119_pilon	+	2403	3	Intergenic	novelGene_40936	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	111	1	99	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	158	1252	137044	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127506	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127597_136976_137048_138707
935471	contig_11855_pilon	-	1657	14	Intergenic	novelGene_66954	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2026.0852041407	1	12	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	469	1410	131	1540	1102035	1078618	TRUE	20	AAATGGTGAGTTTCGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISAAQLLDELMGRDRNLAPDEKRSNVRWDHESVCKYYLCGFCPAELFTNTRSDLGPCEKIHDENLRKQYEKSSRFMKVGYERDFLRYLQSLLAEVERRIRRGHARLALSQNQQSSGAAGPTGKNEEKIQVLTDKIDVLLQQIEELGSEGKVEEAQGMMKLVEQLKEERELLRSTTSTIESFAAQEKQMEVCEVCGAFLIVGDAQSRVDDHLMGKQHMGYAKIKATVEELKEKLRKRTEDPDRDERLKKEKQEREEREKEREREREERERKRRREEEEREKERARDRERRKRSRSRSRHSSRTSDRRCSRSRDHKRSRSRERRRSRSRDRRRSRSHDRSERKHRSRSRDRRRSKSRDRKSYKHRSKSRDREQDRKSKEKEKRGSDDKKSSVKSSSREKQSEDTNTESKESDTKNEVNGTSEDIKSEVQRKYAQMKMELSRVRRQTKASSEGKDSVVLQNILSVGVVSGP	1102165	1069843	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11855_pilon_-_1069851_1077666_1077736_1078576_1078643_1079101_1079208_1079312_1079454_1082885_1083047_1084332_1084617_1084963_1085126_1085837_1085943_1086885_1086961_1087302_1087448_1087858_1087899_1091736_1091804_1101936
935472	contig_10734_pilon	-	1568	1	Intergenic	novelGene_51404	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CATAACAATGTATGTATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2063958	2062390	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_2062400_2064000
935473	contig_13633_pilon	+	1979	13	Intergenic	novelGene_15317	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_12	420.397893535266	1	105	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	458	1377	42	1418	20259	49142	FALSE	45	GCAAACATATACAGACTACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPAVLWCGCHGVRMSYPGYPPTGYPPFPGYPPVGQESSFPPPGQYPYPGGFPPMGGGAYPPAPSGGYPGAGGYPAPGGYPAPGGYPGAPQPGGAPSYPGVPPGQGFGGPPGGAGFSGYPQPPAQSYGGGPAQVPIPGGFPGGQMPSQYPGGQAPFPTQPAAMTQGTQGTIRPASNFDAMRDAEILRKAMKGFGTDEQAIVDVVANRSNDQRQQIKAAFKTMYGKDLIKDLKSELSGNMEELILALFMPATYYDAWSLRNAMKGAGTQERVLIEILCTRTNQEIREILRCYGSEFGRDLEKDIRSDTSGHFERLLVSMCQGNRDENQNVNHQMAQEDAQRLYQAGEGRLGTDESCFNMILATRSFPQLKATIEAYSRMANRDLLSSVSREFSGYVESGLKAILQCALNCPAFFAERLYFSMKGAGTDDSTLIRIVVSRSEMFSQMYQKTLGTMIANDTSGDYRKLLLAIVGQ	5037	49703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49043
935475	contig_15666_pilon	+	1371	4	Intergenic	novelGene_70191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	56	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATGCCCTGGATTTCAAAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	107234	130772	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_+_107978_108105_108198_108579_108859_130515
935476	contig_11285_pilon	+	1586	8	Intergenic	novelGene_5646	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	201	junction_7	473.024312271579	2	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	413	1242	33	1274	767344	769878	FALSE	15	CTTCAACTGTCTCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCDLAKARCLMPTGTYPLAKKTPARKTNRAVAQPTAVMCPDAQSQCPDDSTCCELPSGKYGCCPMPNAICCSDHLHCCPQDTMCDLIQSKCLSKENATDLLTKLPAHTVQEVKCDTEVSCPDGYTCCRLSTGAWGCCPFAQAVCCEDHVHCCPAGFRCDTEKGTCEQGNRQEPWMKKAPAHLSLPDPQAIERDVPCDNVTSCPPFNTCCRLLSGEWGCCPAPEAVCCSDHQHCCPHGYTCTDEGQCQQGDKTVAALKKMPARQASLSHPRDTSCDQHTSCPVGQTCCQSLSRGWACCQLPHAVCCEDRQHCCPAGYTCNVKARTCEKEVVSTQPATQLAHSLHVGVGDVACGESHFCRDNQTCCRDSHGGWGCCPYRQGICCTDKRHCCPAGFRCKARGTKCLPKEILRWDTPVRGPAQRQLL	767311	770190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_+_767405_767725_767836_768024_768149_768428_768527_768610_768857_769085_769320_769421_769653_769740
935477	contig_5643_pilon	+	1112	10	Intergenic	novelGene_38864	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	2549.51699129245	1	54	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	161	486	478	963	236928	237983	FALSE	20	GTGAGGGGCTTAGAGAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	236021	238132	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236751_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
935479	contig_11258_pilon	+	1770	7	Intergenic	novelGene_67797	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	176.604076963132	2	74	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	491	949	285721	292582	FALSE	50	GAGAGAAGAAAAGAGTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALATASTTHSPSSQENSNQSQSPGLSLLLSLLVVLLLLLVASLLVVWGMVRKRIKSAENAELSRNPSQSQLQPFEPSESCYVNLELQTCPSGKAPEPRPDMEVEYSTVAFPRAKLHHNSGTFVHHSQYSEITSTSPRRPQEETEYSVIKKT	282670	293403	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11258_pilon_+_282775_283717_284075_285691_285795_288174_288270_291348_291387_291794_291915_292450
935480	contig_7119_pilon	+	2549	3	Intergenic	novelGene_40883	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	2	107	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	246	1400	137033	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127412	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
935481	contig_7119_pilon	+	2305	2	Intergenic	novelGene_40973	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	920	junction_1	0	1	82	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	19	1173	137033	139798	FALSE	50	AATAAATATCTGATGAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSQLQLMVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	137014	140930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137097_138707
935482	contig_9177_pilon	+	2496	15	Intergenic	novelGene_32580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	71	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	116	351	2047	2397	16338	18217	FALSE	20	CATTCAGGGCCTGGGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVCVAEAAACLAVCSSRCTSFFLIAFCAAALVAMRRPSAASRSRCCCSSLKLCTLAASTILAVASARILAALNSLHEFSRSLSPSASALIALTRSEVAWARMRACRTISPKHHPWS	1713	18316	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_+_2283_2387_2511_2660_2822_13572_13696_13890_14089_14296_14415_14809_15020_15162_15257_15415_15531_15693_15844_16051_16154_16254_16379_16549_16658_17426_17611_18199
935483	contig_14273_pilon	-	3022	9	Intergenic	novelGene_21150	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	116	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCGCCACCAACGCCGAGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152259	127927	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14273_pilon_-_128267_128776_128857_135378_135514_137925_138049_139058_139185_147795_148027_148889_149551_150872_151982_152041
935484	contig_1725_pilon	+	2809	20	Intergenic	novelGene_24280	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	703.983615397349	2	81	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	377	1134	29	1162	201480	246667	TRUE	20	TACATTGGAGCACCTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPAQARTAAMAKPLTDQEKRRQISIRGIVGVENVAELKKGFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQYYYEKCPKRVYYLSLEFYMGRTLQNTMINLGLQNACDEAIYQLGLDMEELEEMEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEYGIFNQKIRDGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEFMLPVHFYGTVEHTMTGTKWIDTQVVLALPYDTPVPGYMNNTVNTMRLWSARAPNDFNLRDFNVGDYIQAVLDRNLAENITRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVVAATLQDVIRRFKASKFGSTNSTQTVFDAFPDQVAIQLNDTHPALAIPELMRIFVDIEKLTWSKVCTIASSTFGDHL	201451	255860	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1725_pilon_+_201723_207387_207490_209778_209858_218445_218550_236001_236134_239625_239738_240047_240131_244924_245069_245297_245401_246635_246690_247022_247187_247639_247748_248345_248448_248575_248724_248851_248911_249014_249157_250979_251188_252131_252265_252711_252779_255366
935485	contig_3077_pilon	+	1486	10	Intergenic	novelGene_26659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	3524.57404133315	2	76	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	62	1096	9676	17590	TRUE	35	AAAGATTAACAGTGTGCGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEHQEPGEVQEEATCSAAAGMWLRVAQTGFAVLVLLQCCSAYKLVCYYTSWSQYRKGDASCFPDNIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNSLKNRNPNLKTLLSIGGWSFGSQRFSKIASNTQYRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWIYPGRRDKEHFTTLVKEMKAEFAREAQSGRQKLLLSAAVSTGKVTLDSGYDIPQISQHLDFITLMTYQFHGAWRQTTGHHSPLFKGQKDASSDRFNNVDYAVGYMLRLRAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSEAGVGAPISGPGTAGPFTREEGILAYYEVQYLRNRQLAGAMVWALDLDDFRGSFCGQNQRFPLTSTIKDALLAA	9614	18074	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_9701_10174_10205_11276_11479_12013_12071_13019_13171_13863_13986_15137_15262_16144_16328_17449_17894_17987
935486	contig_3975_pilon	-	1997	13	Intergenic	novelGene_54858	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	220.448957937105	1	105	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	249	750	839	1588	2064115	2056837	FALSE	10	CTCCTTGGTGCCTGGCACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGYYNGHTKVAVKSLKQGSMSPDAFLAEANLMKQLQHQRLVRLYAVVTQEPIYIITEYMENGSLVDFLKTPPGIKLTVNKLLDMAAQIAEGMAFIEERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGTFTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYDLMMLCWKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP	2079221	2056427	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059966_2060050_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064111_2064265_2064568_2064719_2064981_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
935488	contig_17144_pilon	-	1234	7	Intergenic	novelGene_29345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2238.84340800235	1	69	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	266	801	350	1150	174597	166152	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFHPIDLVKLEPPTLGTLDPSPEGAPAQPDCLCFHWESWKPSLYMEQKCELRYQPQLGEASWALVTPLPSRTLHHKLCGLLPATAYTLQMRCTRWPLPGHWSDWSPSLELKTTERAPIVRLDTWWRQRQLDPRTVNVQLFWKPMPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTETSPCYRASGFMGWREWEAFRASWDCPIWLGLPPEGPGLSTREGLVSKLKTTPVSGMPEAPLSLLYSWSPSPLCICPVSVDWASQATCTL	183404	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166422_172637_172740_173128_173209_173305_173460_173580_173751_174572_174742_183199
935489	contig_10855_pilon	+	1834	1	Intergenic	novelGene_124344	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	12	45	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	60	AAGTAAGAAGTCATTAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	548356	550190	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10855_pilon_+_548400_550200
935490	contig_5247_pilon	-	2667	1	Intergenic	novelGene_81789	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	16	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CAAATGGAGATACTTTGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	97797	95130	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5247_pilon_-_95100_97800
935492	contig_8377_pilon	+	1451	13	Intergenic	novelGene_35091	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3141.84669687537	1	66	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	303	912	483	1394	161364	180450	FALSE	20	ACGTGAGTCTGTTTTATTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDGFKEPRKYIAAQGPRDETVEDFWRMIWEQKATVIVMVTRCEEGNRVSVQNTGHQWNRVPRLLEMWL	142262	180507	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_142387_143450_143672_161226_161386_164383_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177508_179436_179474_179567_179671_180389
935493	contig_8377_pilon	+	1707	17	Intergenic	novelGene_34978	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	3561.47187741161	1	80	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	253	762	854	1615	161360	179606	TRUE	25	CAGGGTACCAAGACTTTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYVSNKNNTDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGGEEKREVNRECDFFKTDLQYLTEYTLEVCFYNGKFCGPEVKKTIPTSYNSKALIAFLVFLIIVTAIALLFVLYKIYDLNKKRSSNLDEQQELVERDDEKQLMNVEPIHADILLETYKRKIADEGRLFLAEFQSIPRVFSKFSIKDARKSFNQNKNRYVDILPYDYNRVELSEINGDAGSNYINASYIDVSENASWMKLLRISGG	68105	180416	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68139_68219_68330_136291_136373_140869_140976_142257_142387_143450_143589_154868_154992_161226_161386_164387_164590_169245_169307_172896_173006_173646_173682_176592_176703_177253_177345_177430_177527_179574_179666_180383
935494	contig_12790_pilon	-	1944	10	Intergenic	novelGene_35255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTGAGTCGCGGAGCCGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313340	306046	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12790_pilon_-_306137_307244_307339_308741_308840_309576_309754_309871_309922_310030_310160_310364_310492_311027_311078_311896_312033_312347
935496	contig_7119_pilon	+	2314	2	Intergenic	novelGene_40968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_1	0	1	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	69	1163	137044	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	136975	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_137048_138707
935498	contig_16775_pilon	+	2123	15	Intergenic	novelGene_107769	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	319.682080594239	1	118	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	248	747	441	1187	144962	168024	TRUE	40	ATAGTACATTTGATTATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MELPCGLTNLGNTCYMNATVQCIRSVPELKDALKRYAGALRASGEMASAQYITAALRDLFDSMDKTSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEKGEQGQYLQQDANECWVQMMRVLQQKLEALEDDSVKETDSSSASAVTPSKKKSLIDQFFGVEFETTMKCTESEEEEVTKGKENQLQLSCFINQEVKYLFTGLKLRLQEEITKQSPTLQRNALYIKSSKISRLPAYLTIQMVRFFYKEKESVNAKVLKVRC	130368	174738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16775_pilon_+_130505_134066_134219_137074_137112_143932_144041_144954_145066_152199_152259_156923_157055_158971_159053_159349_159436_160117_160233_164974_165041_165182_165280_168016_168146_172805_172867_173984
935499	contig_6227_pilon	+	686	7	Intergenic	novelGene_49776	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	14	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTGAGGAGACACAGCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1204369	1214244	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_1204500_1205856_1206010_1206141_1206185_1206577_1206641_1211210_1211293_1213154_1213222_1214096
935500	contig_3956_pilon	+	2101	10	Intergenic	novelGene_14965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1433.39282391615	1	69	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	162	489	1095	1583	1289515	1290491	FALSE	20	ACTGTGTGGAGCCTACGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281601	1291009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283960_1284049_1284267_1284684_1284864_1285066_1285091_1289039_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935501	contig_3956_pilon	+	2685	15	Intergenic	novelGene_15185	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	1289.20184135577	1	91	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	667	2004	15	2018	1282731	1289548	TRUE	15	GCCGCGGAAATGGCCTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMITGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKERCVRRTCGVCALMSMM	1282716	1290703	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286447_1286524_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289497_1289677_1289758_1289892_1290297
935503	contig_6102_pilon	+	1298	6	Intergenic	novelGene_31937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	477.052030705247	1	72	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	79	240	533	772	394006	394738	FALSE	10	GCTGTGGCTCTTTTCCTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LCLDRWFTLNNGQGQVLLRAQLGILVSQHSGVEAHSHSYSHSSSSLSEEPELWGGLPHVTSSAPELRQRLTHGDSPLEATAGPLGQVKLTVWYYSEERKLVSIVHSCRALRQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNKGTKRKTSQKKRTVNPEFSERFEWELPLDDALRRKLDVSVKSSSSFMSRERELLGKVRGLDLPCLLLHHFLKVMSLKLGPKGRACIASALSPPRPVLGPLLDQREGPYITVYCTAFILLGSWAGT	393078	395264	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394050_394542
935505	scaffold_12124_pilon	+	1684	5	Intergenic	novelGene_22368	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3016.04935097223	1	93	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	642	1041	1682	1508755	1509396	FALSE	40	GCAGTAAAATTATAAGTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSS	1491914	1509398	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1491976_1494270_1494330_1497007_1497127_1506629_1506687_1508010
935506	scaffold_12124_pilon	-	2140	2	Intergenic	novelGene_22401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	50	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTCCCTGAGTCAGCGTGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1510597	1508380	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_-_1509157_1509233
935507	contig_6919_pilon	-	1756	1	Intergenic	novelGene_163984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	8	10	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ACATTCCCAGCAGCAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	58094	56338	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6919_pilon_-_56300_58100
935508	contig_6607_pilon	-	652	1	Intergenic	novelGene_164214	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	25	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	123	372	118	489	280132	279761	NA	50	TGAGAATGAAAACACATCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKIYQANNYQKRAGVAILISDKIDFKTKSTIKDKEGHYIMIKGRIHHEDITIINIYAPNDRAPKYIKQTLTTLKREIDSSTIIVGDFNTPLSVKDRTAKKKLSKDTEDLKVTISQLDLIDIYRTLHPTTAKYTFFSNAHGTFSRIHHILGHRAISTRSKTLR	280249	279597	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6607_pilon_-_279600_280200
935509	contig_2768_pilon	+	1044	1	Intergenic	novelGene_57468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	43	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	114	345	220	564	524353	524697	NA	55	ATGAGAATGAAAACACATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRATNSHLSIITLNVNGLNAPIKRRRVTEWIRKQDPSICCLQETHLRNKDVNLLKVKGWKKIYQANHYQKRARGAILISDKIDFKTKSIIKDKEGHYIMINGRIHHEDITIINI	524133	525177	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2768_pilon_+_524100_525200
935510	contig_10050_pilon	+	2008	1	Intergenic	novelGene_119625	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGTTGAATGTTATTCGGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	218145	220153	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10050_pilon_+_218100_220200
935511	contig_3700_pilon	+	1292	1	Intergenic	novelGene_138059	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACAAATTACCGGCCCTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	88660	89952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3700_pilon_+_88700_90000
935512	contig_15666_pilon	-	1984	6	Intergenic	novelGene_70174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	346.750284787194	1	131	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	386	1161	158	1318	110619	107816	FALSE	15	GTGATGTTGCTTTGATTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLLFEGVLCPGESTADPQAPGPPHPAGEEPLNFRVIQIFSFANHSWAHTQGSGWLGELQTHGWDSVLGTIRFLWPWSQGNFSKEELKNLQALFQLYFHGFTREVQAFAGQFQFEYPFELQISAGCRIRAGEASESFFKGAYQGTDFLSLQGNSWQPSPGAGSRAQNVCRVLNRYRDIKEIVQGLLSNTCPRFLAGLLEAGKAELERQVKPEAWVSKGTTPSPGHLLLVCHISGFHPKPVWVMWMRGEQEQPGTRQGDVLPNADGTWYLRVTLDVATGETTGLYCRVKHSSLGGHDIIIHWDGYSILLILICLTVTVTLIMLIVLEFWFKKQSYILFRLVPDLAMGADTQDPRGSAHQLCSAQESWAKNRYLKKWKTSLSQL	110776	107149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15666_pilon_-_107967_108103_108198_108579_108859_109098_109378_109948_110246_110558
935513	contig_7963_pilon	-	2203	10	Intergenic	novelGene_58479	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	610.290964809733	1	78	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	330	993	609	1601	125592	121740	TRUE	80	AGAAAAAGGAAAAAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKD	126200	120295	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121742_121792_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124051_125563
935514	contig_12923_pilon	-	1946	8	Intergenic	novelGene_30068	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	438.48928965581	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	215	648	281	928	54041	48997	TRUE	15	TGAGGTTCTACTGATCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	57574	45339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_45982_46055_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54144_57281_57332_57446
935516	contig_8377_pilon	-	1922	18	Intergenic	novelGene_34984	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1.41176470588235	1	77	6	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GAGCAATTTCCTCCTCTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	180483	68112	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_-_68134_68216_68281_131428_131569_136288_136381_140772_140974_142255_142386_143449_143588_154866_154998_161250_161386_164383_164588_169243_169307_172896_173004_173644_173681_176591_176704_177281_177343_177428_177523_179555_179667_180401
935518	contig_5686_pilon	+	4951	10	Intergenic	novelGene_45418	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1495.40117248405	1	190	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	416	1251	2460	3710	189037	212533	TRUE	35	AGTAAGGACAGTGTTGACAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAIEAELENLLGEFSIRMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEEMVFLPLIVGLISIKVTELKGLASHILVGSVTCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTPSSGTGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDHSFLSNLPDDIFENGKAAEEKMPLSLSFNDLPNGDCALPSNSAGSPSKTCLTNPEITITPAELNHSSLSSQNEGTDDTSSASSRSSSAEGQEPKSHVEEHTEHKKTALAASEACQQSAGAGANRLFLENNVAEALLQASDEASELKPVELDTFEGNITKQLVKRLTSTEVPVVTERLLFEGSVSGESEGCRYFLDGSLEDAFSGLFLALEPHKEQYKEFRNLNQEVIHLDDILKVTTSKPQQVFQFKSYS	186577	220565	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_+_189098_198550_198595_199758_199885_200410_200560_202871_203002_208031_208726_212486_212666_215305_215475_219533_219670_219761
935519	scaffold_12124_pilon	+	1864	10	Intergenic	novelGene_22302	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3416.85033652664	1	88	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	170	547	1490385	1508039	TRUE	30	GGTCACATGTATACTGGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLVVDRTMSQHSLIHLNRSRIQTLTSLAPPAAFQIPTLLTGQVVEVAGGSPRDDGNQQAESPGVIPGIVGAVVVAVAGAVSSFIAYQKKKFCFKENGEQGDVNMENHQGTNTEPPVQRTLLEKA	1473586	1509459	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473673_1489013_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496348_1496389_1497007_1497122_1506629_1506687_1508010_1508289_1508391
935520	contig_12923_pilon	-	2509	15	Intergenic	novelGene_30110	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2	junction_10	334.617516954898	1	98	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	636	1911	150	2060	77634	48997	TRUE	10	TGTGTCCCATGTCCTGATTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GYTPLPSEAAVEDTQVTYPASAVKDVLCGSGKAKTPTTQEEEAEDLKVDMNKAQDALRLWTVHRDGEVLLRLTKHGPGHEAPITIPDFFRESVSRFGTYPALATRNNDKWEFLNYNQYYQACRKAAKAFLKLGLERFSAVGILGFNSAEWFIAAIGAILAGGLCVGIYATNSPEACQYVIDHAKIPRTKLESLKAIIQYKQPMKETGDNLYFWNDFMELGNSIPDAQLDQIIKSQKANQCAVVIYTSGTTGNPKGVMLSHDNITWTAGAVSRDCNLSLAPEKQETVVSYLPLSHIAAQMLDMWIPIKIGAITYFAQPDALRGSLVNTLHQVRPTSFLGVPRVWEKMQEKIKENTTKAAALKRKVFSWARNTGLRVNNKRMLGGHDTPMGYRMAKTLVFSKVRTALGLDHCHYFISGAAPLTQETAEFFLSLDIPIGEMYGMSESSGPHTVAICENYRIHSCGKILSGCKNMLYQPNKDGIGEICFWGRHVFMGYLEREDATKEVVDEDGWLHSGDLGRMDSQGFLYITGRIKELLITAGGENVPPIPIENLVKAKIPIVSHAMLVGDRAKFLSLLLTLKCEVDSKSGEPLDRLSSEAISFCRHVGSQSSTVSEIVALQDPRVYAAIQKCIDEVNAVAVSNAQKIQKWIILEKDFTIAGGELGPTAKVKRHFITEKYKQQISKLYR	93666	45982	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12923_pilon_-_46397_48961_49071_51056_51304_52199_52340_53854_54073_57097_57332_57446_57629_62784_62962_64467_64618_68196_68281_69713_69784_73224_73314_75647_75878_77618_77720_93602
935523	contig_12570_pilon	+	1755	1	Intergenic	novelGene_79333	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	71	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	85	258	111	368	39601	39858	NA	25	AGCCTCAGAGTGGACAGCCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LYVQTIEGETNSLCKLSANALKKKIDHKLHQTEPKKMKQDPHLTLYTKNTSKRIKDLNIKPKTIKFIEEKLGPTLQALIHGINRIQPITINAQTPTDKLDNWDLLKIKHLCSSKDFIKRVK	39490	41245	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12570_pilon_+_39500_41200
935526	contig_14970_pilon	+	2868	11	Intergenic	novelGene_44985	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	51	junction_6	6051.11858750099	3	27	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	478	1437	129	1565	136145	231550	FALSE	75	TGGCAAAAAAAAAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNKLWWRAAWGLCLVQLSLAQIDLNITCRYAGVFHVEKNGRYSISRTEAADLCKAFNSTLPTLAQMEKALSVGFETCRYGFIEGHVVIPRIVPVSICAANNTGVYILTSNTSQYDTYCFNASAPADKEDCTSVTDLPNTFEGPITITIVNRDGTRYSKKGEYRTNPEDINPSNPTDDDVSSGSSSERTTSGGYNIFHTHLPTADPTKDQASPWVTDDTGDTPATITTASAHDSHTNQRMTTQSQEDSTSWMDFFDPISHPMGRGHRTGGRMDRNDGRGGRRGENLPEDSTTSVEVYTPHFPDTKENRTLTPVTPAQTGSPGVTEVTVVGGSNSDVAGSFPGHQNNKTGKRSHTTHGSESAGHSSGSQEDGANTTANPIRKAQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSRRRCGQKKKLVINNGNGAVEDRKPSGLNGEASKSQEMVHLVNKEPSETPDQCMTADETRNLQNVDVKIGM	136016	232853	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_136212_177266_177433_182324_182459_188757_188830_191970_192205_207681_207823_213685_213893_216613_216674_221180_221253_224295_224375_231345
935529	contig_5686_pilon	-	1703	8	Intergenic	novelGene_45432	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	612	1283	208699	203000	TRUE	35	CGAGCAAAGCCAGCCAGACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	220045	198569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_198595_199758_199865_200398_200560_202871_203002_208029_208720_215303_215473_219531_219668_219759
935531	contig_5643_pilon	+	1170	12	Intergenic	novelGene_38822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_11	2515.80120816575	1	59	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	65	1000	233973	237822	TRUE	40	GTCATGTACCATCAATAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISW	233610	238158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237855_238020
935533	contig_5643_pilon	+	1281	12	Intergenic	novelGene_38816	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2287	junction_1	1926.79802043967	2	70	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	333	1002	68	1069	233973	237983	FALSE	10	CCTCTTTGTTGATTTCATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVKVGINGFGRIGRLVTRAAFQSGKVDIVAINDPFIDLQYMVYMFKYDSTHGKFHGTVKAENGKLVINGKPITIFQERDPANIKWSDAGAEYVVESTGVFTTLEKAGAHLKGGAKRVVISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLKIVSNASCTTNCLAPLAKVIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGKMWRDGRGAAQNIIPASTGAAKAVGKVIPELNGKLTGMAFRVPTHNVSVVDLTCRLEKAAKYDDIKKVVKQASVGPLKGILGYTEDQVVSCDFNGDTHSSTFDAGAGISLNDHFVKLISWYDNEFGYSNRVVDLMVHMASKE	233607	238195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5643_pilon_+_233657_233954_233996_236010_236111_236192_236300_236418_236510_236639_236756_236848_236931_237128_237281_237376_237456_237550_237635_237720_237819_237913
935534	contig_18850_pilon	-	2995	8	Intergenic	novelGene_142436	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	131	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGAACAAGTCTTTTACTGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	182432	176076	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18850_pilon_-_176463_176669_176832_177027_177108_177565_177673_177996_178052_178212_178306_178947_179152_180524
935535	contig_19459_pilon	-	1198	8	Intergenic	novelGene_59881	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5190.72952286977	1	76	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	228	687	54	740	16240	7772	TRUE	10	ATTTTATTCCTGTCTTCTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASADWGYDGKNGPEQWGKLYPIANGNNQSPIDIKTSETKHDTALKPISVSYNPDTAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPLSESYRLCQFHFHWGSANDHGSEHTVDGEKFSAELHIVHWNSEKYSSFAEAASKANGLAVIGALMKVGQANSTLQKVLNALSAVKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLHYWTYSGSLTHPPLHESVTWIVCKEPISVSSEQVEYQR	19018	6678	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19459_pilon_-_7120_7754_7946_10268_10332_11329_11426_12584_12704_15503_15702_16203_16260_18984
935536	contig_4486_pilon	+	1994	10	Intergenic	novelGene_38612	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1352.8780022193	1	94	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	239	1015	385395	412464	FALSE	65	AAAAATTCACATAATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKRLHEKVNIIPLIAKADTLTPEECQQFKKQIMKEIQEHKIKIYEFPETDDEEENKLVKKIKDRLPLAVVGSNTIIEVNGKRVRGRQYPWGVAEVENGEHCDFTILRNMLIRTHMQDLKDVTNNVHYENYRSRKLAAVTYNGVDNNKNKGQLTKSPLAQMEEERREHVAKMKKMEMEMEQVFEMKVKEKVQKLKDSEAELQRRHEQMKKNLEAQHKELEEKRRQFEDEKANWEAQQRILEQQNSSRTLEKNKKKGKIF	376096	413443	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_+_376194_377340_377457_385369_385488_389958_390052_391120_391218_392818_392871_399306_399433_407559_407696_411177_411318_412424
935537	scaffold_12124_pilon	+	2012	9	Intergenic	novelGene_22300	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	3130.97536470267	2	106	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	651	1273	1923	1508755	1509405	FALSE	15	TTTGTTAGTTTGTTTTTAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLPCTPILSAYRYSSISRYSSIARYSSIARYSLHQILLASKYSPVSCTQMLPAHRYSLVPRYSSISRYSHACSYSSTSRYCLHSDIFCIQIPVSRYSALPCIQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILLHIQILPSMQILTCIQILPAPRYFLHPVLPCIPMGALWVNVRSMSRLYSIRDASCFDVGAWFRHGVHLLHIPSNSMDFTEYMLSSLQ	1473585	1509494	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_scaffold_12124_pilon_+_1473669_1486528_1486562_1489030_1489076_1490363_1490409_1491906_1491976_1494270_1494316_1496970_1497122_1506629_1506687_1508010
935538	contig_5623_pilon	-	3566	8	Intergenic	novelGene_154807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	383.390673025917	2	47	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	711	1487	210277	207631	FALSE	15	AAGTGGCCGTGTGGGTTTCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGPSSPRDRLDHGLCLPSLHLHRMTPYGCLSTGDRTGLIEVVLHSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKDALLNWLKSKNPGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDFGHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNNEKFERFRGYCEKAYTILRRHGLLFLHLFALMRAAGLPELSCSKDIQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTKVNWLAHNVSKDNRQ	211689	205551	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5623_pilon_-_207769_208419_208553_208959_209106_209280_209405_210041_210287_210782_211118_211203_211383_211502
935539	contig_3155_pilon	+	1536	5	Intergenic	novelGene_26381	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	1	58	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	61	567	258156	261211	TRUE	20	CTTAATATTTTGATTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258095	262318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261462_261599
935540	contig_16594_pilon	+	4302	10	Intergenic	novelGene_53827	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	111	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	3594	3947	149311	272805	FALSE	15	TTGAATCAGGCTTGTGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MHWWLSLVQLKTLAQAVMGHRASWHWLAAFAGPTWPCSSAESSYCAHLFPIVFLSVGVDEDICSSPWSNDLSMNQSRRLRVHFQLGSFSMDVQIYIPCLAVSKSPFGTLYILPVLAI	115790	273160	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133149_134023_134081_135251_135507_149146_149351_165477_165648_272661
935544	contig_10953_pilon	+	1329	8	Intergenic	novelGene_42587	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	16390.7009126566	4	48	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	77	691	455261	463526	TRUE	25	AGTAGTGGAACACGTCTGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEDQRDLISNHEQLPILGQRPQGPESKCSRGALYTGFSVLVALLLAGQATTAYFLYQQQGRLDKLTFTTQGLQLESLRMKLPKPAMPVNKMRMATPMLMRALPMEGLSQGPMRNATKYGNMPQDHVMHMLLRTDPLKVYPQLKGSFPENLKHLKDTMDGLDWKVFENWMHQWLLFEMSKNSMEEKPTEAPTKDLRAGPDQAGCG	455184	464453	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10953_pilon_+_455338_459346_459520_459700_459781_460340_460404_461127_461224_461550_461639_463488_463529_463817
935545	contig_12046_pilon	+	5920	5	Intergenic	novelGene_83457	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	872	170	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2350	2652	356335	356637	TRUE	15	GTGAGGGATCGGTTTTCCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDHSYHGLHQTDSSTARWCLATTTDCSDWDQNRGSWTELEKDVEQNSNLKKNKQNRFTGLTEWRNPKHMAPGHSFSSVVKSLLKFTVQLMIGQPHNTKQD	196573	360003	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12046_pilon_+_197155_227852_228559_344200_344918_355989_356650_356747
935546	contig_854_pilon	+	2463	17	Intergenic	novelGene_36579	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_11	2846.72698503804	1	121	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	502	1509	84	1592	1679334	1697677	TRUE	45	TAGGAACAAAGCTGAGAAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLLLEPYNKYRFLSNGHVTIPGQQDKDMFQETMEAMRIMGIPEDEQMGMLRVISGVLQLGNIVFKKERNSDQASMPDNTAAQKVSHLLGINVTDFTRGILTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFAIEALAKATYERMFRWLVLRINKALDKTKRQGASFIGILDIAGFEIFDLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFILEQEEYQREGIEWNFIDFGLDLQPCIDLIEKPAGPPGILALLDEECWFPKATDKSFVEKVMQEQGTHPKFQKPKQLKDKADFCIIHYAGKVDYKADEWLMKNMDPLNDNIATLLHQSCDKFVSELWKDVDRIIGLDQVAGMSETALPGAFKTRKGMFRTVGQLYKEQLAKLMATLRNTNPNFVRCIIPNHEKKAGKLDPHLVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRVVFQEFRQRYEILTPNSIPKGFMDGKQACVLMIKALELDSNLYRIGQSKVFFRTGVLAHLEEERDLKITDVIIGFQACCRGYLARKWASLTAEAGIFQLSMSQSSPIS	1679250	1702095	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1679395_1680807_1680904_1681768_1681888_1683925_1684079_1685074_1685249_1686940_1687115_1689338_1689454_1692599_1692794_1693119_1693242_1694459_1694530_1695121_1695283_1697607_1697810_1698222_1698430_1698917_1699053_1700788_1700913_1701175_1701344_1701990
935547	contig_610_pilon	+	1325	3	Intergenic	novelGene_76752	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCCAATCAGATCAGAGTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	213509	235303	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_610_pilon_+_214263_220517_220785_234998
935548	contig_3975_pilon	-	1898	13	Intergenic	novelGene_54857	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	239.735082376823	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	339	1020	48	1067	2066301	2060320	TRUE	35	AGGAGCTCAATAAATGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DHVNRARGLLGWAGTMGCSCSSNPEDDWMENIDVCENCHYPIVPLDGKAMLPIRNGSEVRDPLVTYEGSLPPASPLQDNLVIALHSYEPSHDGDLGFQKGEQLRILEQNGEWWKAQSLTTGQEGFIPFNFVAKANSLEPEPWFFKNLSRKDAERQLLAPGNTHGSFLIRESESTAGSFSLSVRDFDQNQGEVVKHYKIRNLDNGGFYISPRITFPGLHELVRHYTNAPDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWEDEWEVPRETLKLVERLGAGQFGEVWMGEVLQRAHESGGEEPEAGQHVSRRLSGRGQSHEAAATPAAGPAVCRGHPGAHLHHHGIHGEREPGGFPQDPPRHQADR	2079188	2056404	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3975_pilon_-_2057040_2059833_2059933_2060132_2060205_2060294_2060372_2063811_2063992_2064107_2064265_2064568_2064719_2064959_2065064_2065204_2065304_2065577_2065669_2065858_2065941_2066196_2066307_2079146
935549	contig_854_pilon	+	2243	7	Intergenic	novelGene_36243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	3168.34192529082	3	59	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	141	656	543631	562402	TRUE	30	AGATATATGACCTCATCGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLSPAGALQALHTPGAHRETPRLELSPPPHPRPLTPCKPSNVWWWEMELWARPAFSSVTPPTPSRESTSPLCDKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543490	564688	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545993_556118_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563103
935550	contig_5539_pilon	+	2783	1	Intergenic	novelGene_104777	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	9	64	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GAAAAAGATGCGGCAGGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	270795	273578	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5539_pilon_+_270800_273600
935551	contig_11825_pilon	+	1472	1	Intergenic	novelGene_155397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	109	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	204	615	628	1242	15131	15745	NA	75	GAAAAAAGGTAAAAGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTLSISEILLFIFWISNCCFCVISSCEFILAFCSCILSAFSMNLSIFSSFLSAFCFNSWIILNVRDLNSLSVRSSAFSSTGKSSGVYFGRLLEPSCPVFVNVLMLSTVFGAFSGYFPNLLIVDLFYPAFLFYSVMSEQASCGFSVVCSSLGTILFTSVSNGQGQSLRYGTAGQVQLKGSCWDGLFVAGTRADSADRESLQGRFQ	14503	15975	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11825_pilon_+_14500_16000
935552	contig_8310_pilon	+	2483	4	Intergenic	novelGene_75609	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	187.405087088549	1	113	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	125	378	839	1216	316729	324814	FALSE	30	TGATAACAGTTACCTTTCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDFLVTSSQPLSRQEDQSRVVRQFHFHGWPEVGIPAEGKGMIDLIAAVQKQQQQTGNHPITVHCSALSNILERVKAEGLLDVFQAVKSLRLQRPHMVQTLEQYEFCYKVVQDFIDIFSDYANFK	315890	326081	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8310_pilon_+_316759_317718_317886_320606_320713_324739
935553	contig_8377_pilon	+	1079	8	Intergenic	novelGene_35023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	5185.118800914	1	60	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	305	915	163	1077	136354	164511	FALSE	70	AGAAAAAAGAGAAGTAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNLTTAGDNLTLSHNKKYASISVKYSYNNTSKVYTAELKTTDKVKCEPSCQNLIACSLTSVNISGDSCVSPSKVLQLKVPPEPEKFELHDCTDPEEANTSICLEWNIIGKISCKEEGITYKFNCGNESSSHYQIKLEKLDPQKNYTCESEVSYYKSKFIDRRISITTDFGRKPMNLSCPKEANVTEEEITWKPPQTVFHNFTFCYKNNSESNCKCLGPNETKYTLKQLKPYTNYSISVHAYTTGKVQRNGSAESCMFPTKITRPDEVKNLVVTRESDNSIKVNCKEPDNPNGPHKGYNLTIKGGG	68233	164513	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_68330_136287_136397_140774_140976_142257_142387_143450_143589_154874_154992_161226_161386_164383
935554	contig_12312_pilon	-	4850	22	Intergenic	novelGene_63964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	754.066340152824	1	90	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	1066	3201	94	3294	326065	215838	TRUE	40	AGTGCATTTGTATAAATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQADPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDAPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPTKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKAQMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ	326158	213854	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12312_pilon_-_215261_215687_215985_218223_218329_218676_218881_223842_224029_225333_225459_226680_226984_228088_228198_229394_229545_233704_233834_234966_235167_237715_237907_241326_241503_242253_242408_245860_246009_246882_246974_256294_256456_257907_258031_259772_259882_260267_260419_278130_278202_325897
935555	contig_6137_pilon	+	2054	8	Intergenic	novelGene_59273	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_6	1448.42839530525	1	131	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	178	510	1341634	1348126	TRUE	40	TCTTCATTATAAAATGAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KFDTDPVELFEIPVKELTFDQLQLLKLAHVTALKSKDRKESVIEEENSFSENQPFPSLRMVLESLPEDVGFNIEIKWICQQRDGVWDGNLSAYFDMNLFLDIILKTVLENSGKRRIVFSSFDADICTMVRQKQNKYPILFLTQGKSDIYPELMDLRSRTTPIAMSFAQG	1337697	1354902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_+_1337776_1339034_1339075_1341574_1341637_1345122_1345189_1346611_1346749_1347420_1347541_1348119_1348281_1353512
935556	contig_3018_pilon	-	1723	14	Intergenic	novelGene_78877	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	500.300063807865	1	82	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	867	315	1181	600079	570293	TRUE	55	TATGAGACCAGAAGGAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYAVTSPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKRRKKSGEKEQNISKCKKAFREGSRKSSRVKLQRLILHLMVQILDGRQKLKRGWIDMKRQIIISIVKVFRRRHKE	625069	562949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_563044_566733_566844_567962_568081_569956_570088_570203_570428_572321_572361_576713_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583608_585059_585179_600008_600194_624781_624878_624965
935557	contig_17144_pilon	-	2320	13	Intergenic	novelGene_29243	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2421.86283330277	5	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	293	882	591	1472	172736	166916	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKATVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEEHCKCNPLSSRRAAEMTPPLA	181839	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166982_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168996_169099_170744_170934_172528_172740_173128_173209_173305_173313_174927_175001_175973_176271_179700_179786_181794
935558	contig_5961_pilon	+	1687	10	Intergenic	novelGene_144115	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	628.149840581228	2	109	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	322	966	721	1686	175680	202093	FALSE	60	AAATCACAGAGAAGGAACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMMDKNISLIIMDARRIQDYQDSHISDSLSVPEEAISPGVTTSWIEANLPDGSKDRWKTRGNVDYVVLLDWFSSTKDLQLGTTLRSLKDALFKWESKTILRSEPLVLEGGYENWLLCYPQYTTNAKVTPPSRGKNEEVSISLDFTYPSLEEPVPSKPTAQMPPPPLQVDENTELKKDQDERMGPLNIPTPVEPIATSESDVSPTIQPVPVVKNVPQIDRTKKPTLKLSEDRNIKSESTDHEQQSPQDGKVVPDRSTKPVFTPTAATLTNEEKARIHAETALLMEKSKQEKELRERQQEEQKEKLRREEQEQKARKKPEDEEN	113745	202094	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144178_151578_151724_155727_155814_170314_170512_175641_175796_194230_194394_197215_197361_197664_197889_201775
935560	contig_3081_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_133905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	55	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCGTCTTTAATGTGACAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39946	40773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3081_pilon_+_39900_40800
935562	contig_9668_pilon	-	2220	13	Intergenic	novelGene_58192	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	23	junction_5	818.70430746122	1	121	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	586	1761	261	2021	605373	503609	FALSE	15	TATCTTTTCTATGTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGESSDDIDQMFSNLLGEMDLLTQSLGVDTLPPPDPEPTRAEFNYTVGFKDLNESLNALEDKDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKAASQNQRPSASLEESSNFSGAASLGYEAIVAATSIRYYEDDLPPPPANPMLDLPLPPPPPEPLSQEEEAAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDYHVDWCLYEIYPELQIERLFEDHENVVEVLSDWTRDTENKLLFLEKEEKYAVFKNPQTSRDLACFIQFENVNVYYGIQCKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDARTLNQWITGVRIAKYGKTLYDNYQRAVSRAGLASRWTNLGTVNPATPAQLSTGFKPGTSQPNGQIPQAAHSVSAVLAEVKRQVEPPKNNVPALGNQDLKAPRAYHLPKSSQPPPPPIRRSSDTSCSPVLPSKPKSTAGVFPAPPDDFLPPPPPPPLEEVDLPLPPPPPPPDFHEAPPDFVPPPPLATAGVMGSLLPPPPPPPTLAPESRQLPHTVARKLPVPPKRQENPGPPSGGESGEQDFMSDLMKALQKKRGNMS	669957	503409	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9668_pilon_-_504125_511992_512097_522286_522402_523377_523477_545598_545710_573564_573687_574803_574964_580634_580713_585700_585997_598962_599051_605301_605374_610344_610514_669866
935564	contig_5434_pilon	+	1500	2	Intergenic	novelGene_74680	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	72	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	724	1218	340461	340955	FALSE	40	GCAGAAACCATGCAGGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPISMQNKTPDNFPAEEKALELTDREFISLIFRIIQELKQKADRNEEKIDKFMEKADKFMENTDKKMKEFKKIIQEQNAKINSQLENIQKQQLEIKKINNKISEMDSVIEGLRSRSETMEDRISEIEDKHLATTLSKEKSEKRMKKNEETLRIMWDKIKSKTM	338994	341237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5434_pilon_+_339308_340050
935565	contig_16594_pilon	+	461	3	Intergenic	novelGene_53871	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	36	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CCGACCCCGCCCCCACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	149277	272882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_149354_165482_165649_272663
935567	contig_10093_pilon	+	1743	1	Intergenic	novelGene_147512	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	104	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATATCCGAATCTGAGTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	113281	115024	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10093_pilon_+_113300_115000
935569	contig_4180_pilon	+	1096	5	Intergenic	novelGene_8390	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3662	junction_4	432.750144425164	3	52	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	178	537	24	560	875200	888134	FALSE	55	TAAAAAAAAAAATCCTGGGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	875176	888670	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
935570	contig_13786_pilon	+	2271	1	Intergenic	novelGene_174575	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	148	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATTTGGTTGATCCAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	134205	136476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13786_pilon_+_134200_136500
935571	contig_3956_pilon	+	3034	15	Intergenic	novelGene_15098	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1315.93567239343	1	89	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	399	1200	413	1612	1284132	1288038	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGHLGPAERARKVEDMMKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQVASSRSRASTSSRGLASCTWRSA	1281604	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283834_1284054_1284267_1284684_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287538_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935572	contig_13740_pilon	-	983	8	Intergenic	novelGene_34716	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	3550.34983042057	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	171	516	154	669	165243	160873	TRUE	35	GTTATGACAACTATGGAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEREKEQFRKLFIGGLSFETTEESLRNYYEQWGKLTDCVVMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVCKCLAEIPYHQWS	165396	158661	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161048_161270_161574_161722_161919_162031_165237
935573	contig_4180_pilon	+	1164	7	Intergenic	novelGene_8353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	53	junction_1	1943.58463212236	1	55	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	233	702	41	742	865772	888134	FALSE	25	AATAAAGCTTTGTTTTTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNRSCVGNCCCSVLGSAGSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	865731	888556	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_866080_866126_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886468_888085
935574	contig_5023_pilon	+	2151	14	Intergenic	novelGene_7340	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1892.26910842465	1	105	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	1033	1707	629246	646990	FALSE	40	ACGGAAGGTGTAATGGAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSLGVNPRVNHLYSDLSDALVIFQLYEKIKVPVDWNRVNKPPYPKLGGNMKKLENCNYAVELGKNQAKFSLVGIAGQDLNEGNRTLTLALVWQLMRRYTLNILEEIGGGQKVNDDIIVNWVNETLKEAGKSSCISSFKDPKISTSLPVLDLIDAIQPGSINYDLLKTENLDAEEKLNNAKYAISMARKIGARVYALPEDLVEVNPKMVMTVFACLMGRGMKRV	607937	647434	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_608100_609594_609725_611686_611820_614402_614485_616415_616582_618589_618668_622527_622624_625694_625845_629210_629290_630199_630315_631415_631550_639072_639197_643413_643539_646857
935575	contig_854_pilon	+	731	2	Intergenic	novelGene_36740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	31	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTTGTCATAAATGATAGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1715098	1715995	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_1715137_1715302
935576	contig_3095_pilon	+	1139	5	Intergenic	novelGene_75131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	5	32	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	10	735	147280	151151	TRUE	15	GTCTTAGGTGGAGTTTTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147270	152241	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935577	contig_13740_pilon	+	1601	12	Intergenic	novelGene_34697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	975	1394	160875	161953	TRUE	15	GTTGTGAGAACTGCTGCTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTIDGMVFLQYNFIHGIMVIKSNKAKASFLSRLPISNYLNGINFSIFLEIISKMMFLSIFFNSTNKQLLHSYVSAWLSRFPLATARFGSTTRPSMEWGLAAMAESTSAMDEKVTKPNPLDLLLAGSLITTQSVSFPHCS	156855	165336	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_+_157299_157451_157538_158276_158385_158637_158749_160063_160144_160655_160733_160805_160904_161058_161271_161576_161719_161916_162031_162127_162162_165240
935580	contig_15063_pilon	+	2931	3	Intergenic	novelGene_13010	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	74	junction_1	2955	21	20	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	331	996	1820	2815	35557	36661	FALSE	55	TTAGAAATAAAAATATCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCHTQIYTHATQTYTPHVHAYTHTHIHRHDHRLPEPAKGSPSFSVGREFLPAGVPRVPLPQDSCSKVHHCALGKPHLPKLSLLLDIDLNSLLKAAPLITISIFAIPPSFADIFLTKSAKLSCLVTDLTTYDSLHISWARQNGEVLNTHINISESHPNETFSATGETTVCMEDWESGETFTCTVTHADLPSPLKQTMSKPKEVAKHAPAVYLMPPTREQLSLRESASITCLVKGFSPPDVFVQWLHKGQPVASNNYVTSTPMPEPQAQGFYFTYSILNVSEEDWSAGDTFTCIVVHEALSHQVTERTVDKSTGKPSLYNVSLVMSDTANTCY	29446	36777	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_+_30323_34613_36158_36266
935581	contig_4180_pilon	+	1020	5	Intergenic	novelGene_8397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1869.99304811542	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	83	252	54	305	875290	886190	TRUE	75	CAAAAACAACAACAACAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPK	875236	888639	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_882860_882931_886082_886217_886332_886468_888085
935582	contig_4180_pilon	-	878	5	Intergenic	novelGene_8400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	35	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGGATAGAGGATGAAGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	888529	875280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_-_875362_882858_882929_886080_886187_886317_886500_888090
935583	contig_4180_pilon	+	992	4	Intergenic	novelGene_8394	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	48	junction_1	1733.86985286286	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	TTAAAAAAAAAAATCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	875209	888669	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875364_886082_886187_886317_886468_888085
935584	contig_4180_pilon	+	1233	6	Intergenic	novelGene_8348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1838.64391332308	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	202	609	57	665	865772	888108	FALSE	55	AAAAAATCCTGGGCAATAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PENQRPSCCARSYFSHPTMSSNLVEQPPPLHNNNNNCEEGEQPLPPPAGLNSSWVELPMNSSNGNDNGNGKNGGLEHVPSSSSIHNGDMEKILLDAQHESGQSSSRGSSHCDSPSPQDGQIMFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLLEND	865715	888676	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_865872_875179_875364_882860_882931_886082_886187_886317_886452_888091
935585	contig_14441_pilon	+	1132	5	Intergenic	novelGene_100491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	131.73553051474	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	544	1092	116728	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	92187	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_92235_92403_92708_116535_116963_117220_117344_126514
935586	contig_13740_pilon	-	1479	9	Intergenic	novelGene_34709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	4604.86735524217	1	58	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	297	894	204	1097	161718	157474	FALSE	70	TAAAAAAAAAAAAAATGCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDSAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTVKKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVLQKYHTINGHNAEVRKALSRQEMQEVQSSRSGRGGNFGFGDSRGGGGNFGPGPGSNFRGGSDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGSPGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYDNYGGGGSYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY	165426	157091	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13740_pilon_-_157536_158270_158382_158640_158761_160071_160135_160648_160730_160801_160904_161058_161270_161574_161726_165230
935589	contig_17144_pilon	-	1664	12	Intergenic	novelGene_29420	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2110.7272061645	1	82	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	235	708	754	1461	172541	166277	FALSE	30	AAGAAATTCTTGAGTGTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCLQERVWSVS	181849	166073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166309_167591_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172661_174687_174761_174876_175001_175973_176271_179700_179786_181794
935590	contig_3956_pilon	+	2121	9	Intergenic	novelGene_14918	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1120.1747003816	2	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	365	1098	500	1597	1287410	1290491	FALSE	20	TGGAGCCTACGCGACTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281600	1291015	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283892_1287307_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935591	contig_6227_pilon	+	2647	1	Intergenic	novelGene_49619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	36	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCTATTTGTAGCTATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	336301	338948	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6227_pilon_+_336300_338900
935592	contig_8476_pilon	-	729	1	Intergenic	novelGene_121316	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	49	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAAAAAGGTAAAGGAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30796	30067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8476_pilon_-_30100_30800
935593	contig_20527_pilon	+	1909	4	Intergenic	novelGene_138617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	1	18	junction_1	1356.91815850805	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAAAGAAGACCAGATTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	24462	28373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_20527_pilon_+_25023_25436_25614_26238_26346_27308
935595	contig_14441_pilon	+	1158	5	Intergenic	novelGene_100345	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	474.426693494369	1	52	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	570	1118	125667	126705	FALSE	5	GCCGTGTGTCCGGGGACTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	6539	126745	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_6913_121643_121691_125517_125902_126159_126283_126514
935596	contig_14450_pilon	+	2811	2	Intergenic	novelGene_48980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	70	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	2250	2612	1042420	1042782	TRUE	5	AGGTGCTGCCGCTTCCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTTFHTCLLGADVSPVALMVTSLRVQPRVSDKLEEATVILAFSVLSSENEKLFVKQLSVNMSSMASISFKNKILKGPKTKERGKLKKKKKERKENQTKKEKKKINKLLILPQIIRNLLTC	1040170	1043026	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14450_pilon_+_1042833_1042877
935597	contig_9617_pilon	-	428	1	Intergenic	novelGene_179257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	4	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	CTAAAGATAAGGGTAAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	230420	229992	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9617_pilon_-_230000_230400
935599	contig_7963_pilon	-	2228	9	Intergenic	novelGene_58487	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	715.321595071056	2	119	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	430	1293	750	2042	123938	120628	TRUE	40	ATCCAAGCCCAAGCGGAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126207	120318	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121956_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124040_125559
935600	contig_7963_pilon	-	2022	9	Intergenic	novelGene_58464	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	586.790941796991	2	96	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	431	1296	497	1792	123938	120628	TRUE	50	AAAGGAAGTCAGAGAAGCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQDEQELVVTIPKNSHKKGAKLAAFQGSITSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVSAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPSSPPGALEPKAARLPPVRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTALPPWSGQIIF	126229	120274	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_-_120366_120488_120736_120939_121069_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123132_123746_124056_125850
935601	contig_6898_pilon	-	2015	5	Intergenic	novelGene_35772	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	57	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CCAAGGCCTGTGGATAAACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	127702	124377	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_-_124439_124775_125002_125479_125528_125695_126501_126827
935603	contig_14970_pilon	+	1540	6	Intergenic	novelGene_45131	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	92	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GATGTCTGCAAAGCCTGCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	268160	315708	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14970_pilon_+_268978_280561_280689_285668_285804_290932_291166_311915_312054_315618
935604	contig_17597_pilon	+	2352	2	Intergenic	novelGene_179258	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	65	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	990	1442	6400	23233	FALSE	35	ATAATATTGGGAGGCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDYGTEKTENTERIIEELLTENFPNIMKDEKLAIQEAQRTPYRRDPKRKSPRHIIFTLAKTKDKQRILRAAREKQEVTYRGETIRLSSDYSAETMQARRQWDDIYKILKEKNCQPRIIYPAKLSFKFDGEIRSFPDKQKLREYAKVKPN	5410	24143	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17597_pilon_+_6421_22801
935605	contig_3956_pilon	+	2244	12	Intergenic	novelGene_15162	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1327.83715271574	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	25	594	1281682	1286416	TRUE	30	TAAAAGGTTTATTTGGGTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNLRY	1281657	1290827	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284213_1286404_1286606_1287276_1287506_1288000_1288077_1288874_1289038_1289081_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935606	contig_6898_pilon	+	2697	8	Intergenic	novelGene_35723	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	2934.58431503353	3	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	157	474	437	910	124380	125646	TRUE	15	CTTTACTGTGACTTGATCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELANARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM	59565	127701	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_59680_104552_104637_112970_113077_123021_123145_124370_124464_124782_125008_125481_125650_125917
935608	contig_4425_pilon	+	402	1	Intergenic	novelGene_178174	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	33	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTTTGACCCTTTTTCTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	176553	176955	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4425_pilon_+_176600_177000
935609	contig_854_pilon	-	2705	12	Intergenic	novelGene_36709	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2.29983829830428	39	29	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	129	390	2136	2525	1710643	1709595	TRUE	15	CTCCTTGAAGGAGTTCTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLFSFFSFSLACARISSREARVSSSSRMQSFIWAWGFRSCLMASSRFLLAESMWASRSFKSISSFFRAAMAIDRCFLSSSSSASISRTCRTSCFFFSSLCSSRPCRSRSNWAFMACRFTSSRSLASSVA	1716403	1705372	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1705380_1709248_1709336_1709508_1709719_1709988_1710148_1710536_1710670_1711564_1711653_1711752_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305_1713477_1714856_1715071_1715208
935611	contig_12605_pilon	+	1026	5	Intergenic	novelGene_64191	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	1820.46608043105	2	46	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	216	648	379	1026	4816	6240	FALSE	10	GAGGGGTGTGGGGTCTGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSGR	3873	6240	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795_5072_5728_6005_6124
935612	contig_11115_pilon	+	1688	7	Intergenic	novelGene_102836	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	483	junction_3	502.906441486773	1	80	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	545	1635	54	1688	165608	173238	FALSE	10	TGAGCTGCGGGCCTCTGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVPLGPLLWARQSLLSLLLLVCCLLPPGAQGQASSLRVEPQDPVVPTGGSLLVNCSADCPNPSQIALETALSKELVDSGLSWSAFQLSNVTSDSKIICSSFCSGNQITSTTGITVYRLPERVELAPLPPWQPVGDNFTLRCQVWGGAPRANLTVVLLRGQKELSRQPAVGEPAEVTATVPASREDYGASFSCRTELDLRHQGLGLFENSSTSRQLRTFALPMTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHCQAVSSQGMTTVEVVMEVQDWNARSVTITMAVLVVLGLVIITAALLYVFGVPKRSGMYHVKDRSTSLPLTSEQPDGLAGEEPS	165554	173238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171029_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172964_173047
935613	contig_12605_pilon	+	969	5	Intergenic	novelGene_64167	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	3502.04572357358	2	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	197	591	379	969	4816	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3867	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3955_4263_4535_4795_5072_5728_5965_6138
935614	contig_3956_pilon	+	1413	9	Intergenic	novelGene_15257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1522.09237153991	1	69	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	272	819	141	959	1285728	1290491	TRUE	15	GTGACTGTGTGGAGCCTACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1284844	1291006	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287368_1289791_1289892_1290297_1290726_1290786
935615	contig_3956_pilon	+	1390	8	Intergenic	novelGene_15256	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	1619.40834496896	1	65	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	193	582	1	582	1284841	1286609	TRUE	40	GAATAATAAATTTGGTATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKKLWGDRYFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQR	1284840	1290984	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1284864_1285066_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286669_1289765_1289892_1290297_1290723_1290786
935616	contig_3956_pilon	+	2077	10	Intergenic	novelGene_15259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_9	1175.99744897682	1	118	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	595	1788	123	1910	1285728	1290847	FALSE	20	GTGGAGCCTACGCGACTTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YFDPSNGKFSKSATSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRPEGGHPGPGQLPGQIVGGPRSRQRPAALGGTRPVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQGLIWLVGVGHLTLFFSRFFRGKLKHPKKFKINALKGLFG	1285065	1291014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1285173_1285712_1285827_1286084_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288077_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289803_1290441
935617	contig_10990_pilon	+	3289	22	Intergenic	novelGene_7439	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	457.236929804805	1	174	11	FALSE	0	NA	NA	A	coding	472	1419	1638	3056	731967	751474	TRUE	20	AGATCGACCTGGATCCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKEKSKKQGEGSSGVSSLLLQPQPVPGPEKENVRTVVRTVTLSRDEPLVKLSLTERLGKRKVSVGGDSDPPLKRSLAQRLGKKVEVQVSKSLKERLGMSTDPNSEAATEKVTKVGEIHVKTLEEILLERANQKRGELQTKLKTEGPSKADDSTSGTRNSSSIRIKTFSEVLAEKKHRQQEAERQKSKKDVTCIKLKTDSEIKKPVVLPPIVASKGLSEEPAGKTKSMQEVRIKTLEEIKLEKALRVQQNSEGSSGAQPQPEGMPGARRLLRIPKRTGIKEEKKLQEGSEVASQSSVTTAEAKEVSDDTTGGDIIKIQVKRCETTREKHMQKQQERGTPQKEKSVLTPLQGDVASCNTQVLEKPVLTTVPAVAWHPTKRPPTKSSQKVEVETSGIGDSILNVKCATQPLEKRGKAKPKVNVKPSVVKVVSAPKLVPKRKAVEVHPAVIAAVKPLSSSGILQESPAKRAAVTPL	708529	752073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_+_708672_709189_709253_709348_709396_714557_714612_715525_715994_722232_722433_722635_722699_723526_723633_729671_729796_731217_731422_731545_731659_731913_731995_733027_733130_733944_734008_736162_736226_738884_738954_743883_744388_744699_744780_749169_749501_750918_751086_751462_751520_751885
935618	contig_9924_pilon	+	1407	2	Intergenic	novelGene_175923	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GTTGAGGGCTCCTAGATTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	39136	40636	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9924_pilon_+_39523_39615
935619	contig_7963_pilon	+	3555	14	Intergenic	novelGene_58448	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	64	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	AATGGCGCCGCTGAGCTCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	117929	126292	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7963_pilon_+_118340_118611_118735_118954_119260_120105_120366_120488_120735_120938_121068_121168_121257_121583_121959_122054_122270_122349_122489_122993_123131_123406_123502_123747_124053_125564
935621	contig_16594_pilon	+	3257	9	Intergenic	novelGene_53838	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5	80	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CTGTTCGCTGCTCGGCTCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	116295	335657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124991_132996_133151_135250_135525_149226_149351_165477_165648_335582
935623	contig_16098_pilon	-	1251	9	Intergenic	novelGene_46041	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	947.263393940672	1	73	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	224	675	83	757	352350	349366	TRUE	15	ATGGCTTTATTTTCTGGTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFLVLPLGKTGRVDKNVPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLTLPLREPVVTLEGHTKRVGIVTWHPTAQNVLLSAGCDNVILVWDVGTGAAVLTLGPDMHPDTISTCRATALSGTLRSLPRPRSCTFSPCSAPRSPSVAWATCPNVAWR	354071	348306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16098_pilon_-_348518_348845_349062_349172_349221_349346_349503_350334_350422_350512_350643_350765_350889_352152_352352_353990
935624	contig_4812_pilon	-	639	6	Intergenic	novelGene_103675	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	8190.93589280248	1	44	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	AGGAAAAAAAAAAAACATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	82624	79069	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4812_pilon_-_79238_80221_80339_81179_81281_81547_81739_82268_82305_82598
935625	contig_3956_pilon	-	1787	7	Intergenic	novelGene_15269	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	63	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	265	618	1290644	1289885	TRUE	20	TAAGGGGGCCTTTGGGATCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGPRRHAEGQAGRGDVSRREKNVMTWGCGHALAESHPGLPAAAASEGHLQFVQEVVQGRDALLQAFALAGLGHHLAGAAGGVEGVSGQDLPVVEHTLGEGLAARVRPQVSREAK	1290908	1286442	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1286604_1287274_1287533_1287965_1288077_1288875_1289230_1289514_1289687_1289771_1289891_1290296
935626	contig_16496_pilon	-	1361	3	Intergenic	novelGene_5220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1982	2	48	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	2	313	3594	1131	FALSE	20	TTTTGTATTTGGTTAACCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNSIAIY	3595	82	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1149_1240_1354_3413
935627	contig_3747_pilon	-	2859	8	Intergenic	novelGene_24790	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATTTCAACAACGATCCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	205182	200983	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3747_pilon_-_201560_202129_202204_202307_202455_202632_202732_202888_203127_203227_203384_203496_203646_203762
935628	contig_854_pilon	-	1092	8	Intergenic	novelGene_36717	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	2.79941684889506	7	37	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	198	692	1713144	1710659	TRUE	20	CCTGAAGCTCATCCTCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFIASAVSVASSSSRCSFRREALARWASSSASSSCRLSCFRRVDALSAWSLNCSAFLRSSSTCSMTSFSFFSARRTCLQAAWRSLVSLSSCSSSCAILASRAAMEALYLDLTVPSISCSLTLSSLFWRSNCCRAFSFFWALLRSRFRSVLIWSICRFAFFSRSFTSSVLLCSSSSSSSSWAMRASRRRFSSNARAPLPLLLAISSASSSRSCWAWRLARSAAASSSCS	1713456	1709599	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1709718_1709987_1710148_1710536_1710670_1711564_1711655_1711753_1711877_1712276_1712486_1713082_1713191_1713305
935629	contig_15518_pilon	+	1645	4	Intergenic	novelGene_127602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	388	junction_3	126.323218592449	1	99	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	151	456	583	1038	15096	38055	FALSE	80	CAAAAGAAAAAGAAAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVTGQEELQVIQREKSVSVAAGEAVTLPCVVSSIRPVGPIQWFRGAGPDRQLVYSFKGGLDHLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSAKPSPPVVSSPSARTTPGQTVTFTCESHGFSPRDVTLKWFRNGNELPALQTIVVPPGDSVSYNVSSRTQVMLTPEDVHSQVICEVAHSTLQGSLRGTAKLSEIIRVPPTLEVTHVPTQGNQVNVTCQVKKFYPKSLELTWLENGNVSRTDSAWIPTEDKDGTYNLKSWILVNSSAHREDVVLTCQVVHDGQAAVTKNLTLKFTAPLKDQSTEPTPAPSFLL	11048	38662	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_14886_15202_15808_16139_38035
935630	contig_4103_pilon	-	1047	11	Intergenic	novelGene_51928	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	384.37899266219	1	49	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	135	408	67	474	83668	80996	TRUE	25	TGTATGATCATTTAGTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDEYADTDIPTTLIRSKADCPTMEAQTTLTTNDIVISKLTQILSYLRQGTRNKKFKKKDKGKLEEKKPPEADMNIFEDIGDYVPSTTKTPRDKERERYRERERDRERDRDRDRERERERDRERERDREREEEKKRHSYFEKPKVDDERRVPPRTWVC	83734	77569	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4103_pilon_-_77717_77801_77837_79071_79181_79381_79471_80266_80325_80570_80662_80951_81029_81990_82211_82373_82414_82717_82827_83662
935631	contig_12677_pilon	-	92	1	Intergenic	novelGene_110831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	0	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GGCCTACTTCACATTGCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2529	2437	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12677_pilon_-_2400_2500
935632	contig_3942_pilon	-	814	6	Intergenic	novelGene_128698	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	99	416	430075	429465	TRUE	25	GCAAGAGTCCTCTGAATCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCAEVIQGPRAGSRKNGGSWVFTAVTGNRLPSGTWSQFGRHLASHPGGDSSEGYRALTPLTTTQGTYLWGGCRASVSWALTCMSCVPRSPIAHSVMVSEDTSGA	430173	426550	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3942_pilon_-_426706_427974_428042_428244_428323_428497_428586_429454_429629_429921
935633	contig_3956_pilon	+	905	3	Intergenic	novelGene_15151	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1152	1	67	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTATGGTGGTGACTGTGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1281633	1290998	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1289738_1289892_1290297
935634	contig_16496_pilon	-	1311	1	Intergenic	novelGene_5116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0		NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1311	0	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_0_1300
935635	contig_11816_pilon	-	1363	1	Intergenic	novelGene_98558	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	93	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	970	1335	1158799	1158434	NA	0	TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFNFWISNCCFCIISNCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFSINLSIFSSCLSAFCLSSWKIPSISDLSSLSGTSSVFSSTGELSGVLVWTPVGAILSCFRKCLDIICCFRGIQ	1159768	1158405	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11816_pilon_-_1158400_1159800
935637	contig_15327_pilon	-	559	4	Intergenic	novelGene_70699	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3520	junction_3	1257.80664474138	5	7	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	52	462	901528	900904	FALSE	20	CGTTTGTACTTAAGTCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	902079	900806	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_901033_901126_901281_901400_901536_902035
935638	contig_14925_pilon	-	1621	4	Intergenic	novelGene_55348	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2000	junction_2	112.961153598138	1	96	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	137	414	36	449	116065	114666	TRUE	10	CATTGTGTGCACTTGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SQPPTKPSVFVMKNGTKVACLVKDFYPKDISITLNSSKSIIEYDPAIVVSPSGKYSAVKLGQYEDSDSVTCSVQHNNEILNSPDMEPKISHSGPREPENKEETSKNCHEPKVHTRKVNMMSLTLLGLRMVLAKSVAINFLLTAKLFFF	116100	112105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14925_pilon_-_113277_114664_114779_115150_115208_115821
935639	contig_8552_pilon	+	2074	1	Intergenic	novelGene_80107	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	11	67	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTAGTTTTGATTTGCATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	561581	563655	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8552_pilon_+_561600_563700
935640	contig_5961_pilon	+	649	6	Intergenic	novelGene_144116	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	476.232548236678	1	28	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	147	566	144074	202040	FALSE	60	GAAGAAACAGAAGAGAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPAVASVPKELYLSSSLKDLNKNYVQSALKLFKKAEESRLDRDEERAYVLYMKYVTVYNLIKKRPDFKQQQDYFHSVLGPSNIRKAVEEAERLSESLKLRYEEAEVRKKLEEKDRQEAEQLPNKKKNFGKGNRKNRKRN	113749	202123	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5961_pilon_+_113831_144008_144142_151578_151724_155727_155814_170314_170380_201984
935641	contig_10428_pilon	-	4399	4	Intergenic	novelGene_162597	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	271	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	176	531	3759	4289	157620	157090	FALSE	20	TACTTTTTGTGTGTAAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAAQSGKQFHTQTELHSLSGRSKDGAQSLVFEQKEREVVRGKEEIKRSGKKQHRQPANGTQGVVHCRPVESKQSVLPSQETVAAGSRGGRVGMKKYRGWESIYRCLPVVLSPPGSSVKLLSHTPYLLVSDRSPRWWIHAALADRGPLHVCLLALCSLSISYSIWCLAEFFLSSFVV	298111	156979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10428_pilon_-_158518_258693_260253_262923_264145_298030
935642	contig_5041_pilon	-	836	7	Intergenic	novelGene_27102	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	701.292774492619	1	45	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	714	121	834	616721	576561	FALSE	40	AGAGGTCCAGACTTTAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSFQEVPLQTSNFAHVIFQNVAKSYLPNAHLECHYTLTAYIHPHPKDWVGIFKVGWSTARDYYTFLWSPMPEHYVEGSTVNCVLAFQGKNFKIEKTMKEKEELLKLIVVLEKETTQLREQVGRMESELNQEKEKCDQLQAEQKGLIEVSKSLKMENEELKKRYSDATSKALQLEEDIVSVTHKAIEKETELDSLKDKLRKVQHEREQLESQLKTEKDEKELYKVHLKNTEIENTKLV	636100	576558	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5041_pilon_-_576603_580873_580965_581050_581200_594960_595120_605327_605439_616559_616729_635987
935643	contig_5352_pilon	-	1212	1	Intergenic	novelGene_177070	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	80	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAGGGGTAAATATTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	244892	243680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5352_pilon_-_243700_244900
935644	contig_8600_pilon	+	2760	1	Intergenic	novelGene_125740	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	71	436	111222	111587	NA	30	GGAATCCCCGCAATGTGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TISLISHASKILLKIIQKRLQQYMNTELPEIQARFRRRHGTRDIIAGVRWILAESREYQKDVYLCFIDCAEAFNCVDHNKLWMTLRRMVIPEHLIVLLRNLYIDQEAVIQTEQGDTAWFKVRKGIHQGCILSPYLLSLCAEQII	111151	113911	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8600_pilon_+_111200_113900
935648	contig_10990_pilon	-	368	2	Intergenic	novelGene_7491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	11	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	90	AAAAAAAAAGAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	722265	715658	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10990_pilon_-_715994_722232
935649	contig_2100_pilon	-	781	5	Intergenic	novelGene_50761	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	672.670238675683	1	47	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	45	138	332	469	1172416	1171931	TRUE	25	GCCATGTATACTACAGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DLDFKSPDDPSRYISPDQLADLYKSFIKDYPVVSIEDPFDQDDWEAWAKFTASSGIQVVGDDLTVTNPKRIAKAVSEKSCNCLLLKVNQIGSVTESLQACKLAQSSGWGVMVSHRSGETEDTFIADLVVGLCTGQIKTGAPCRSERLAKYNQILR	1174299	1170008	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2100_pilon_-_1170317_1171926_1171994_1172341_1172451_1173171_1173374_1174204
935650	contig_13123_pilon	+	1814	5	Intergenic	novelGene_136902	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	268.156670623723	1	64	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	111	336	139	474	439015	444679	TRUE	40	TAACAACTTGCAAATCAGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCIHLENIFDWNVKQLFLYLSAEYSTKNNALNQVVLWDKIVLRGDNPKLLLKDMKTKYFFFDDGNGLKGNRNVTLTLSWNVVPNAGILPLVTGSGHVSVPFPDTYEITKSY	434449	446080	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13123_pilon_+_434553_438979_439102_443433_443550_444546_445475_445535
935651	contig_18194_pilon	-	2446	3	Intergenic	novelGene_55957	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	6	junction_2	116.5	1	75	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	342	1029	209	1237	18764	4642	FALSE	40	GAGAAGGAACTATCTCAGAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLSPRRHQVEPPRESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	18972	3432	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7162_18721
935653	contig_6296_pilon	-	2905	4	Intergenic	novelGene_168792	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	91	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCAACACCTGCAGCCCACAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	273966	270335	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6296_pilon_-_270685_271006_271595_271873_272495_272619
935654	contig_7297_pilon	+	2711	3	Intergenic	novelGene_169697	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	62	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	AAGGGAAAAAAAAAAAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147406	151014	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7297_pilon_+_147493_148153_150447_150682
935655	contig_16622_pilon	-	1860	4	Intergenic	novelGene_48475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1420.6170021039	1	93	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AAAACAAAAAACTTCTACTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	121903	111924	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16622_pilon_-_113041_113602_113739_115153_115295_121436
935656	contig_10482_pilon	-	629	3	Intergenic	novelGene_152835	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	19	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CTAGAATCATTGGAACCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	126326	122347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10482_pilon_-_122474_123192_123310_125940
935657	contig_17074_pilon	+	2460	8	Intergenic	novelGene_145120	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	210.615424750556	1	134	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	74	664	208015	223677	FALSE	45	AAGAAAAATTTGAAGCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAANYSSTSKRKEHMKTTASPQPGFLERLSETSGGMFVGLMTFLLSFYIIFTNEGRTLKTATSLAEGLSLVVSPDSIHSVAPENEGRLVHIIGALRTSKLLSDPNYGVHIPAVKLRRHVEMYQWVETEESREYTEDGQVKTETRYSYNTEWRSEIVNSKNFDREIGHKNPSAMAVESFTATAPFPKSWSETGLAPA	207941	225473	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17074_pilon_+_208027_212341_212492_213418_213554_214122_214218_215061_215112_215404_215475_216283_216324_223638
935658	contig_6220_pilon	-	864	1	Intergenic	novelGene_177235	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	3	47	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCATTCTTATAATAGTGGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	71912	71048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6220_pilon_-_71000_71900
935659	contig_10323_pilon	+	916	1	Intergenic	novelGene_123603	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	40	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	TCCCCCTGTGGGCTGTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	459157	460073	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10323_pilon_+_459200_460100
935660	contig_9609_pilon	-	911	2	Intergenic	novelGene_23012	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	53	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGCCTTCAAAGGACTCCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	319314	317914	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9609_pilon_-_317949_318437
935661	contig_8914_pilon	+	1911	6	Intergenic	novelGene_112854	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	46	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTAAGGCGCTTGTTCTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	263412	268915	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8914_pilon_+_264679_264835_264951_265588_265800_267325_267508_268075_268179_268881
935663	contig_15838_pilon	-	636	1	Intergenic	novelGene_174336	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	29	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	CCTTAAAAAAAAAAAAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	204485	203849	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15838_pilon_-_203800_204500
935664	contig_16103_pilon	-	1450	2	Intergenic	novelGene_118837	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	69	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743692	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723536_743496
935665	contig_17144_pilon	+	2665	13	Intergenic	novelGene_29501	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	135	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	919	1251	167657	167989	TRUE	10	CAGCCACTGTCCTGTTCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCSSDSSGVRRKPEEVRVHACEVSSLRLGSQGGAGSPPWGWDPRSGRDLLPEAGIPGQIYSQNGESLCGAPGVPSQQPSLPSPCLPLPRAKVIRVRPVLLVAPPRLVAMR	166078	183236	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_+_166840_167248_167331_167581_168060_168174_168296_169000_169099_170744_170931_172528_172742_173130_173211_173306_173449_173622_173748_174572_174721_174858_174986_183132
935666	contig_17936_pilon	+	1695	8	Intergenic	novelGene_29965	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	820	junction_7	737.391320252465	13	18	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	68	844	91140	121021	TRUE	25	TACTATTACCAGCCTAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSKVNIIPIIAKSDAISKSELTKFKIKITSELVSNGVQIYQFPTDDESVAEINGTMNAHLPFAVIGSTEELKIGNKMMKARQYPWGTVQVENEAHCDFVKLREMLIRVNMEDLREQTHTRHYELYRRCKLEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAKRNEFLGELQKKEEEMRQMFVQRVKEKEAELKEAEKELHEKFDRLKKLHQDEKKKLEDKKKSLEDEVNAFKQRKTAAELLQSQGSQAGGSQTLKRDKEKKN	91072	126576	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_91161_95142_95305_106374_106472_110997_111167_114800_114934_118635_118827_121017_121063_125766
935667	contig_854_pilon	-	474	4	Intergenic	novelGene_36714	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	3.77123616632825	1	24	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCATGAGGTCCTCCATCTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1710614	1709309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1709336_1709508_1709719_1709987_1710148_1710536
935668	contig_13021_pilon	-	2654	7	Intergenic	novelGene_8211	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	118	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	134	405	2222	2626	178197	177233	FALSE	35	TACAATATTCAGCAGCTACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISSIRRISFHPSPHHDTHPQSEECCGLHSVLVHQCLYECNLSGSLQQAVLLLLAKLHSTSEFAYQVLSDPQFSLFGVQSPYQAFYLLHQGQGRLFFSGWFSHTLKNLLVFQVLRYRFPPLSKSRICGPLGAPP	181128	177204	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_177280_177366_177526_177618_177791_178170_178281_178521_178580_178670_180081_180458
935669	contig_14415_pilon	+	744	3	Intergenic	novelGene_77621	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	130.5	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	3	386	33337	37984	FALSE	15	TCAATTGTATTGGTTTTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRLPGGRCHCAQRHQGGCGVAEDQDGGQKAESQAGQESAGPSNVKTGKPEEASLDSREKKTNPAPKSTATNGGTSGKVGKPACGTAKRSIADSEESEAYKSLFTSHSSAKRPKEESAHWVTHTSYCF	33334	38342	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14415_pilon_+_33446_36102_36199_37805
935670	contig_6137_pilon	-	2892	15	Intergenic	novelGene_59259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	29	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GACCACCGATAGTCTGCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1354909	1319541	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6137_pilon_-_1319603_1321459_1321503_1323816_1323931_1328094_1328337_1331697_1331856_1332168_1332308_1333463_1333519_1337697_1337774_1339032_1339073_1341572_1341636_1345121_1345188_1346607_1346749_1347420_1347556_1348118_1348277_1353508
935671	contig_4232_pilon	-	397	1	Intergenic	novelGene_63419	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TAAAAAGTAAAAAATAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	467981	467584	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4232_pilon_-_467600_468000
935673	contig_16103_pilon	-	1452	2	Intergenic	novelGene_118829	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	71	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCCTCTGACCTGCTTGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	743669	722281	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_-_723650_743585
935676	contig_9363_pilon	-	777	2	Intergenic	novelGene_6596	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	1019	junction_1	0	2	26	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATAAACCTGTCTATGTATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	755113	753826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_754503_755012
935677	contig_5686_pilon	-	2767	11	Intergenic	novelGene_45400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	113	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	223	672	1077	1748	208699	203000	TRUE	25	AGGCCCCCCAGGTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSWFRFRNSLYCSLCGSNARKSPLKASSKLPSRKYLQPSDSPLTEPSKSSLSVTTGTSVEVSLLTSCFVMLPSKVSSSTGLSSEASSDACRRASATLFSRNRRLAPAPADCWQASDAAKAVFLCSVCSSTCDFGSWPSAEELLEDAELVSSVPSFCEDRLLWFSSAGVIVISGFVRHVLEGEPAELEGRAQSPLGRSLKLRDSGIFSSAAFPFSKMSSGRLD	212337	170280	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5686_pilon_-_170342_171643_171800_172507_172647_182636_182787_189031_189096_198548_198595_199758_199883_200408_200560_202871_203002_208029_208722_211283
935678	contig_8330_pilon	+	1495	7	Intergenic	novelGene_71832	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	165.769585737419	2	85	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	124	375	38	412	855050	856274	TRUE	15	GCGCTTGACCATGTTGCACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSL	855012	857679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856560_856667_856755_856968
935680	contig_11720_pilon	+	1125	10	Intergenic	novelGene_43930	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	343.531586054738	1	42	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	282	846	279	1124	263924	269909	FALSE	20	GCACTGAGCAAGGTGGGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIAFLDPGNIESDLQAGAVAGFKLLWVLMWATVLGLLCQRLAARLGVVTGKDLGEICHLYYPKVPRILLWLTIELAIVGSDMQEVIGTAIAFSLLSAGRIPLWGGVLITIVDTFFFLFLDNYGLRKLEAFFGFLITIMALTFGYEYVVARPDQGALLRDLFLPSCPGCGQTELLQAVGIVGAIIMPHNIYLHSALVKSREIDRTRRADIREANMYFLIEATIALFVSFLINLFVVAVFGQAFYHQTNQAAFNVCANSSLHDYAKIFPQNNLTVAVDIYQGV	262258	269910	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_262359_262917_263045_263872_263996_264306_264427_265206_265314_265744_265816_266171_266240_266453_266610_267753_267913_269816
935682	contig_10377_pilon	+	944	6	Intergenic	novelGene_115392	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	803.50108898495	1	37	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	141	426	132	557	219517	237533	TRUE	40	AGTAGGAAACTTTGGGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RQNFQAFCLYHICCCPGGGGTGTFGRVHLVREKTGKRFFALKVMSIPDVIRLKQEQHVHNEKSVLEEVSHPFLVRLFWTYHDERFLYMLMEFVPGGELFSYLRNRGRFSSNTGLFYSAEIVCAIEYLHSKEIVYRDLKPENILLDKEGHIKLTDFGFAKKLVDRLRIPRFLKFFPSGKPAALSC	209152	257048	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10377_pilon_+_209213_219445_219615_227487_227752_237469_237581_255008_255169_256868
935683	contig_13300_pilon	+	1780	6	Intergenic	novelGene_125821	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	72	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	369	689	247087	247635	TRUE	10	TTGAGGCTGGGTGCTCCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRLRGPRSHHPLGTTPRGEGWNQGQDPSLALTSDEREPRKVSPPLPQSKSTPNPSLSVCISILALSLENVCMGPKNNLEPRRPLILPAKASCKHYGGTSSHCSSG	244240	248954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13300_pilon_+_244444_246921_247151_247269_247446_247554_247758_247836_247942_248090
935684	contig_14744_pilon	-	901	3	Intergenic	novelGene_66015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	3	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70	ATAATAAAAATAATAGCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	969937	960520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14744_pilon_-_960944_968343_968626_969741
935685	contig_8138_pilon	+	1381	4	Intergenic	novelGene_52468	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	16.0277537068951	1	80	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	TTCCTTTCTTTCCGTGTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	280176	307520	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8138_pilon_+_280360_288507_288616_306364_306623_306688
935686	contig_5669_pilon	+	3959	7	Intergenic	novelGene_86062	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	193.991193958214	1	51	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	91	276	235	510	186087	189310	TRUE	45	TTCTGAAAAAAGACTGATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLQWVNGDRKFFYIPWRHATRHGPGQEGDNTIFKAWAKETGKYTEGVDEADPAKWKANLRCALNKSRDFRLIYDGPRDMPPQPYKIYEVCSHGPAPTEAQPSEDHTFGPGEEEEEEEEELQRMLPSLSLTVQPGPSMGPYSVPKEELNWHAIMRLQIVTGPGFPGGCED	183032	192899	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5669_pilon_+_183135_185954_186145_186553_186619_187060_187095_187253_187306_189243_191742_191881
935688	contig_15752_pilon	+	1934	1	Intergenic	novelGene_148794	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	7	66	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCAAGATCCATCTGACAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	409020	410954	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15752_pilon_+_409000_411000
935689	contig_12427_pilon	-	1066	5	Intergenic	novelGene_40475	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2799.78948985455	1	60	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	119	571	315977	314393	FALSE	55	AAAAAAGACAAACACGTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PGCVRVSAAAGPLSNECFKCGRSGHWARECPTGGGRGRGMRSRGRGGFTSDRGFQFVSSSLPDICYRCGESGHLAKDCDLQEDEACYNCGRGGHIAKDCKEPKREREQCCYNCGKPGHLARDCDHADEQKCYSCGEFGHIQKDCTKVKCYRCGETGHVAINCSKTSEVNCYRCGESGHLARECTIEATA	325907	313897	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12427_pilon_-_314511_315365_315568_315748_315842_315937_316054_325865
935690	contig_7870_pilon	-	512	5	Intergenic	novelGene_108946	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	391.876495212459	1	32	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GGAGCTGCCTGAGCCGCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	497927	295308	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7870_pilon_-_295394_402879_403001_441672_441748_496460_496586_497821
935692	contig_11277_pilon	+	948	6	Intergenic	novelGene_80315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	149.702905783422	1	49	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	45	758	256020	269500	FALSE	40	CCAAATAAGCACCACATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LLEGLLLVLEPCASMAWECPMRLEPLKRLIHSTYMYLAGSIGLTALSALAVTRAPVLMNFMMRGSWVTIGATFAAMIGAGMLVQSIPYHQSPVPKHLAWLLHSGVMGAVVAPLAILGGPLLIRAAWYTAGIVGGLSTVAMCAPSEKFLNMGAPLGVGLGLVFVSSLGSVFLPPTTVAGATLYSVAVYGGLVLFSMFLLYDTQKVIKRAETVPMHGAQKYDPINSMMRIYMDTLNIFIRVATMLASGSNRKK	255975	269690	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11277_pilon_+_256064_256520_256636_260595_260705_266767_266957_267437_267610_269415
935693	contig_11285_pilon	-	2167	18	Intergenic	novelGene_5674	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	519.894333155362	1	113	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	50	508	793851	790322	TRUE	5	CTCCGCCAGCGTGCTGCCTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AEVGRVYLYLQPRGPHMLGTPSLLLTGTQLYGRFGSAIAPLGDLDHDGYNDLAVAAPYGGPSGRGQVLVFRGQSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCPARPEC	793900	784061	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785390_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787162_787277_787431_787533_787625_787750_787819_788127_788208_788488_788580_789133_789282_789440_789509_789926_790053_790182_790344_790567_790673_790788_790835_791086_791270_793748
935694	contig_2770_pilon	+	325	3	Intergenic	novelGene_107491	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	13	2	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CCATCTTTGTCGAATAGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	744058	746707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2770_pilon_+_744173_744574_744672_746593
935695	contig_7009_pilon	-	2147	1	Intergenic	novelGene_23678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	132	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AAGTGACTTAAAACAATGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	539854	537707	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7009_pilon_-_537700_539900
935697	contig_11978_pilon	+	607	5	Intergenic	novelGene_63084	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5399	junction_4	2942.67760721422	1	41	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	194	585	4	588	1829081	1831883	FALSE	20	TCTGTACATAATGGCCTTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSRQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCRKNTLARRKGRHMGIGKRKGTANARMPEKVTWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAEARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK	1829077	1831902	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11978_pilon_+_1829187_1829999_1830123_1830663_1830785_1831161_1831273_1831759
935698	contig_15063_pilon	-	2952	3	Intergenic	novelGene_13011	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	15	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1163	1582	35527	35108	TRUE	50	GAAAAATTAAATTCAGCTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCACGVCVYVCVLCVCVVCLCVFRDSCLAKEGQGLCLGQEPSPWEPVHLRNLHTEDTFFMKSSPLCLTRQVNTFWLIQSISLMVNMLLIWKVCGPDPLSSGSTSPVMMPDSTDFPSRSQNSEISLGRKPVAWQMSLEVR	36796	29446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15063_pilon_-_30321_34611_36158_36264
935699	contig_13021_pilon	-	2010	12	Intergenic	novelGene_8203	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	23	132	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	1255	1665	177705	176875	TRUE	15	CCTGCCCTGCTTCCTCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNVIFQEVFSKLSYFFWPSCTPHQSLPIRSDPQFSLFGVQSPYQAFYLLHQGQGRLFFSGWFSHTLKNLLVFQVLRYRFPPLQITYLRSFGSSTIDASRLQTTGSTIFSSYLLHLLGQFPSWRQHQARPSPLSKNG	181153	175930	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13021_pilon_-_176038_176398_176499_176586_176700_176849_176904_177136_177278_177366_177521_177618_177801_178172_178281_178521_178584_178669_178717_179978_180203_180435
935700	contig_6445_pilon	-	1523	17	Intergenic	novelGene_76937	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_12	768.675606156459	1	60	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	252	759	539	1297	77863	43105	FALSE	30	AAGATACATTAGCCTTTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEYAKQHGIPIPVTPKNPWSMDENLMHISYEAGILENPKNQAPPDLYTKTQDPAKAPDSPDILEIQFKKGVPVQVTNVKDGTTHCTSLELFMYLNEVAGKHGVGRIDIVENRFIGMKSRGIYETPAGTILYHAHLDIEAFTMDREVRKIKQGLGLKFAELVYTGFWHSPECEFVRYCITKSQERVEGKVQVSVFKGQVYILGRESPLSLYNEELVSMNVQGDYEPIDATGFININSLRLKEYHRLQSKVTTK	96338	42878	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_-_43151_44512_44579_49734_49892_55480_55613_64139_64205_64855_64941_68005_68097_73277_73309_73979_74051_77848_77924_80504_80562_85287_85344_85389_85477_88146_88216_88473_88594_89656_89714_96306
935701	contig_5423_pilon	-	1638	8	Intergenic	novelGene_85283	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	219.453216621936	1	87	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	198	597	948	1544	564420	558772	FALSE	45	TCAAGTCTGATAAAAGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCMLCVGLVLGFLISSVIFFTLLGNVKIFRDDVVFWMTFSCIAIIIPLVFMGCLRILNILTCGIIGSYSVVLAVDSYLYTSLSYITLNVLKRALNTDFHRAFTNVPFQTTDFIILAVWGMLAVSGITLQIRRERGQPFFPPHPYKLWKRERERRVTNILDPSYHIPPLRERLYGRLAQIKEFFQEEQSAGERTPLLL	573622	558677	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5423_pilon_-_559035_560563_560727_561510_561609_564347_564501_565317_565399_567011_567099_569118_569259_573063
935702	contig_10437_pilon	+	2093	10	Intergenic	novelGene_38209	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	15	junction_7	539.249638701322	1	110	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	306	921	160	1080	229668	232240	TRUE	55	TTAATTAAAATATATTAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLQTLYDCFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIIRYFFELYVATPLAALLNVKEKTRLRAPPNPTLEHFYLKSGKQPKQAEIELLSRSCGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDLRKVWEGYPIQSIIPSQYWYYMIELSFYCSLLFSVASDVKRKDFKEQIIHHVATILLLSFSWFANYVRAGTLIMALHDSSDYLLEPRCSTTRDGRTPATTSSSPSPLSSSSLGSSSCPSGSCTAQWCTPWSSILPSLAITSSTP	229508	233446	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10437_pilon_+_229841_230252_230371_230564_230684_230903_230962_231067_231119_231345_231439_231621_231751_231951_232055_232163_232318_232510
935704	contig_16667_pilon	-	437	1	Intergenic	novelGene_153252	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	ACACCACTCTTGGTAAAGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16746	16309	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16667_pilon_-_16300_16700
935705	contig_12079_pilon	+	990	1	Intergenic	novelGene_67547	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	23	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	CTCATACTTCGGACTGTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	860696	861686	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_+_860700_861700
935707	contig_3095_pilon	-	1192	5	Intergenic	novelGene_75123	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	84	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GAGTCAGTAGAGCTCAAGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	152246	147217	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_-_147321_149647_149895_150412_150691_150996_151162_151847
935709	contig_9345_pilon	-	1642	4	Intergenic	novelGene_24617	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	2016	junction_1	1570.35247281904	1	35	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	230	568	952473	947957	FALSE	5	CTTCCTGTATCCTGGTGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KKLVIVGDGACGKTCLLIVFSKDQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGKQVELALWDTAGQEDYDRLRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEKWTPEVKHFCPNVPIILVGNKKDLRNDEHTRRELAKMKQEPVKPEEGRDMANRIGAFGYMECSAKTKDGVREVFEMATRAALQARRGKKKSGCLVL	955339	946882	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9345_pilon_-_948131_949475_949607_952439_952561_955197
935711	contig_34_pilon	+	834	2	Intergenic	novelGene_40004	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	50	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	343	711	212125	212493	TRUE	45	GAAATAAGAGGACATTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGCPWGTGFNVTISDWKGNGGSRAPFVVPGLSSRPWYTRDQFLPSSLQFGDLEEGSSWILQALTFPGRHLRGESPLKVSGVRTACSEGQLVPCTPPTSFCFSDSSSGGGKVPCRKFSTSSLA	211782	213049	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_34_pilon_+_212540_212972
935712	contig_18329_pilon	+	231	1	Intergenic	novelGene_179259	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	12	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAGCTATGAGGTCTGGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16595	16826	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18329_pilon_+_16600_16800
935713	contig_15518_pilon	+	684	3	Intergenic	novelGene_127613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	33	junction_1	258	1	31	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	100	303	2	304	11232	37386	TRUE	65	ACTTCAAAAAAGAAAAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HLRLFPRVTNVSDFTKRDSTDFSIRISNISPADAGTYFCVKFRKGSPDDVEFKSGPGTQVTVSGQQPSTPYLLLGGLLVGLKVLLVVGVSAIYVYRKQKA	11230	38413	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15518_pilon_+_11422_37273_37389_38035
935714	contig_6208_pilon	-	2662	1	Intergenic	novelGene_53001	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	14	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	270	810	1852	2661	414398	413589	NA	50	TGGAGAAACAAATCACCAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQGWFNISKTINVIHHINKTKDKNHMIPSIDAEKAFNKVQHPFMIKTLNKIGIEGKFLSVIKGIYTKPTANIILNGETLKAFPMRTGIRQGCPLSPLLFNTVLEVLARAVRLEKEIKGIQIGREKVKVSLFADDMISYTENPKESTRKLLELIEDFSKVSGYKINIQKSIGFLYTNKENLEEEITKSIPFTIAPKKIKYLGINLTRDVKDLYRENSKTLLQETKRDLRKWKNIPCSWIGRLNIVKMSILPKAIYRYNAIPIQIPAAFFNE	416249	413587	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6208_pilon_-_413600_416200
935715	contig_16703_pilon	-	975	7	Intergenic	novelGene_72754	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	66	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTGTGGCTGAAACACAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15659	5736	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16703_pilon_-_5862_6414_6534_6696_6871_9180_9305_9937_10041_11225_11291_15394
935717	contig_12079_pilon	-	2294	6	Intergenic	novelGene_67544	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	405.580768774852	1	87	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	454	1365	217	1581	864606	861365	FALSE	35	TAAAACTTCGATGTAATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	867287	860651	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862193_862309_862630_863468_863584_864504_864673_866539_866650_867247
935718	contig_14133_pilon	-	500	4	Intergenic	novelGene_119962	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	1631.11870267685	1	26	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	133	402	2	403	209065	208182	TRUE	20	TCTTCGGGATCCGCGCAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WQRRVATWFNQPARKIRRRKARQAKARRIAPRPASGPIRPIVRCPTVRYHTKVRAGRGFSLEELRVAGIHKKVARTIGISVDPRRRNKSTESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPSAPKKGDSSVSTVHWHHWW	209066	206665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14133_pilon_-_206760_208178_208389_208585_208728_209012
935719	SIRV6	+	734	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	48	1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	46	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
935720	SIRV6	+	685	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	17	81	17	-21	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	31	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TACACATATGACACGAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10254	11249	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
935721	contig_17936_pilon	+	809	7	Intergenic	novelGene_29955	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	927.937812212291	1	34	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	286	345	91140	95186	TRUE	50	AGTCAAAGAGAAAGAAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLVNKSVSQGFCFNILCVVGLKLTVVSTVGFGDQINKEDSYKPIVEFIDAQFEAYLQEELKIRRVLHTYHDSRIHACLYFIAPTGHSLKSLDLVTMKKLDSEHHPHHCQIRCHF	68335	114890	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17936_pilon_+_68391_79235_79300_90973_91156_95142_95299_106374_106472_111001_111167_114800
935722	contig_1225_pilon	+	2515	4	Intergenic	novelGene_44127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	277.648458786766	1	125	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	227	589	250814	274852	FALSE	35	AAGTTTGAAAATGCTTTCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSVYFPIHCPDYLRSAEMTEVMMNAPSMEEIGLSPRKDGLSYQIFPDPSDFDRCCKLKDRLPSIVVEPTEGEVESGELRWPPEEFLVQEDEQENCEETAKENKEHWRKKANTRRKGKVMS	250587	276778	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1225_pilon_+_250840_253416_253520_274222_274399_274794
935723	contig_13780_pilon	-	1122	4	Intergenic	novelGene_149127	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	331.422523206992	1	38	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	191	576	13	588	823821	821953	FALSE	25	ATTTCCTGCATTATCAGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QRRRMDEISDHAKVLTLSDDLERTIEERVNILFDFVKKEEGIIESSDKEIVAEAERLDVKAMGPLVLTEVLFNEKIREQIKKYRRHFLRFCHNNKKAQRYLLHGLECVVAMHQAQLISKIPHILKEMYDADLLEEEVIISWSEKASKKYVSKELAKEIRVKAEPFIKWLKEAEEESSGGEEEDEDENIEVNWGEF	823833	821418	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13780_pilon_-_822109_822400_822566_822826_822983_823722
935725	contig_6445_pilon	+	1219	12	Intergenic	novelGene_76906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	45	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	110	333	676	1008	64195	80525	TRUE	10	CAGGTGGCGGAGCGGGGCCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLAPVHEELQGCAVGGAILDVGHLHRDPFLELDLKDVRAVGGFGWVLGLCVEIWRRLWSILPDVHKVLVHAPRVLGGDRDGDSVLLCILHQIIAALEPVVELRHPPGGNN	42874	96326	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6445_pilon_+_43144_44514_44579_49734_49893_55483_55611_64137_64207_64869_64940_68004_68094_73966_74051_77848_77924_80522_80564_88440_88594_96306
935726	contig_7202_pilon	+	535	3	Intergenic	novelGene_18573	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	AGCGGCGGCGGGGGCCTTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	27939	29956	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7202_pilon_+_28169_28486_28634_29797
935727	contig_2892_pilon	+	583	1	Intergenic	novelGene_119007	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	35	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CATATACTTGTGGTATTTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	201612	202195	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2892_pilon_+_201600_202200
935728	contig_2078_pilon	+	1843	10	Intergenic	novelGene_100184	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	139	420	1249	1668	529532	530319	TRUE	45	CTGAAAATAGTGTGAAACAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLCSQREVEGHSSSRGGRVVPQDDILMIEPVQDRGRASLGLTVKLHHIPHHTLGPGSPEGEDRTRHWNSHDDCNPLAEDGAVNVVSCTVVSASIAFLHSEDWQLCPQGTLRLSSQTYSAFSVPGECDSACTLGYRADKD	505086	532406	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2078_pilon_+_505666_505745_505778_508728_508798_514637_514725_515321_515345_521683_521793_522157_522433_529457_529735_530102_530383_532294
935730	contig_960_pilon	+	2093	3	Intergenic	novelGene_108315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	891	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	103	312	1232	1543	1053919	1055549	FALSE	25	GACCCGGTATTGCACAGGAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRAEVTEAIYHHLPPTSLRFSAVPVLKMMQGKTQHYWKQAGVTPSVEDPSPRAHSHGRQAASWTQLQLELKDILFFYLSTLFVYLKVIYILLLFRFWLDIQKG	1051195	1056099	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_960_pilon_+_1051951_1053442_1054030_1055348
935731	contig_9473_pilon	+	497	1	Intergenic	novelGene_179260	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	24	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCTGCGGTGAGGGCCACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	411320	411817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9473_pilon_+_411300_411800
935734	contig_16594_pilon	-	4389	10	Intergenic	novelGene_53807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2465.93850113056	3	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	289	870	204	1073	165546	121101	TRUE	30	CCTAATAAAACTTCTCTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMAMLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFSVAPSLATNASAAFNPYLGPVSPSLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLMRTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSAMVDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYFHPPAHLQAKIKAAQYQVNQAAAAQAAATAAAMGIPQAVLPPLPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLPPGSILCMTPATSVVPMVHGATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM	272763	115146	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_-_115991_116096_118551_121082_121158_124164_124260_124955_124992_132997_133152_135251_135510_149149_149351_165477_165649_272662
935735	SIRV6	+	734	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	1	48	1	3	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3	30	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCTGCCTAATTGTTGGTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11282	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
935737	contig_12786_pilon	-	2706	1	Intergenic	novelGene_103444	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	56	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TTCCCAGCACCAAATTCTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	626668	623962	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12786_pilon_-_624000_626700
935738	contig_11338_pilon	-	2239	13	Intergenic	novelGene_6353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	336.047729331547	1	113	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	106	321	294	614	319426	315636	TRUE	30	GAGTTGATTCAGGGGCCAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTETCLWM	323309	294814	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300269_300354_306675_306964_314764_314939_315142_315304_315545_315656_318590_318769_319185_319264_319381_319429_321311_321459_323165
935739	contig_11338_pilon	-	1637	10	Intergenic	novelGene_6370	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	84	junction_8	248.68414197358	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	207	624	613	1236	306903	295354	FALSE	5	TCTTCATTTCTTTGTTCTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARCWLHPGKGFIWSFLGPVCAIFSVNLAFFLMTFWILKNKLSSLNNDVSTLQNTRMLTFKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAAQVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVQEQYRKWFIGIRRLREESEMYTLSSRVLPDASKPNLVN	323314	294952	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300893_306727_306964_318590_318769_319185_319264_321311_321459_323165
935741	contig_11309_pilon	-	921	8	Intergenic	novelGene_149878	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	2535.89870556731	1	44	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	288	864	56	919	65730	56327	FALSE	15	TCAGAGCTCAGGGGCGGGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWACRSVAIRGRRSVFRRMGFVKVVKNKAYFKRYQVKFRRRREGKTDYYARKRLVIQDKNKYNTPKYRMIVRVTNRDIICQIAYARIEGDMIVCAAYAHELPKYGVKVGLTNYAAAYCTGLLLARRLLNRFGMDKIYEGQVEVTGDEYNVESIDGQPGAFTCYLDAGLARTTTGNKVFGALKGAVDGGLSIPHSTKRFPGYDSESKEFNAEVHRKHIMGQNVADYMRYLMEEDEDAYKKQFSQYIKNSVTPDMMEEMYKKAHAAIRENPVYEKKPKKDVKKKRYVESSQNVSCPEEGSGSSEEGKL	65785	56324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11309_pilon_-_56393_56924_57018_60169_60348_61240_61444_62842_62978_64220_64337_64427_64498_65727
935742	contig_15118_pilon	+	2312	10	Intergenic	novelGene_74613	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	4	9	junction_6	228.895415225188	3	114	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	552	1659	38	1696	392042	398743	FALSE	25	TGGACCACAGCCATGTTCAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLLLLLLPLLSMLLGGSLALDSKFWLQVPSSVTVQEGLCVLVPCTVGYPRVGWTDSDAAHGYWFLEGTATATGAPVATNNPDKEVQRETQGRFQLLGEPRTGSCSLVIRDARREDTATYFFRVERGNYVKFNFMTYTVSLEVTGLTQPDVYIPETLEPGRLVTLLCVFPGNFGDCPAPTFSWTGAATSTQGTGSQTSLFSALTFMPRPQDHDTELTCQVDFSRNGVSTARTVRLSVAHAPKDLVISISQAKVSGPESQGNVSHLEVQKGQFLRLLCASDGQPPATLSWVLDDRVLSMSPRAESRTLELELPQVGPKDTGRYTCRAENRLGSQQRSLDVSVQYPPENLRVMVSQANRTDPPQVLSPSCSWKTEGLRCSCSARAWPTPSLHWRVGNWLVEGNSSNASVMVTSSSAGPWANSSLRLSEGLSLGLGLHCEVRNDHGAHSVTVLLLPDKGLVSTAFSKGAFLGIGITTLLFLCLILIIVKTLRKNWTQAGALRPRALRVSSVMDYINVDPNAPPLAQNRKATPSIPAESPASAARPPGIKEPQLPKI	392004	399359	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15118_pilon_+_392088_392169_392554_392644_392927_393224_393273_393415_393680_393942_393991_394463_394749_395049_395141_395233_395346_398644
935743	contig_5317_pilon	+	751	3	Intergenic	novelGene_76543	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	8	7329	junction_1	3192	4	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	136	411	25	435	35282	43326	FALSE	30	AGCATTTGGATTTTTTTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA	35257	43642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5317_pilon_+_35410_36684_36839_43197
935744	contig_401_pilon	+	2002	12	Intergenic	novelGene_42825	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_2	1394.06817125839	1	61	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	200	603	189	791	1712860	1714079	TRUE	10	GTTCTCGGTCCTTCCCCCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRDPNTKRSRGFGFVTYSTVEEVDAAMNARPHKVDGRVVEPKRAVSREDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFVTFDDHDSVDKIVIQKYHTVNGHNCEVRKALSKQEMASASSSQRGRSGSGNFGGGRGGGFGGNDNFGRGGNFSGRGMWLWWQPWWWWIRRQWGWL	1711890	1728755	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_401_pilon_+_1711964_1712506_1712619_1712856_1713004_1713129_1713341_1713437_1713531_1713610_1713708_1714021_1714097_1715077_1715234_1715419_1715486_1715716_1716273_1724169_1724348_1728517
935745	contig_18194_pilon	-	1579	3	Intergenic	novelGene_55964	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	239	junction_1	20	1	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	338	1017	69	1085	18897	4642	FALSE	35	AGAAACTATTGGAATGGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPSSLDADWSAVTKISQSTAGTMNPEPHGFSSESQDITEGIIEYLKNNLTEEELQNLLAEDQNLESIKAEVDLSRDEEDALYEALNQLRKEIATEDKDSLQKEQQHRHQFLQEFPRVKMKLEEHIRELHALADKVGKIHRDCTISHIVANSTSTVSGILTILGLALAPVTAGVSLPLCATGVGLGVAAAITSVSTSIVDHSARSSAKAKASKLMSTGDCEHAVNAVRPSLVSTTESCNQASSNIRKNDRAKELAKLLVTNHRCLMTSGTISIQIGNPVQKTIASTALKMAKGARVMGMATVGVFLLIDVVSLVQESKHLHEGAKTESAEELREQARELERKLEELTEIYKNLLGTDSMTP	18965	4147	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18194_pilon_-_5501_7034_7162_18866
935746	contig_9363_pilon	-	1810	7	Intergenic	novelGene_6762	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	335.00845760468	1	75	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	126	381	218	598	1509135	1506537	FALSE	10	CCCAGTTGTTGTGATGTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATDTGSKRRILGLHADLAVLLGKHNETLKRLPSDTEPCLPGAEFRCPVVFKQETAIQVIARVELVGEIEASSMFRLCSSVSISFNSSKHFHLYGSSASLAQVITKVDVVYEKEMLHVYVLSGIGGLLLLLLIFVALYKVGFFKRNLKEKMEAVGAPDGNPGEDSEKPESGEEAVDLGCLEPLHGKEAQDEESKTEAQD	1535566	1505324	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9363_pilon_-_1506720_1508228_1508340_1509048_1509145_1509559_1509659_1509767_1509805_1532362_1532399_1535530
935747	contig_7272_pilon	-	1712	7	Intergenic	novelGene_25353	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	2	8	junction_2	842.932711167122	1	90	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	334	1005	11	1015	603574	595312	TRUE	20	TCATATTCTGTATAGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEKMKEQRLREHLVRFERLRRAMELRRRREIAERERRERERIRMIREREERERLQRERERLEIERQKLERERMERERLERERIRIEQERRKEAERIAREREELRRQQQQLRYEQEKRNSLKRPRDVDHRRDDPYWSENKKLSLDTDTRFGHGSDYSRPQNRFNDFDHRERGRFPESSAVRSSSFERRERFVGQSEGKKARPAGRREDAGYERYPKTFSDSRRNEPPPRNELRETDRREVRGERDERRTVILHDRPDVAHPRHPREAGPNPPRPSSWKGDGGLATDKRETSTILKNDMWLNVMDGTQADQGKNGTVHLLKGLDTTMQGGWVMAGRGQA	603584	592747	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7272_pilon_-_593429_595295_595457_598017_598330_598895_599067_599911_600037_600993_601175_603503
935748	contig_13863_pilon	+	1578	11	Intergenic	novelGene_42083	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	400.845369188669	1	83	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	362	1089	48	1136	474588	490037	FALSE	40	AATCTAGACTTGGAGAATTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRRCWLERLTLCSKEMVMEKPSPLLVGREFVRQYYTLLNKAPEYLHRFYGRNSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHKVLSLNFSECHTKIRHVDAHATLSDGVVVQVMGLLSNSGQPERKFMQTFVLAPEGSVPNKFYVHNDMFRYEDEVFGDSEPELDEESEDEVEEEQEERQPSPEPVQENASSGYYEAHPVTNGIEEPLEESSHEPEPEPESETKTEELKPQVEEKNLEELEEKSTSPPPAEPVSLPQEPPKPRVEAKPEVQSQPPRVREQRPRERPGFPPRGPRPGDTEQNESDNRRIIRYPDSHQLFVGNLPHDIDENELKEFFFTGFGNVVELRINTKGVGGKLPNFGFVVFDDSEPVQRILIAKGKYV	455880	490479	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13863_pilon_+_455904_474563_474683_477708_477791_478582_478757_479276_479368_481370_481474_481992_482174_487480_487584_488873_488993_489549_489676_490022
935749	contig_5145_pilon	-	1973	11	Intergenic	novelGene_131443	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	155.734260841987	1	95	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	241	726	260	985	937413	917225	TRUE	5	CTGGTCCCTGCCCACCTGTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSWTSATRRPQTARSCRSTSLRRATSWRRGPHGPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVNLLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKVPRASSSGVQQPTMWRSTSQCPTTPTHPSSRPPWAASSGCQRTVRLCGPSSPSRVARST	947056	915614	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5145_pilon_-_916420_916540_916617_917117_917244_923315_923475_923896_923971_924431_924575_925545_925673_936149_936299_937358_937490_939095_939164_946941
935750	contig_11720_pilon	+	1277	9	Intergenic	novelGene_43778	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	2322.57034339113	1	75	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	279	840	154	993	78465	98482	FALSE	15	CTTGAGAATTTGGTGGGTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHREPPLELKDTDAAVGDNCPRQHHQPDPHVSGLPALPHQAYIHTRMRAKTSDFLKVLNRARPDAEKKRNENNHGEDVFIPLTLGHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67786	98766	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_67849_78373_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93242_94987_95051_95383_95486_98299
935751	contig_14575_pilon	-	1665	18	Intergenic	novelGene_101889	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	67	10	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATGATGAAACAGAAGTGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	62330	20990	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_21036_21525_21609_22648_22704_26341_26418_27671_27780_28960_29022_30471_30761_33860_33921_41528_41657_42763_42855_44953_45017_47314_47374_51062_51144_54376_54489_59250_59374_59880_59983_61541_61635_62294
935752	contig_14513_pilon	-	1172	3	Intergenic	novelGene_70391	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	3	134	junction_1	151	1	51	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	170	513	185	697	18880	11833	FALSE	15	CACCTTCCTTGCTGCTTGAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DRGLDADLSPKPTIFLPSAAETVLHNAGTYLCLLEKFFPDVIQVDWKEKNSDTILQSQQGDMIKTGETFMKFSWLTVTGNSLDKEHQCIVKHEHIVDPPKVILFPSTKRDFALTNSTKACLNDGSEETNRTTSLGYPAAAAHRHLCVLHLPPPPSQECHLLGHRGILSAQKNGSLWRWKESVTDGGTKGPSFLHLVFFLELSAEDLAGFSFWVWVISVPVCIFFIMLLLTI	19064	11357	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14513_pilon_-_12153_13087_13136_18735
935753	contig_18055_pilon	+	1610	14	Intergenic	novelGene_117822	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	287.204254884339	1	66	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	407	1221	389	1609	73614	84695	FALSE	25	CTGAAGCCCAGCAGTATCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MWTEHKSPDGRTYYYNTETKQSTWEKPDDLKTPAEQLLSKCPWKEYKSDSGKPYYYNSQTKESRWAKPKELEDLEGYQNTIVAGSLITKSNLHAMIKAEESSKQEESTTTSTAPVPTTEIPTTMSTMAAAEAAAAVVAAAAAAAAAAAAANASASTSTSNTVGGTVPVVPEPEVTSIVATVVDSENTVTISTEEQAQLTSSTPAVQEQSVEVSSNTGEETSKQETVADFTPKKEEEESQPAKKTYTWNTKEEAKQAFKELLKEKRVPSNASWEQAMKMIINDPRYSALAKLSEKKQAFNAYKVQTEKEEKEEARSKYKEAKESFQRFLENHEKMTSTTRYKKAEQMFGEMDVWNAISERDRLEIYEDVLFFLSKKEKEQAKQLRKRNWEALKNILDNMANVTYSTTW	40733	84696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18055_pilon_+_40858_41921_42054_59718_59800_63070_63116_73607_73719_75199_75321_75562_75617_77210_77236_77932_78311_80663_80773_81240_81306_82070_82236_83360_83470_84605
935754	contig_15327_pilon	-	3137	3	Intergenic	novelGene_70760	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	117	junction_1	63	8	46	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GCAATCACCTTCCTTATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1133857	1129500	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15327_pilon_-_1130520_1131004_1131058_1131792
935755	contig_16121_pilon	-	1603	4	Intergenic	novelGene_6884	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	94	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTTCCAAAATCCCCAGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	63228	57840	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16121_pilon_-_58199_58864_59353_60734_60849_62585
935756	SIRV6	+	714	3	NNC	SIRV6A	novel	783	3	NA	NA	1	-37	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	39	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCGGTAAACGTAAATTTACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10238	11233	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV6_+_10819_11031_11138_11205
935757	contig_2703_pilon	-	1065	2	Intergenic	novelGene_101642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	3	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	GCGTCTCGGAGGGGAGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3233	1347	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2703_pilon_-_1766_2586
935758	contig_11285_pilon	-	1649	15	Intergenic	novelGene_5711	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	517.363848795813	1	90	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	164	495	182	676	790656	789437	TRUE	15	CTAAGCCCCCCTCCGCCAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSEGLISRPSQVLDSPFPKGSGFGFSLRGATDIDDNGYPDLLVGAYGASKVAVYRAQPVVMASVKLLVQDSLNPAVKDCILPQTSTAVSCFDIQICVGATGHNISEKLHLNAELQLDRQKPRQGRRVLLLASQQASTTLSLDLGRKHSPICHTTKAFLRDEADFRDKLSPIVLSLNVSLQPEETGLAPALVLHGETHVQEQTRIILDCGEDDLCVPQLQLTANM	791205	784071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11285_pilon_-_784309_785383_785501_785704_785807_786067_786182_787039_787166_787277_787415_787764_787832_788127_788185_789420_789509_789926_790053_790182_790335_790427_790484_790567_790673_790788_790835_791086
935759	contig_14353_pilon	-	2409	10	Intergenic	novelGene_82080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	517.486875840022	1	86	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	187	564	38	601	104372	83263	TRUE	25	TCAAAGTATGGATGGTTGCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEKQQQPQRCREMAFSSAQPPYLSPGVPFHGAILGGLHDGLQIIIKGTVLYCSGNRFAVNFQTGCSGNDIAFHFNPRFEEGGYVVCNTKQNGSWGPEERKMQMPFQMGKFFEIFVLVQSSDFKVAVNGSHFLQYSHRVPFHRVDTIAVQGPLQLHSVEFQPPGIWPANSAPVTQTIIHTMHNTPGQMFPPESHLWCTPA	104409	79071	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14353_pilon_-_80623_82379_82543_82693_82783_83257_83296_83901_83953_84505_84542_87365_87477_88547_88750_90961_91054_104333
935760	contig_3018_pilon	-	997	10	Intergenic	novelGene_78892	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_8	520.394318679192	1	47	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	227	681	315	995	600079	576762	FALSE	55	GAAAAAAAGTGGGGAGAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSIVIPLGVDTAETSYLEMAAGSEPESVEASPVVVEKSNSYPHQLYTSSSHHSHSYIGLPYADHNYGARPPPTPPASPPPSVLISKNEVGIFTTPNFDETSSATTISTSEDGSYGTDVTRCICGFTHDDGYMICCDKCSVWQHIDCMGIDRQHIPDTYLCERCQPRSLDKERAVLLQRRKRENMSDGDTSATESGDEVPVELYTAFQHTPTSITLTASRVSKVNDKR	625002	576759	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3018_pilon_-_576887_577774_577834_580093_580175_583417_583648_585063_585179_600008_600194_603367_603441_624772_624819_624858_624903_624965
935761	contig_3077_pilon	+	1933	8	Intergenic	novelGene_26810	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	836.104646316379	1	107	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	105	318	140	457	473998	476787	TRUE	35	GTACAGAGACACTTGACATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVQSGRDVGESSRMMCSLTG	467471	482367	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475636_476732_476905_477443_477631_479457_479602_481023_481218_481533
935762	contig_3077_pilon	+	2019	8	Intergenic	novelGene_26807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_1	616.73395845389	1	106	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	375	1128	181	1308	473998	481662	FALSE	40	AGACACTTGACATTCAGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKTEEEQTCPVPQEEEEEVRVLTLPLQAHHAMEKMEEFVYKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGFVLFLFLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467430	482373	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_475513_475631_476732_476905_477443_477631_479457_479646_481023_481218_481533
935763	contig_3077_pilon	+	1760	7	Intergenic	novelGene_26808	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	715.20333161665	3	72	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	170	1156	473998	481662	FALSE	50	TTAAAATGGGAAAAGATATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSSHKGPVVAQGNGTPASNSEADTVELAELGPLLEEKGKRAITNPTKVWEGRWRVIPYDVLPDWLKDNDYLLHGHRPPMPSFRACFKSIFRIHTETGNIWTHLLGILTMLRPNMYFMAPLQEKVVFGMFFLGAVLCLSFSWLFHTVYCHSEKVSRTFSKLDYSGIALLIMGSFVPWLYYSFYCSPQPRLIYLSIVCVLGISAIIVAQWDRFATPKHRQTRAGVFLGLGLSGVVPTMHFTIAEGFVKATTVGQMGWFFLMAVMYITGAGLYAARIPERFFPGKFDIWFQSHQIFHVLVVAAAFVHFYGVSNLQEFRYGLEGGCTDDSLL	467441	482266	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_467517_473903_474139_476732_476905_477467_477631_479457_479646_481023_481218_481533
935764	contig_19744_pilon	+	3325	1	Intergenic	novelGene_120400	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	384	27	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	ATGATGATTTTCAAAGAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	215998	219323	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_19744_pilon_+_216000_219300
935765	contig_3095_pilon	+	1228	5	Intergenic	novelGene_75080	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	15	TCTTAGGTGGAGTTTTCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152242	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935766	contig_14441_pilon	+	732	3	Intergenic	novelGene_100788	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	566.5	1	33	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	182	549	151	699	125667	126705	FALSE	5	CAGCCTGGCCGTGTGTCCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNLTKVNPPKVAVFEPSEVEISRTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKMALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWSETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPEGGPVGHCPLRGPAGESGPVRCAGQCPRADGHGQEKGLLSRKAPTQTGLQRSSSLAPSPGSLRRHPCVPREFSPLSPPCTDTCSISASQRSSSQP	125516	126738	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_125902_126159_126283_126514
935767	contig_233_pilon	-	2219	12	Intergenic	novelGene_14639	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_4	1273.82980816328	1	119	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	320	963	268	1230	105485	92266	TRUE	15	GGGGTGTCCTAGAAGCTGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDLLKALNEITKSGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPEKLKNPCPDKKEACQPPFAFRHVLKLTDNSNQFQTEVGKQSISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEKIGWRNVTRLLVYATDDGFHIAGDGKLGAILTPNDGHCHLEDNMYKRSNEFDYPSVGQLAHKLAESNIQPIFAVTKRMVPTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSSNVVQLIKDAYNKLSSRVFLEHSTLPDTLKVTYDSFCSKKVPQRDQPRGDCDGVQINVPITFQVKVVATECIQEQSFVIRALGFTDTVTVHVHPQCECNCRDASSRRSHCSDRGVVECGICRCQPGYMGKSCECQTQGRSSQEMEGSCRKDNSSVVCSGLGECICGECVCHRTEDPKKRIYGRYCECDTFNCERYEGQICGGESDPPKAA	107349	78149	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_233_pilon_-_78642_78974_79142_91473_91677_92138_92285_93760_94010_94725_94914_98310_98452_99779_99870_101673_101770_104152_104309_105461_105704_107300
935768	contig_3155_pilon	+	1711	5	Intergenic	novelGene_26367	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	913.464011332685	3	68	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	168	507	78	584	258156	261211	TRUE	30	TCACTCCAAGGATTCTTTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNSKGQYPTQPTYPVQPPGNPVYPQTLHLPQAPPYTDAPPAYSELYRPSFVHPGAATVPTMSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258078	262553	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258169_259209_259329_259731_259978_261082_261562_261776
935769	contig_3155_pilon	+	1834	4	Intergenic	novelGene_26397	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	537.872558222567	1	76	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	108	327	176	502	259780	261211	FALSE	30	GCATTACACCTCACTCCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAAFPGASLYLPMAQSVAVGPLGSTIPMAYYPVGPIYPPGSTVLVEGGYDAGARFGAGATAGNIPPPPPGCPPNAAQLAVMQGANVLVTQRKGNFFMGGSDGGYTIW	258109	262543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3155_pilon_+_258142_259226_259322_259731_259978_261082
935770	contig_1452_pilon	-	2050	3	Intergenic	novelGene_115153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2295	junction_2	30.5	2	151	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	52	666	715391	699652	FALSE	70	ATACAGAAAAAAAAAATTAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIIVYRLPWTWKCSKLLMKSIHAGLHSVAAILAIIALVAVFDFHNAGNIPNMYSLHSWIGLIAVILYFLQLFLGVFIFLLPLASLSLRAILMPIHVYSGLLIFGTVIATALVGLTEKLFFVLKNPAYNSLPPEGVFTNTLGLLILLFGAFIFWIVTRPQWKRPQEPNSILLQPNEGTTEGVDSSTAMNSGNVDKSDSELNNEVAARKRNFTLDDAGQRSTM	715442	698267	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1452_pilon_-_699953_700534_700690_715232
935771	contig_18162_pilon	-	3219	2	Intergenic	novelGene_122305	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	75	TTAAAAAAAAAGAAAGAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	16613	7839	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_18162_pilon_-_10809_16363
935772	contig_4604_pilon	+	2010	14	Intergenic	novelGene_19153	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	1274.37964488214	1	90	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	258	777	16	792	363931	372064	TRUE	35	TTTTAAAATTATGCACAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GVVCAMKEAFGFIERGDIVKEIFFHYSEFKGDLETLQPGDDVEFTIKDRNGKEVATDVRLLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTKVIPKVPSKNQNDPLPGRIKVDFVIPKELPFGDKDTKSKVTLLEGDHVRFNISTDRRDKLERATNIEVLSNTFQFTNEAREMGVIAAMRDGFGFIKCVDRDARMFFHFSEILDGNQLHIADEVEFTVVPDMLSAQRNHAIRIKKLPKGTVSFHSHSDHRFLGTVEKEATFSNPKTTSPNKGG	363915	380040	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4604_pilon_+_363937_364279_364409_364510_364637_365241_365455_367056_367198_367287_367442_372056_372166_372787_372964_373590_373704_374807_374928_377355_377535_378442_378607_379336_379470_379808
935773	contig_11720_pilon	+	1280	8	Intergenic	novelGene_43795	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_7	1870.4259800748	1	70	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	250	753	245	997	68064	98482	FALSE	20	ACTTGAGAATTTGGTGGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRLPGPGRSGGWVSPQCVRERASARVFPFPPSRPLFPFPFTYYPTKPPLSGCSRAAPSVLTSFTHPHPPSFLLPLPGAAAAMILLEVNNRIIEETLALKFENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDKTKVMVSISLKFYKELQAHGADELLKRVYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASKDSIVHQAGMLKRNCFASVFEKYFQFQEEGKEGENRAVIHYRDDETMYVESKKDRVTVVFSTVFKDDDDVVIGKVFMQEFKEGRRASHTAPQVLFSHRRRKRLATEGWNPCYWIIVAFNVAPLQILKGFSVLVPFCTRLENNLQK	67819	98765	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11720_pilon_+_68138_76925_76961_78408_78522_82238_82285_86227_86415_87069_87164_93133_93193_98337
935775	contig_2069_pilon	+	2281	13	Intergenic	novelGene_23257	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	266.991208760805	1	80	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	238	717	1014	1730	341330	343975	FALSE	45	GATTTTTGTAAATAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLKPGTMSPKAFLEEAQIMKQLRHDKLVQLYAVVSKEPIYIVTEFMCDGSLLEFLKDQKGQALKLPQLVDMAAQIAEGMAYMERMNYIHRDLRAANILVGERLVCKIADFGLARLIEDDEYNSRQGAKFPIKWTAPEAALYGKFTIKSDVWSFGILLTELISKGRVPYPGMSNREVMEQVEHGYHMPCPPGCPVSLYEAMEQTWRLDPDERPTFEYLQSFLEDYFTSTEPQYQPGDQA	324008	344526	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2069_pilon_+_324112_332932_332996_333885_334103_334697_334801_335607_335707_339002_339107_339558_339693_341058_341214_341294_341475_341999_342077_342574_342729_343519_343652_343766
935777	contig_5419_pilon	+	3561	10	Intergenic	novelGene_15504	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	592.510103054979	1	132	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	402	1209	167	1375	243802	249830	TRUE	30	TGACATCACAGACTCCTTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLIVNILAVAGGCLMGFCKLAKSVEMLILGRLIIGLFCGLCTGFVPMYIGEISPTALRGAFGTLNQLGIVIGILVAQIFGLEVIFGSEELWPVLLGFTIIPAVLQSAALPFCPESPRFLLINRKEEENAKQILQRLRGTQDVNQDIQEMKDESARMAQEKQVTVLELFRSPSYRQPLMIAVMLQLSQQLSGINAVFYYSTGIFKDAGVQEPIYATIGAGVVNTVFTVVSVFLVEKAGRRTLHMLGLGGMAACSLLMTISLLLKDQYNWMSFVCIVAILIFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAVAVAGCSNWTSNFLVGLLFPSAISILGPYVFIIFTAFLVIFLIFTFFKVPETRGRTFEDITRAFEGQTQEMSRSGKDPVEMNSIQPEKETTTNV	238895	252119	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_238934_240581_240695_243786_244033_244283_244447_244780_244969_247536_247642_248009_248112_248673_248878_249614_251524_251626
935778	contig_5419_pilon	+	1422	2	Intergenic	novelGene_15518	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	73	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	AGGAGATTGGACCCTGATAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	250204	251721	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5419_pilon_+_251248_251342
935779	contig_10930_pilon	+	1819	7	Intergenic	novelGene_37039	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	99	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	1272	1724	276743	280292	FALSE	35	AACTTCTGAAATCGTAAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMCHQFSLCIVHHVGIILIIAIGRACGVTRITWLFVPNIHQDIDRIVLSQATESCLHRCVTKSVGILTWNPVHLRVWDILQIRKNGFPSKVPSIKCIFWSHNDLSALLSCLCNRFLQNIYILVHQEQGIFLRNGCFCFVWQYDSMFIHCS	267840	280387	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10930_pilon_+_268576_272833_273013_273986_274324_276722_276748_278454_278637_279700_279834_280159
935780	contig_14441_pilon	+	901	5	Intergenic	novelGene_100619	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	402.562417520563	4	43	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	367	795	116728	117610	FALSE	15	GAGACCCCCTACCCCGGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111215	117716	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111380_111986_112040_116578_116963_117220_117344_117539
935781	contig_9807_pilon	-	1693	12	Intergenic	novelGene_32906	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	51	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	ACTTCAGGAGGTGCTCCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	158962	126680	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9807_pilon_-_126773_128548_128716_139397_139476_140298_140382_140723_140956_145113_145204_147121_147286_148970_149047_151709_151818_154093_154270_156624_156772_158682
935782	contig_5988_pilon	+	1183	10	Intergenic	novelGene_16100	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_9	1655.58655451963	1	61	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	24	737	1218380	1224777	TRUE	5	TTTTCTTGTTTGTGGTGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CATDAGTMNIFDRKINLDALLKFSHITPSTQQHLKKVYASFALCMFVAAAGAYVHVVTHFIQAGLLSALGSLGLMIWLMATPHSHETEQKRLGLLAGFAFLTGVGLGPALELCISINPSILPTAFMGTAMIFTCFTLSALYARRRSYLFLGGILMSAMSLMVLSSLGNLFFGSIWLFQANLYVGLVVMCGFVLFDTQLIIEKAENGDKDYIWHCVDLFLDFVTLFRKLMMILAMNEKDKKKEKK	1218356	1226937	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5988_pilon_+_1218436_1218867_1218977_1219915_1220037_1221373_1221423_1221717_1221816_1222026_1222107_1222579_1222681_1223384_1223461_1224753_1224943_1226656
935783	contig_11115_pilon	+	1670	7	Intergenic	novelGene_102807	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	708.028816896287	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	242	729	743	1471	171704	173107	FALSE	45	ATCAATAAAGCCTTCAAACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSPHLTAPHILEVGKEFTVDCSLDGVFPVWKAQVHLALGDQMLNLTVLRHRDAFTATAMATTREEQEGAQIVCNVTLGGDSRETRKNVTVYRFEEPMLYLSKDSVLEGTMVNVTCKAGTRVTVKLDGAPIMAPGQPAQLQLNATESDDGRNFSCNARLEVGRKILHKNRSVQLSVLYGPKIDRAKCPQHWMWKERSYQVLECQARGNPAPTMNCSQEVSKLNVPVGIPFLVKLYHNGIYHW	165319	173306	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11115_pilon_+_165690_166252_166520_171238_171336_171695_171981_172339_172595_172714_172907_173102
935784	contig_1263_pilon	-	1190	6	Intergenic	novelGene_170401	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1154	junction_4	476.149808358672	1	73	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	30	1133	65090	55502	FALSE	15	TTAAGTTGCTTTCTTTTATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DKLIELFKDMPQLKDLVKTLKLEKSKVAKKIKAKETTPMRKSSQAEADSATPAPTTSNNVTSERVEETPGGQKRKNTTKEKSGIKRSKVSQGQSQPPCPSGASTSATLGHPAPLQISSSTPPSTSLPENQRPQAQHQAAAKRNILQKTPLIVMVLKAAEPFEFESPEKSKNMMFHATVATENKFFQVKVFNTNLKEKFIPKRVIVITDYSECKGILEIKEASSVSEAGPAQKIEVPTRIIKRANETPKIDNLQKQASGTLVYGLFMLHKKTVNKKNTIYEIQDDTGKMDVVGNGKWYNIKCEEGDKLRLFCLQLRTIDHKLKLTCGIHSFIQVIKTKKNNKGPINFNLNLEVEVRNPFPSQLSGINSDFVKVETSI	65119	55444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1263_pilon_-_55637_58131_58321_59765_60189_63285_63454_63985_64123_65038
935785	contig_12605_pilon	+	1260	3	Intergenic	novelGene_64206	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	3933	junction_1	316	1	58	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	122	369	21	389	3897	4829	FALSE	10	TTCTGTATTTTTTTACCTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPEYWERADTDRQGQRTDLPSEPGEPARLLQPERRRVSHPPGDVWL	3876	5700	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4535_4795
935786	contig_854_pilon	+	766	7	Intergenic	novelGene_36204	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	1	23	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	137	715	543600	562402	TRUE	30	TACGCAAAGCCAGATGGTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543463	563078	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
935787	contig_854_pilon	+	1205	8	Intergenic	novelGene_36207	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	2608.86268128392	1	62	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	120	363	126	488	543600	562280	TRUE	15	CCCCACCGTCTCTCAAGTGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCSPIRRAWRWPRRLTR	543474	563622	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557619_557712_557752_562271_562405_563029
935788	contig_854_pilon	+	1446	7	Intergenic	novelGene_36237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	2407	junction_6	2193.58925178702	1	86	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	112	690	543600	562402	TRUE	40	CAAGTTTGGAAATATAACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDSKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLICFSLVSPASYENVRAKWFPEVRHHCPSTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLSPITYPQGLALAKEIDSVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPQPTRQQKRSCSIL	543488	563783	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_+_543635_545916_545989_556082_556201_557001_557065_557591_557752_562271_562405_563029
935789	contig_12079_pilon	-	2307	9	Intergenic	novelGene_67551	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	668	junction_2	143.591815139304	1	125	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	720	2163	59	2221	871668	861365	FALSE	35	AGTCAAGAATAAGCTCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GRTTVAGAQFITGQSAQPLMKVISSCNSSKTLNADNMETLIGCQPEGDVKELPLLASCESEDSICQLIEIKKRKKVLPWPFLMRRLSSSSDFSGALEPEMKASLFDQPLSAICGEDDTLPRPIQDILTILCMKGPSTEGIFRKAANEKARKELKEELNSGGMVDLESRPVHLLAVVFKDFLRSIPLKLLSSDLFEEWMGALDRQSEEDRIDALKQVADKLPRPNLVLLKHLVSVLYLISKNSDTNKMDSSNLAICIGPNMLTLENDQNLSFEARKDLNNKVKTLVEFLIDNCLEVFGENTPAPSSTASDDSLEHTDSSDVSTLLNDSAYDSTDPDVDAHSVISSQSRQPPGPATMAASVDNREPQYPCESGLKPIVSTVARLKGSIDQPDRRYSEPNMSSSQEYLENRITSQKLTKSEDNFTMPLVGSSFESEDTGDPFPEEVFPAVEGKPKRSLDLRAKSVTQGPRGLLLKAFSSGSLDVSSDSSPIVSPSSPKRNFFTRHQSFTTKTDRGKPNREIKKHSTSFSFAPHKRGQTKTTSCGSGKYKGFPRDQVKKGFKKESQLAGRIIQESWSETHSQTALDFSSRAYAFSVDDVFQQVDQRIPGSPPSYEEAVQCQAFELAAYRGQTVRSMRARMLSQDAIRPPLLPSHHGGDSNTCSKESPSGHRLSPVTGGWKQSRTVCASVETKEEVTVPGRSALYRLRTVSESIQKNKQDYLVRRCSQPVFEADQLQYARESYI	871726	861278	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12079_pilon_-_862630_863468_863584_864504_864701_866539_866650_867247_867410_868246_868414_871103_871171_871500_871555_871641
935790	contig_5189_pilon	-	899	2	Intergenic	novelGene_34863	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	42	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	AGCAAGCTGACTTTTTAATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	199290	198334	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5189_pilon_-_198909_198965
935791	contig_8330_pilon	+	1273	8	Intergenic	novelGene_71831	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	100	junction_2	153.570697672679	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	195	588	45	632	855050	856687	TRUE	45	TACAAGAAGTACGAATCTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	855005	857542	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
935792	contig_8330_pilon	+	1961	14	Intergenic	novelGene_71781	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	553.695364088429	1	73	10	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	219	1322	852673	856687	TRUE	40	TTTACAAGAAGTACGAATCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFFRSGWALSLKDLKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPRGPEREEILHQV	837186	857540	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_+_837246_837591_837683_852604_852688_853011_853126_853234_853348_853839_854060_854995_855090_855283_855350_855434_855535_855624_855716_856196_856271_856362_856560_856667_856755_856968
935793	contig_15304_pilon	-	997	3	Intergenic	novelGene_30565	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1714.5	5	4	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	214	645	191	835	54100	53061	FALSE	25	TCCGTGCTCCACCAGAAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETSPRVFPLSLQRAASCENVVVACLVQGFFPPEPLKVTWNHSGENVTVTNYPPIQDTAGVLYTMSSQLTLPADQCPDNKCLTCHVQHNSSSQEAKVPCKVPGCPSVCHPSLTLHRPALEDLLLGSEANLTCTLSGLKDPEGATFTWQTSGGTDAVQKAPERDSCGCYSVSSILPGCREPWKSGKNFSCTATHPELPTPGPPAATTGGGAGAERTGDTDMRGAWIQPPRRAGALAARGPAAAPKQLPDLAPTAGARPGSCHLCRDQCAARGGPDLEAG	54290	52898	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_53314_53529_53813_53991
935794	contig_16103_pilon	+	2027	15	Intergenic	novelGene_118921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	439.633892214503	1	102	8	FALSE	0	NA	NA	A	coding	150	453	726	1178	788403	789327	TRUE	20	TGCTACGACTTCAGGTAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MLGKGFGDVGEAKGGSTTGSQFLEQFKTAQALAQLAAQHSQSGSTTTSSWDMGSTTQSSSLVQYGFNSAQSIYKAPGLHPIFNYDGGVPSGEAICGGYLHSGTSTPLLSSAEQIHLGSPDVSRLFRQPVLQPTAGSAETKTAKEKSLLDF	776732	794105	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16103_pilon_+_776893_777333_777430_777834_777881_778572_778686_782322_782376_784334_784414_785517_785690_788396_788596_789067_789329_789469_789643_790827_791018_791769_791825_792256_792432_792776_792850_793923
935796	contig_5236_pilon	+	1990	15	Intergenic	novelGene_100896	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_10	174.199056324912	1	84	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	440	1323	30	1352	67078	77057	TRUE	40	CATGAAATGATTTTTATAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGGTIYPGLMLTSAAIYHVLHFLHITIDIRNVCVFLAPLFSSFTTIVTYHLTKELKDAGAGLLAAAMIAVVPGYISRSVAGSYDNEGIAIFCMLLTYYMWIKAVKTGSIYWAAKCALAYFYMVSSWGGYVFLINLIPLHVLVLMLTGRFSHRIYVAYCTVYCLGTILSMQISFVGFQPVLSSEHMAAFGVFGLCQIHAFVDYLRSKLNPQQFEVLFRSVISLVGFVLLTVGALLMLTGKISPWTGRFYSLLDPSYAKNNIPIIASVSEHQPTTWSSYYFDLQLLVFMFPVGLYYCFSNLSDARIFIIMYGVTSMYFSAVMVRLMLVLAPVMCILSGIGVSQVLSTYMKNLDISRPDKKSKKQQDSTYPIKNEVASGMILVMAFFLITYTFHSTWVTSEAYSSPSIVLSARGGDGSRIIFDDFREAYYWLRHNTPEVKIWELQLWQIGQF	66587	84238	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5236_pilon_+_66612_67072_67219_68413_68505_69704_69812_70440_70606_71870_72052_72875_73032_74060_74153_75044_75201_75463_75667_77026_77105_77241_77345_81585_81775_83319_83427_84046
935797	contig_3095_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_75089	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	42	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935799	contig_8934_pilon	-	3780	2	Intergenic	novelGene_167244	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	20	84	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	148	447	3024	3470	641663	641217	FALSE	65	ATAAAAAGCCAGGAAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAYYTGNDKLKRNGVTFIITKNISKSILKYNTVSDKIISRCLQGRPVNTTIIQIYTPTAIAKDEEIEDFYQLLQSEIDQMCNRDALIITGDWNAKTGNKEEGLVVEKYGLGDRNDAGDRMIEFCKTNDFFMANTFYNNINGDYKRGLQ	676953	640906	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8934_pilon_-_642207_674473
935800	contig_15449_pilon	-	1193	4	Intergenic	novelGene_33614	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	84	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CGTTCTCAGCAGATTCAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55611	51209	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15449_pilon_-_51336_51827_51894_54563_55233_55279
935801	contig_9955_pilon	+	1904	2	Intergenic	novelGene_21315	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	77	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TCAGCACACCGCACCCAGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45977	49837	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9955_pilon_+_47755_49710
935802	contig_10225_pilon	-	1898	10	Intergenic	novelGene_86785	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	52	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	38	319	47709	47428	TRUE	5	GCTCGGCTCAGCCTGCTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QDVYISNINTTHMTTHTHGHTHAYIHGYTHVHTQPSLNALGLGDPYNPAILQAASPSPHCPSQRSSEALGTRAVAGGSSGSPGPQERAARQTSPGPALLPLPPFL	47746	20679	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10225_pilon_-_20921_35631_35784_37030_37144_38520_38646_39861_39911_40139_40305_40967_41051_41435_41458_46290_46750_47257
935803	contig_3956_pilon	+	1994	8	Intergenic	novelGene_14833	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1561.40050948513	1	84	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	196	591	715	1305	1288971	1290310	FALSE	15	TATGGTGGTGACTGTGTGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGKLHG	1281598	1290999	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282894_1287276_1287536_1287968_1288046_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289896_1290297
935804	contig_7408_pilon	+	1781	6	Intergenic	novelGene_168742	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	123	369	1413	1781	38571	48275	FALSE	5	ACCTCCCGCCCGCCGCTGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDGTGVFKYCLNELINTRHLQGRNGFPGALTELNSRWGSSEHALLVSGKREVAPEVRSPALDGLAGPQVGPWSLPPHRTPGRPLLRSRSHRLRRRPVGSASIRRCGGARSLLHGSTERNLPGT	12318	48275	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7408_pilon_+_13227_24281_24447_26372_26506_38364_38596_47841_48042_48131
935805	SIRV5	+	824	4	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	32	-25	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	2	35	1	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TATGCCTTCGAGTAAAGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8347	11841	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NNC_SIRV5_+_8382_8454_8586_10858_10986_11309
935806	contig_3948_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_53220	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	115	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	80	GCCAAAAAAACAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	841404	839333	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3948_pilon_-_839300_841400
935807	contig_3077_pilon	+	1741	10	Intergenic	novelGene_26879	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	75.0976319266304	1	96	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	259	780	180	959	1338614	1346705	FALSE	30	TATGACCTCAGATGATACCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKIPSNFVNPEELDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQNQDNGDYINANYIRGYDGQEKVYIATQGPMPNTVADFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEEIYGPFQIRIQDMKERPEYTVRQLTIQYQEKCRSVKHVLFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAANTGPIVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLRARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTTEQYQFLHHTLALYAAQLPEESSP	1337827	1347487	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3077_pilon_+_1337906_1338432_1338509_1338588_1338617_1338919_1339005_1340761_1340839_1342061_1342200_1342589_1342701_1343470_1343629_1345320_1345435_1346611
935808	contig_8330_pilon	-	1785	9	Intergenic	novelGene_71815	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	48	5	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CACTTTGGTACCATTAGAGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	857818	852623	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8330_pilon_-_852685_853008_853124_853232_853347_853836_854067_855003_855067_856192_856269_856372_856558_856665_856755_856966
935809	contig_11328_pilon	-	829	6	Intergenic	novelGene_88408	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3293	2	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAGACCCAACTTCCGCTCAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	648038	643646	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11328_pilon_-_643687_644248_644381_644803_645014_645225_645374_647062_647221_647897
935810	contig_3956_pilon	+	1399	6	Intergenic	novelGene_15017	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1743.9915596126	1	58	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	152	459	81	539	1281682	1284120	TRUE	15	TGTGTGGAGCCTACGCGACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVCVCRQRLSCARPSPSVSSPC	1281601	1291011	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283969_1284054_1284267_1284684_1284829_1290441
935811	contig_3956_pilon	+	1422	9	Intergenic	novelGene_14925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_5	1425.82397230514	1	55	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	447	1341	81	1421	1281682	1290727	FALSE	10	GACTTATTTGGCTGGTGGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYVRVHSPTSSRSSHAWRRHPGPPALPRGVGDHSVPSPQHPHLMPFFLIFISRFQRAAEMASLQ	1281601	1290728	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284684_1284791_1289004_1289229_1289493_1289677_1289758_1289790_1290542
935812	contig_3956_pilon	+	1156	5	Intergenic	novelGene_15177	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_3	1318.66807802419	1	37	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	621	25	645	1282731	1284748	TRUE	10	GGTGGTGACTGTGTGGAGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMPWALGLASTAGPSP	1282706	1291002	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1282913_1283793_1283976_1284054_1284267_1284703_1284769_1290511
935813	contig_6102_pilon	-	2433	17	Intergenic	novelGene_31904	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_1	0.242061459137964	1	63	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TCAGGCCCTTCACATATTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395262	374660	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_374766_374890_374973_375259_375312_375445_375481_378906_379020_379322_379487_379615_379816_380538_380635_380897_380970_381061_381155_393032_393143_393275_393433_393549_393633_393734_393855_393928_394031_394217_394270_394465
935814	contig_7119_pilon	+	1930	3	Intergenic	novelGene_40926	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	28	1	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	115	882	138713	139896	FALSE	30	GAACACTGATGGCTGAATCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLPEQCTVAWARSLSLKQRNYLSWAHEAALPCSAEYGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGLQPRKPCPRSLQPQKPRPQNLLPQGVQQCPFFCPLILKATSLWQSTSRLMSAPSNGRTCRNCPPVAP	127492	140944	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_138707_139275_139690
935815	contig_4486_pilon	-	2190	12	Intergenic	novelGene_38602	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10	95	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GGAGATTTGCAAATCCCACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	413437	343032	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4486_pilon_-_343091_360533_360641_376090_376193_377339_377475_385368_385486_389956_390050_391118_391215_392811_392869_399304_399431_407557_407691_411178_411305_412397
935816	contig_9839_pilon	+	881	6	Intergenic	novelGene_88511	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	1668.24883036075	1	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	127	384	86	469	49467	57761	TRUE	35	AAAAAATCACTTGTTTTCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MISQHTPNETIVILAPNDFKFPQTEKPKPTNPRQDSLAKCLMTEIKVLGSIQIMCGLMVLSLGLILMSSSFSPQFTPVYSTLLKSAYPFLGAFYQPGHKHSELFICCSGFHSPLYQPGCFGPCLTAV	45355	61486	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9839_pilon_+_45425_49450_49614_52066_52200_57657_57850_59824_59927_61264
935817	contig_5023_pilon	+	2143	7	Intergenic	novelGene_7357	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1637.32871877743	1	120	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	93	282	180	461	618569	639083	TRUE	10	TTTTTGGTGTCTGTAGATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIGCHVVNIGAEDLKEGKPYLVLGLLWQVIKIGLFADIELSRNEALVALLREGESLEDLMKLSPEELLLRWANYHLENAGCSKIGNFSSDIKDSKAYYHLLEQVAPKGDEEGIPAVVIDMSGLREKDDIQRAECMLQQAERLGCRQFVTATD	616446	648301	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5023_pilon_+_616582_618524_618668_622527_622624_625648_625733_639080_639197_643413_643539_646857
935818	contig_14618_pilon	+	827	1	Intergenic	novelGene_136803	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	19	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TGTTCCACCCCCAATAATTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401799	402626	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14618_pilon_+_401800_402600
935819	contig_14851_pilon	+	1833	1	Intergenic	novelGene_134693	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	88	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CTTAATGATCACACATCCCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	401715	403548	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14851_pilon_+_401700_403500
935820	contig_10734_pilon	-	1923	4	Intergenic	novelGene_51023	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_3	503.907398900499	1	83	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	189	570	95	664	320632	311551	FALSE	35	ACTTTAAGACAACTGTTGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLAELLVLLAALLATASGYFVSIDAHAEECFFERVTSGTKMGLIFEITGPDNKGIYKGDRESSGKYTFAAHMDGTYKFCFSNRMSTMTPKIVMFTIDIGEAPKGQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVKHEQEYMEVRERIHRAINDNTNSRVVLWSFFEALVLVAMTLGQIYYLKRFFEVRRVV	320726	310291	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10734_pilon_-_311676_315844_315953_318838_319032_320488
935821	contig_11338_pilon	-	946	4	Intergenic	novelGene_6364	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	279.585804758078	1	30	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	49	150	261	410	314779	295354	FALSE	20	CTAGAGTTGATTCAGGGGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYVN	315243	294817	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_306843_306964_314758_314939_315142
935822	contig_11338_pilon	-	2139	14	Intergenic	novelGene_6346	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	319.708428556303	1	128	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	1	804	323192	314886	TRUE	35	GTTGATTCAGGGGCCAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQTTPFVKMWMNVPWSKTRVTTPPTASTLWVAINAAADLAGSRYLGHPMAQTTPFVKMSFPSWTRPSGVSRASPASLTKFRIWAETSSQTQLITPSRVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSSDTWARAEGALCLLGA	323192	294812	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_298714_298826_298907_299077_300261_300354_300825_300876_306727_306964_314758_314939_315150_315337_315545_315654_318590_318755_319185_319264_319385_319427_321311_321459_323165
935823	contig_11338_pilon	-	1675	10	Intergenic	novelGene_6372	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	297.645202660259	1	68	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	346	1041	265	1305	319426	295341	FALSE	25	CACACCACTGTCTAGATTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDVNECSLKQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCRPGWKPIPGSPNGPNNTVCEDVDECSLEQNPCHNTTHCLNTVGGYKCRCSKPCPVPAEMSFPSWTRPSGVSSQSLSRFFDKVQDLGRDFKPDSAHYTIKNLTWEVDELLETPGDLENLSHSEQHCVATNLLDGLENVLKVLSKFLPKGPLTLRARAGTDLSLDVMEQRVREVTLGQNYTRMLLKWDTEQEPKDSDPFVVGLVSIPGIGKLLAEAALHETHKSLQWGVSSILLSDVNSAFLSNSDTQKLSSPVTFIFSHHPVTLGPGQKVLCVFWEHRKHGCGHWATTGCRTVSTEDTNTTCHCTHLSSFAVLMAQYDVQVLCTIIAGALHYLYLAAFAWMLLEGLHLFLTARNLTVVNYSSMRRRMKKLMFPVGYGVPALIVAISAASRPHLYGTSARLIRKLF	323316	294970	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_11338_pilon_-_295363_306727_306964_314758_314939_315142_315337_315545_315654_318590_318769_319185_319264_319381_319452_321370_321459_323165
935824	SIRV3	+	432	1	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	4842	1721	2783	500	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	19	NA	NA	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	65	ATAAAGAAGAAAGAATAATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6786	7218	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	ISM_SIRV3_+_6800_7200
935825	contig_14441_pilon	+	842	5	Intergenic	novelGene_100618	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	401.557281094491	4	35	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	142	429	367	795	116728	117610	FALSE	15	TCACGTCCCCACTCATGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALSGVSTDPEPRLEPSADNSSYCLSSRLRVSAAFWHNPRNHFRCQVQFYGLSADDEWGETRPKPVTQNVSAVVWGRAGCPPPSFLPAGGPVGHCPLRGPAGESGPVRRAGQRPRADGHGQEEGVLKAALEGSQELLALRHV	111215	117657	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14441_pilon_+_111392_113167_113209_116578_116963_117220_117344_117539
935826	contig_13519_pilon	+	1606	12	Intergenic	novelGene_124632	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	323.954899421978	1	98	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	328	987	119	1105	66179	98679	TRUE	50	ATTCATGAAGAAAAGGAGCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSRQPLSCLTEKGDNPNESIGNGPPNLAHPNLDTFTPEELLQQMKELLIENHQLKEAMKLNNQAMKGRFEELSAWTEKQKEERQFFEIQSKEAKERLMALSHENEKLKEELGKLKEKVERSFENPPGDSKVPKTEPEQEMEQLKTQVIRLQAEKADLLGIVSELQLKLNSSGSSEDSFVEIRMAEGEADGALKEIKTSPRPTRTDSINNRSRSAEGARNYLEFEELTVSQLLHCLREGNQKVERLEIALKEARERISNFEKKANDRSEIETQTEESTGAEKEEEKGTETVGSEVEMLKLQVTTLFKELQEAHTKLSEAELMKKRLQEK	57041	115564	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13519_pilon_+_57149_66167_66345_67592_67796_72486_72670_79401_79476_82117_82256_95191_95295_98559_98727_99998_100149_100536_100631_102213_102373_115513
935827	contig_7898_pilon	-	1090	8	Intergenic	novelGene_47534	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_7	3181.33978322444	1	54	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	318	957	72	1028	285587	282118	FALSE	25	CTCTTAAAAGCCCTCTGCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDITEETLHSRFLEGVRNVASVCLQIGYPTVASVPHSIISGYKRVLALSVETDYTFPLAEKVKAFLADPSAFVAAAPVAAAATTAAPAAASAPAKVEAKEESEESDEDMGFGLFD	286099	282055	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_282283_282654_282796_283676_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533_285636_286076
935828	contig_9177_pilon	-	1332	11	Intergenic	novelGene_32616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	1366	junction_3	507.386056174192	1	39	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	354	1062	269	1330	6586	2461	FALSE	25	GAAGGCTGCAGCCTTTGAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVSTITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAIFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAA	7043	2458	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9177_pilon_-_2512_2661_2845_2940_3004_3136_3263_3374_3500_3697_3804_4277_4386_4517_4704_6472_6590_6688_6815_6904
935832	contig_5936_pilon	-	1710	1	Intergenic	novelGene_53580	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	101	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	127	381	1328	1708	345963	345583	NA	85	AATTAAAAAAAAAAAAAAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMASANSQNKESRNFLQEENFLELLEVEYKRVIHRTLQDIRKEIWKNAEKATEELKKIREEHNDKLNRLQETTDRQQTEIQKINNKISELDNSTESNSSRTEAMEVRISEIEDTALDTNLFGENSDK	347290	345580	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5936_pilon_-_345600_347300
935834	contig_5039_pilon	+	2988	4	Intergenic	novelGene_64986	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	237	40	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	311	936	407	1342	1679067	1680059	TRUE	5	CCGCGCCCGGGGGCGGGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSCPDNSSAPVATGCPDNSSALVAEASPDNSGTPVTEDCPGNCCLSNPVAVVTSGCPGCSIVVIPTGCSNSVVVTGCSVNSIATVTTGCPGNSTAAVTTGSPGNSCAITGGSGTSCGGSNPTDDAGSPGNSCNNCGTGVTEGPGNSDTTVAGGPGNSGTGVEGGPGNSGTGIAEGPGNSSTGVTGGPCISGMEVAGGPGNSITEATDDSGSSSAVVLGSSCNSCGLVMDEAALPNGTSTGCSGNLSTSGADDSGKSTVVDVLGSGCTSAGISEESTRVSVDSSIFATGGSTNIIFDGSGDVLSKGFSTDFI	1678660	1687107	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_+_1679194_1679250_1680625_1682882_1683050_1686193
935836	contig_6102_pilon	+	2128	14	Intergenic	novelGene_31925	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_13	359.157478934459	2	65	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	237	714	2	715	379627	393075	TRUE	5	CCAGCTGTGGCTCTTTTCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RIHVLEAQDLIPKDRFLGGLVKGKSDPYVKLKLAGRSFRSRVVREDLNPRWNEVFEVIVTSIPGQELEVEVFDKDLDKDDFLGRCKVSLTAVLNSGFLDEWLTLEDVPSGRLHLRLERLTPRPTAAELEEVLQVNNLIQTHKSAELAAALLSVYLERAEDLPLRKGTKPPSPYATLTVGDTSHKTKTVSQTSAPVWDESATFLIKKPNTESLELQVRGEGGWHTGLVITAPLGAPRG	379625	395261	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_379795_379955_380039_380160_380210_380319_380410_380539_380636_380898_380971_381064_381152_393006_393149_393279_393435_393540_393640_393723_393856_393929_394036_394221_394276_394467
935837	contig_12605_pilon	+	964	5	Intergenic	novelGene_64201	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	2960.6692972198	2	50	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	314	942	23	964	3897	6237	FALSE	15	AGAGAGGGGTGTGGGGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QNPVFRVMASQILLLLLSGALALTQTRAGSHSLRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAANPRMEPRAPWIEREGPDGADRDGLTAGAGPGSHTLQEMYGCEVGPDGRLLRGYHQWAYDGADYIALNEDLRTWTAADTAAQITQRKWEKARVAENKKAYLEGTCVEWLRRYLENGKEMLQRADPPKTDVTHHPISDREATLRCWALGFYPADIILTWQRDEEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAIVVPSGEEQRYTCRVQHEGLTEPRTLRWEPPPQSIMGIVAGLVVFGLLVVGAVVAAVVIWRKKSSG	3874	6237	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12605_pilon_+_3961_4263_4436_4754_5072_5728_6005_6124
935840	contig_854_pilon	-	1419	7	Intergenic	novelGene_36678	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	49	4	FALSE	0	NA	NA	A	coding	204	615	469	1083	1706759	1702548	TRUE	5	CCAGCTTCCGGCGGGTCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSLTWACRVAICFSRFCLASSSSSSCSLKEFFSSSICFSLVLRLSFCRFSSCSSSVLQLGLQSGEVLCQLAGLAVRLTEKTCDIVQLNLHSLVTLSASSVRTLSPSLNFTCSSCSWASTFFRLCSESPLPCIRTFTSLASSPRSFSRVCFAFSRLAFTSSSVLVALPAPPRPGSVSASSPGSGPHGSWPPPQESSSGCSLPVHV	1707227	1701235	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_854_pilon_-_1701348_1701988_1702199_1702533_1702688_1704479_1704683_1704885_1704994_1705285_1705434_1706743
935841	contig_13453_pilon	-	3448	3	Intergenic	novelGene_146706	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	8	52	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	112	339	1189	1527	89002	88664	TRUE	35	ACGATCAATCGTGAGTTAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MNIGVHMSIRVTTLISLGYIPRSGIAGSNGMSISSFLRKRHIIFQNGCIILHSHQQCIRVPISPQPLQHLLFPVFLIRASNAGLRWYLIVVLICISLMASDREHFLMCLLAI	103893	67083	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13453_pilon_-_67130_86788_89950_103652
935842	contig_13172_pilon	-	2057	1	Intergenic	novelGene_146314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	68	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	102	309	868	1176	11255	10947	NA	25	TACATGGTGTGAAGTATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPIELDVPETLVATALHPGIQYLRKFGSVCGASMTFPCANCAVFSGIVYCLTFHQSYHLSIVCLVPPPFPSIVTNKDHFFLCVNFYMRFYCRGLMQYLSFCD	12122	10065	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13172_pilon_-_10100_12100
935843	contig_8377_pilon	+	1919	2	Intergenic	novelGene_35095	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	CAATATCATTTGTTAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	144592	146847	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_8377_pilon_+_144684_145019
935845	contig_7119_pilon	+	2424	3	Intergenic	novelGene_40903	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	222	junction_2	302	1	104	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	364	1095	211	1305	137044	139798	FALSE	40	AGCGCAGGCACTCAATAAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127458	140917	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137048_138707
935846	contig_6738_pilon	+	3235	3	Intergenic	novelGene_166125	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	136	junction_2	550.5	1	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTAGGAGGCTTACAGTGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	32659	40084	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6738_pilon_+_32756_36540_36701_37105
935847	contig_3956_pilon	-	911	3	Intergenic	novelGene_15284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	14	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	117	354	364	717	1290644	1289885	TRUE	10	AGCGCCGGGCTGTGGGGATG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGPRRHAEGQAGRGDVSRREKNVMTWGCGHALAESHPGLPAAAASEGHLQFVQEVVQGRDALLQAFALAGLGHHLAGAAGGVEGVSGQDLPVVEHTLGEGLAARVRPQVSREAK	1291007	1289608	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_-_1289675_1289756_1289891_1290296
935848	contig_12750_pilon	-	3027	3	Intergenic	novelGene_172616	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	17	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	CCCAGCCGGGGCTAAGAGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7295	364	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12750_pilon_-_808_1094_2215_5831
935849	contig_13702_pilon	+	816	1	Intergenic	novelGene_102647	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	28	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CCTCTGGGGTGGAGGAGGCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	210123	210939	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13702_pilon_+_210100_210900
935850	contig_6102_pilon	+	2088	17	Intergenic	novelGene_31851	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_16	506.313884858	1	67	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	599	1800	62	1861	370803	394665	FALSE	20	AGGATCACCTTCTTCCCTAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MERSPVEGSSPGPMDQPSAPSDPTDQLPTAHTKSDPGSGGQPAGPGAAGEALAVLTSFGRRLLVLVPVYLAGAMGLSLGFVLFGLALYIGWRRVRDEKERSLRAARQLLDDEERITVKTLYMSHRELPAWVNFPDVEKAEWLNKIVAQVWPFLGQYIEKLLAETVAPAVRGSNPHLQTFTFTRVELGEKPLRILGVKVHPGQSKEQILLDLNISYVGDIQIDVEVKKYFCKAGVKGMQLHGVLRVILEPLIGDLPIVGAVSLFFIQRPTLDINWTGMTNLLDIPGLSSLSDTMIMDSIAAFLVLPNRLLVPLVPDLKDVAQLRSPLPRGIVRIHLLAARGLGSKDKYVKGLIEGKSDPYALVRVGTQTFCSRVINEELNPQWGETYEVMVHEVPGQEIEVEVFDKDPDKDDFLGRMNLDVGKVLQTRVLDDWFLLQGGQGQVHLRLEWLSLLPDAEKLEQVLQWNRGVSSRPGPPTAAILVAYLDRAQDLPLKKGNKEPNPVVQLSLQDVTQESKPVYNTNCPVWEEAFRFFLQDPRSQELYVQVKDDSQALTLGALTLPLARLLTAPELTLDQWFQLSRQSVHRISPLTSQARTRAFA	370741	394892	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_+_371193_372705_372748_372940_373076_373200_373275_373405_373479_373635_373726_373903_373960_374383_374508_374590_374768_374892_374976_375262_375312_375445_375533_375636_375730_375966_376039_376207_376295_378881_378988_394603
935851	contig_6102_pilon	-	2541	20	Intergenic	novelGene_31905	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0.223296878269436	1	138	13	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGAACGTCTGGGTGCCCACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	395114	374714	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6102_pilon_-_374781_374902_374968_375259_375309_375445_375531_375634_375728_375966_376039_376199_376285_378875_379086_379937_380050_380285_380410_380537_380635_380897_380968_381061_381155_393014_393143_393275_393433_393538_393647_393727_393855_393928_394031_394220_394270_394465
935852	contig_9438_pilon	+	1583	1	Intergenic	novelGene_154272	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	6	107	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	121	366	496	861	475071	475436	NA	70	AAAGGGAAAAAGAGAAGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MTSSISEILLFIFWISNCCLCIISSCEFILAFCSCIIFLNSSNFLSVFFHEFVYFSSCLSAFCLSSWRILSIRDLNTLSGSSSVFSSRGESSGVLFWMPTGTILSCFCKCFVIVCCLQGIQ	474575	476158	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9438_pilon_+_474600_476200
935853	contig_14956_pilon	-	2071	1	Intergenic	novelGene_102958	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	27	64	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	178	534	1536	2069	782	249	NA	65	ACCAAAAGAAGCAGAAAAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MALREPASAGWCFWTSDCVRGKQRRPSVSEEGWRVGKRMSQIACALGTLRKEQIGCTEPGTRVKGMGGGERQGRNQEKQEKKEKKKKQHQQPTNDTQKAARSCAQNPSSRRPPVKRLQPQEVEEKTNKGPGISPAQQPRPGSSRTPKCIPTALQERAKTALGTRHPSKRRGRQQEASE	2317	246	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14956_pilon_-_200_2300
935854	contig_6365_pilon	+	1784	1	Intergenic	novelGene_134015	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	106	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GCGTAGAGGTGTACAACACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	131572	133356	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6365_pilon_+_131600_133400
935855	contig_16594_pilon	+	2424	2	Intergenic	novelGene_53805	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	81	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	ATATCTCCAGTACGTGAGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115146	117674	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115995_116098
935856	contig_16594_pilon	+	2415	2	Intergenic	novelGene_53804	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1	64	1	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CTATTATATATATCTCCAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	115146	117665	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16594_pilon_+_115995_116098
935857	contig_4180_pilon	+	802	5	Intergenic	novelGene_8396	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	1702.36341228893	1	28	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	115	348	135	482	882886	888134	FALSE	35	TAGTCAGCACCAGACTTAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MFDVEMHTSRDHSSQSEEEATEGEKEVETLKKSVEWVSDWSSRPENIPPKEFHFRHPKRSVSLSMRKSGAMKKGGIFSAEFLKVFIPSLFVSHVLALGLGIYIGKRLSTSSASTY	875236	888454	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_4180_pilon_+_875357_882871_882931_886082_886187_886317_886468_888085
935858	contig_2438_pilon	-	806	2	Intergenic	novelGene_112072	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	5	20	junction_1	0	1	41	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	ACTGCCAGCCCACCCAGGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	313487	312360	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_2438_pilon_-_312405_312725
935859	contig_14575_pilon	-	1094	11	Intergenic	novelGene_101894	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	30	4	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TACTGGTGACTTTTATTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	61604	30543	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_14575_pilon_-_30761_33860_33920_39339_39503_40650_40701_41533_41650_42755_42847_44945_45004_47300_47374_51062_51144_59250_59374_61541
935861	contig_7119_pilon	+	2455	3	Intergenic	novelGene_40897	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_2	413	1	125	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	367	1104	203	1306	137033	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127455	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137046_138707
935862	contig_7119_pilon	+	2380	3	Intergenic	novelGene_40927	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	460	1	119	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	145	1299	137033	139798	FALSE	25	TACTGAGGTATCCCACCACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127495	140879	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127597_136989_137097_138707
935863	contig_7119_pilon	-	2032	2	Intergenic	novelGene_40917	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	96	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	218	657	1315	1971	139626	127538	FALSE	20	CCGGCCAACCCCCAACGTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVAAGSVVRASVAAGPMNSMDSASVAVVPMDRASVVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPVDRASAVAGSMDRATVAVGSLERAPVVAGSVVSASLAVGPMDRASMVVSSMDVVFGMEGIAVASPVLRGSCALGLPCVASSVLRSPAAASLEPRPAESLVAGCTVTGSTVAGSGVPGPREVVSLL	140940	127476	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_-_127561_138992
935864	contig_7119_pilon	+	1854	2	Intergenic	novelGene_40924	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2	75	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	192	579	636	1214	139647	140225	FALSE	25	GATGAGGTCTGACTTACTGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGTTATEALSILFIRPAATEALSTEPAATEAPTTESATTRGPTMSFLLSSDPQSNITVAVNKPFDVSTKQWKNVQELSPSSSVTHSPTRGQDYNHVKQCLLAILILALVATIFLVCTVVLAIRLSRKNHTYPVRSYSPSEMVCISSLLPDGGEGPNPAAANGGLPNAKTQDPKPEPGESRDADDHTLHSFLP	127490	140865	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127557_139077
935865	contig_7119_pilon	+	2451	3	Intergenic	novelGene_40943	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	168	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	146	1300	137033	139798	FALSE	25	CTGATGGCTGAATCCTTCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127512	140949	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
935866	contig_7119_pilon	+	2479	3	Intergenic	novelGene_40919	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	127	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	176	1330	137033	139798	FALSE	20	CACTGATGGCTGAATCCTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127482	140947	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
935867	contig_7119_pilon	+	2475	3	Intergenic	novelGene_40921	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	1	143	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	173	1327	137033	139798	FALSE	25	ACACTGATGGCTGAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127485	140946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
935868	contig_7119_pilon	+	2154	1	Intergenic	novelGene_40979	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	102	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	277	834	166	999	138965	139798	NA	25	TGGCTGAATCCTTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	138799	140953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_138800_141000
935869	contig_3956_pilon	+	1718	9	Intergenic	novelGene_15268	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_4	1137.05683675004	1	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	203	612	61	672	1286220	1289148	TRUE	20	ACTGTGTGGAGCCTACGCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGSSSRGPVTWQRSTSGTWLRPARYGALGPTALAPTS	1286159	1291009	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1286224_1286409_1286606_1287276_1287536_1287968_1288013_1289039_1289229_1289493_1289677_1289758_1289790_1289851_1289892_1290297
935870	contig_13633_pilon	+	1601	12	Intergenic	novelGene_15314	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_7	328.091173581092	1	77	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	379	489	22853	28350	TRUE	35	TTCTGTGTGATAATACTAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VIRLFCGVAATESECHTQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLSLLR	5037	49448	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28441_28650_28746_31632_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
935871	contig_13633_pilon	-	1717	12	Intergenic	novelGene_15329	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	78	2	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	CTAAAAATCAGAAAAATTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	49448	21971	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_-_22174_22772_22884_23680_23743_24106_24173_28334_28442_28649_28743_31245_31365_31602_31770_37187_37358_37436_37512_39316_39431_49017
935872	contig_13633_pilon	+	1661	13	Intergenic	novelGene_15311	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	423.972548901721	1	49	7	FALSE	0	NA	NA	A	coding	36	111	384	494	22853	28350	TRUE	25	CTGATTCTGTGTGATAATAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LVIRLFCGVAATESECHTQAILPQATHLSLDILLWVRSLHFPLRVSILILVAFLQWEGVPTHQHQVEVTQELEATLPLEVIQPLEVILVPHSQEEPRPTLEFLQAKDLEAHQVEQAFLAIHSHQHSLMEVARHRFQYQVAFLEDRCLLSILEDKLLSPLSLLR	5032	49444	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_13633_pilon_+_5078_20257_20313_21971_22177_22774_22886_23682_23748_28337_28420_28717_28746_31247_31362_31599_31771_37187_37359_37437_37514_39319_39433_49019
935873	contig_10500_pilon	+	3362	8	Intergenic	novelGene_41255	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	4	88	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	CACAAACTCTGTCTGTGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1626835	1640141	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10500_pilon_+_1627892_1628163_1629572_1630545_1630730_1633137_1633231_1635076_1635204_1635518_1635615_1636938_1637066_1639870
935874	contig_7119_pilon	+	2555	3	Intergenic	novelGene_40887	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	826	junction_1	47	2	123	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	384	1155	246	1400	137033	139798	FALSE	25	TGGCTGAATCCTTCAAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MVTLCVRERNAARSYAIFMIVGAMPLQLLLLLTLLGSGSNLQLPVTQKDGTREAPGQLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	127412	140953	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_127602_136976_137097_138707
935875	contig_9833_pilon	-	2905	3	Intergenic	novelGene_68510	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	88	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	107	324	1292	1615	215789	214522	FALSE	20	TCATCCCTTCGGGAGCAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPRKQQTITKHLQKQDRMVPVGIQNKTPDDSLLEENALELPDREFKSLILRILQELRQKADKHEEKTDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSHHTQKLLQNGSKT	217627	213231	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9833_pilon_-_214562_215505_216563_217109
935876	contig_7119_pilon	+	2135	1	Intergenic	novelGene_40980	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	57	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	277	834	154	987	138965	139798	NA	25	ACACTGATGGCTGAATCCTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QLLAQGQRQVNTSGYPDFFGEYDYEYIGTDSPEKPEHSLRAVTVSTEPPFLMETLGQRGPVGPGTPEPATVEPVTVQPATRDSAGLGSREAAAGDLSTELATQGSPKAQDPLSTGLATAIPSIPKTTSMELTTMEALSMGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATAEALSTGPTAREALTTEPATTGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTTATEALSILFIGPAATEALTTEPAATGALSKEPTATVALSMEPATTEALSMGTRSPVHGDHSHRGTVHTVHKACSHGSPVHGACSHRSPDHRICYHKGSNNVLSFVL	138811	140946	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7119_pilon_+_138800_140900
935878	contig_7056_pilon	+	830	8	Intergenic	novelGene_43659	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1	21	3	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	CCCTTCAACCCAAGGACAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	723795	727077	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_+_723817_724504_724595_724685_724741_725176_725318_725469_725606_725661_725729_725809_725991_726938
935879	contig_7056_pilon	-	1702	15	Intergenic	novelGene_43644	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_13	1166.07509297171	2	93	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	372	1119	414	1532	728928	723226	TRUE	40	AAATCTTAACAGTTTTGCAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGHRYVEVFKSNNVEMDWVLKHTGPNSPDTANDGFVRLRGLPFGCSKEEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDFQGRSTGEAFVQFASQEIAEKALKKHKERIGHRYIEIFKSSRAEVRTHYDPPRKLMAMQRPGPYDRPGAGRGYNSIGRGAGFERMRRGAYGGGYGGYDDYNGYNDGYGFGSDRFGRDLNYCFSGMSDHRYGDGGSTFQSTTGHCVHMRGLPYRATENDIYNFFSPLNPVRVHIEIGPDGRVTGEADVEFATHEDAVAAMSKDKANMQHRYVELFLNSTAGASGGAYEHRYVELFLNSTAGASGGAYGSQMMGGMGLSNQSSYGGPASQQLSGGYGGGYGGQSSMSGYDQVLQENSSDFQSNIA	731001	722464	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7056_pilon_-_722635_723225_723276_723723_723817_724504_724595_724685_724746_725182_725319_725471_725606_725661_725734_725813_725993_726940_727080_728561_728706_728906_729063_729510_729645_730389_730513_730979
935880	contig_10058_pilon	+	3144	10	Intergenic	novelGene_67719	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	167.230896784973	2	123	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	307	924	74	997	72602	99369	TRUE	25	ATTGAGTTTGTTTAAATTCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MATKARVERKQLLLFTLAILSFLASFQDCPTSGCNYFLRSFLSTMKCHFGSCLWMSPLVLSKGSVYTSESVVKVAENEPATLSCSYSGFSSPRVEWKFVQGDTTSLVCYNSKITASYEDRVTFSQSGITFQSVTRKDTGMYTCMVSEDGGNNYGEVNVQLIVLVPPSKPTVNIPSSATIGNRAVLTCSEQDGSPPSEYYWFKDGTLMPMEPKSSRAFSNSSYTLNQNTGELIFDPVSAFDTGAYSCQAQNGYGSPARSDAVVMEAVELNVGGIVAAVLVTLILLGVLIFGIWFAYSRGYFESKQDFR	72528	101642	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10058_pilon_+_72663_96622_96728_97062_97132_97297_97406_97630_97778_98058_98262_98437_98541_98697_98810_99353_99407_99532
935881	contig_10159_pilon	+	2216	11	Intergenic	novelGene_30875	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_5	122.968288595068	1	119	9	FALSE	0	NA	NA	A	coding	344	1035	736	1770	978504	996016	FALSE	90	AAAAACAAACAAAAAAAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MREREYLQVLHFDTLLDDGVINMSIPIILPVSMDDKKRLEGCSEFALVYGGQRVAILQDPEFYEHRKEERCSRVWGTACDKHPHIKMVRESGDWLVGGDLQVLEKIRWNDGLDQYRLTPVELKQKCKEMNADAVFAFQLRNPVHNGHALLMQDTRRRLLERGYKHPVLLLHPLGGWTKDDDVPLDWRMKQHAAVLEEGVLDPKSTIVAIFPSPMLYAGPTEVQWHCRARMIAGVNFYIVGRDPAGMPHPEMKKDLYEPTHGGKVLSMAPGLTSVEIIPFRVAAYNKDKKAMDFYDPERHNEFDFISGTRMRKLAREGENPPDGFMAPKAWKVLIDYYKSLEKNN	970056	996462	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10159_pilon_+_970131_974248_974485_975159_975299_976399_976519_976643_976758_978450_978556_982654_982861_992071_992208_993300_993570_994447_994678_995874
935882	contig_1443_pilon	-	4015	8	Intergenic	novelGene_28284	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_6	293.798764949266	52	138	6	FALSE	0	NA	NA	A	coding	304	915	2432	3346	804678	748649	FALSE	30	AAAGAACCTGGTTTTTTATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFSQKAIFLLFPVKPHPAFPVHCPSQTTSCSNMDAQPGAAAARMTWSQGGLRNRCTPFLGDVFQLCDEPYQTPCFPDINLAAEPKVNRGKAGVKRSAAEMYGSVPEHPSPSPLLSSSFDLDYDFQRDYYDRMYSYPARVPPPPPIARAVVPSKRQRVSGNTSRRGKSGFNSKSGQRGSSSKSGKLKGDDLQTIKKELTQIKQKVDSLLESLEKIEKEQSKQGVEMKNDKSEEEQSSSSLKKDETNVKMESEGGADDSAEEGDLLDDDDNEDRGDDQLELIKDDEKEAEEGEDDRDSANGEDDS	807109	747979	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_1443_pilon_-_748733_748831_748993_749234_749349_750369_750531_766777_766826_767440_767564_776424_776462_804491
935883	contig_3956_pilon	+	1771	7	Intergenic	novelGene_14868	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1401.37821050881	2	60	2	FALSE	0	NA	NA	A	coding	255	768	483	1250	1288971	1290491	FALSE	15	GTGTGGAGCCTACGCGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDTTSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPALDNFLDKL	1281598	1291012	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3956_pilon_+_1281685_1282697_1282913_1283800_1283886_1288874_1289229_1289493_1289677_1289758_1289892_1290297
935885	contig_17144_pilon	-	2292	14	Intergenic	novelGene_29299	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	TRUE	non_canonical	0	0	junction_8	2103.72792242667	1	71	5	FALSE	0	NA	NA	A	coding	480	1443	555	1997	172736	166363	FALSE	10	TTCTTGAGTGTGCCTGAGTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPLEEDSGRIQGYLVSWRPSGQVGAVQLCNTTELNCTFHLPLEAWEVALVAYNTGGNSHPTSVVFMESRGPPLARLHAVARDPHSIWVGWDSPSSQPQAYVIEWGLGPPSPSGSNKTWRMEHNGNITGTLLQENIKPFELYEITVTPLYQDTMGPSQHIYAYSQEKAPSHAPELHLKHIGKTWAELEWVPEAPELGKSPLTHYTIFWTKAQKQSFSTVLNASSWNFVLRGLEPASLYHVHLMATSRGGATNNTGLTLMTLALDESELHILLGLFALLLLLISLCGAAWLCCSPSRKNHLWPSVPDPARSSLSAWVPTIMAEETFQLPSLRDPSMPPIAKITVLEEEEKKPGPWESSDNSGTCGVPTLVQAYVLQGGPREASTQPQPQSSTNDQVLYGQVLESPTSPGPGHYLRCDSTQPLLGGLTPSPKSYENLWFQTSPLGAPVSPSPSQEDDCIFGPLLDFPLLQGLRIHGVEGMGGF	183218	166067	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_17144_pilon_-_166843_167248_167331_167581_167676_167918_168060_168162_168310_168996_169099_170744_170934_172528_172834_174848_175001_175973_176005_176196_176271_179700_179786_181794_181850_183158
935888	contig_3095_pilon	+	1238	5	Intergenic	novelGene_75053	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	1	45	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	64	828	147241	151151	TRUE	10	GGTGGAGTTTTCAGTGTCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147177	152247	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935892	contig_3095_pilon	+	1239	5	Intergenic	novelGene_75090	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	2	37	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	59	823	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147182	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935893	contig_602_pilon	+	2350	1	Intergenic	novelGene_134968	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	2	22	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	50	ATGTAGAACAAAATTCTAAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	559989	562339	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_602_pilon_+_560000_562300
935895	contig_3095_pilon	+	1247	5	Intergenic	novelGene_75002	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	7	5610	junction_3	1007.93833516739	4	33	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	254	765	67	831	147241	151151	TRUE	20	GTTTTCAGTGTCTGATCAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAQSGVPGLGCFIMAVLMSFHQTWAIKEEHVIIQAEFYQTPDQSGEFMFDFDGDEIFHVDMEKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLDIMMKRSNYTPNNNESPEVTVLLNSPAEVGQPNILICFVDKFSPPVLNVTWLKNGKPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFYYLPFLPSVDEFYDCQVDHWGLDKPVLKHWELEVPAPLPETTENLVCILGLLVGLVGIVVGTIFIIKGVRKGNAVERRGPL	147174	152253	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_3095_pilon_+_147323_149649_149896_150413_150696_150996_151163_151848
935896	SIRV3	-	1243	3	NIC	SIRV3C	novel	589	3	NA	NA	974	1749	intron_retention	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	3777	42	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GATCACTTAACATATTGCTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8940	7010	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	NIC_SIRV3_-_7989_8127_8208_8755
935897	contig_9706_pilon	+	439	1	Intergenic	novelGene_20826	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	5	9	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	CGGTATGACCAACTCATACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	2182	2621	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_9706_pilon_+_2200_2600
935900	contig_7898_pilon	-	668	5	Intergenic	novelGene_47538	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	5680	junction_3	2018.33364127441	2	1	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	206	618	51	668	285587	283710	FALSE	35	ACAGAGGAAACTCTGCATTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPREDRATWKSNYFLKIIQLLDDYPKCFIVGADNVGSKQMQQIRMSLRGKAVVLMGKNTMMRKAIRGHLENNPALEKLLPHIRGNVGFVFTKEDLTEIRDMLLANKVPAAARAGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEKTSFFQALGITTKISRGTIEILSDVQLIKTGDKVGASEATLLNMLNISPFSFGLIIQQVFDNGSIYNPEVLDI	285637	283709	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_7898_pilon_-_283863_283958_284106_284229_284318_284421_284598_285533
935901	contig_5039_pilon	-	2985	5	Intergenic	novelGene_64775	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	9	45	3	FALSE	0	NA	NA	A	coding	167	504	1813	2316	129118	128615	FALSE	35	AATGGTGTAGGTATAGAACC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSKHLQKQDRMVPVSVQNKTPDDFPVEEKALELPDREFKSLLLRILQELKQKANKNEEKIDKFMENTDKKLEEFRKIMQEQNAKINSQLEIIRKQQLEIQKINNKISEMDGVIEGLRSRFEMVEDRISGIEDKHLGTTLFEENSEKRTKKNEETLRVMWDTIKSKNF	180516	127945	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_5039_pilon_-_129565_129947_131068_146780_146960_149360_149380_180468
935905	contig_6898_pilon	+	693	3	Intergenic	novelGene_35787	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	1755.5	1	12	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GAATACTTTACTGTGACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	124976	127696	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6898_pilon_+_125008_125481_125866_127418
935908	contig_15304_pilon	-	2584	6	Intergenic	novelGene_30642	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	664	junction_2	4387.38676662999	2	5	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	267	804	355	1158	106308	103245	FALSE	20	TGCGGTTTATCATGGAGGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CGTTSRSTVVLACVVTNYFPEPVTVSWNPGDQSGAHTFPAILQSSGLYSLSSTVTVPASSWPSQTYTCNVAHTPSKTNVKKKIESCRKPCLTECKCPAPELPGGPSVFIFPPKPKDFLMISRTPTVTCLVIDVGHDDREVHFTWYMDNKEVHTAKTTQEEEHHNSTYRIVSVLPILHQDWLKGKEFKCKVNNGALPAPVERTISKAKGQPQEPRVYVLPPHRDELAKNTVSLTCLVKGFYPSDIDVSWKSNQQAVPENSYVSTPALAEADGTFFLYSKLSVSKDSWQRESSFTCVVLHEALHNHYTEKSISLSPELHPDESCAEAQDGELDGLWTTISIFITLFLLSVCYSATITLFKVKWIFSSVVELKRTIVPDYRNMIGQAA	107181	101818	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_15304_pilon_-_103329_103548_103680_105638_105960_106040_106371_106480_106523_106931
935910	contig_12414_pilon	+	2708	1	Intergenic	novelGene_59583	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	48	NA	NA	0	NA	NA	A	coding	356	1071	1111	2181	372984	374054	NA	30	ATAAACTTAGTGTTATGTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAFPLPLLQFFTIDNDTEEVGSGDYDSIKEPCFREENAHFNRFFLPTIYSIIFLTGIVGNGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVVTLPFWAVDAVAGWYFGKFLCKAVHVIYTVNLYSSVLILAFISLDRYIAIVHATNSHGPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFANVSESDEKYICDRFYPSDLWMVMFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGHQKRKALKTTIILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAFFHCCLNPILYAFLGAKFKTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRAGHSSVSTESESSSFHSS	371873	374581	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_12414_pilon_+_371900_374600
935911	contig_16496_pilon	-	762	2	Intergenic	novelGene_5237	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	6	3964	junction_1	0	1	45	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	5	18	311	328	1225	1208	FALSE	35	GCCCCAGCTTGACAGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GELLEAIVRDFGSFEKFTKKLTAVCVGVQGSGWGWLGFNKERGLLQIAACSNQDPLEGTTGLIPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKAIWKVINWDNVTARYMACKK	3595	773	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_16496_pilon_-_1354_3413
935912	contig_10192_pilon	-	325	1	Intergenic	novelGene_178663	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	1	26	NA	NA	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GCAATCAACGTAATCCACCA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	29860	29535	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_10192_pilon_-_29500_29900
935915	contig_6576_pilon	+	2210	3	Intergenic	novelGene_42413	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_2	4219.5	1	57	1	FALSE	0	NA	NA	A	coding	398	1197	89	1285	1301228	1302809	FALSE	80	CAAAAAAAAAGGAAAAAATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MDLKYFILIFFCGYLNNTFSSETEAVTRKKQPQSTLLTLPVSYVLANSQNITGNPLSQPIQQFNISSEQPPPPTKVTAGKPTSAAYVSSGKPAAHTSGQLPAYNITRQPIPMANTFPRQSELPPSAHTSTRQPPPSSVYTSTQQPSLSAHTSSGKPIPLTVHSLTTQPTSNVKNPLVITPGFILETTKINSNLTAIVNSNLTAAILVAVIVISMLVAIIMIVLWKCLRKPVLNDQNWAGRSPFADGETPDICMDNIRENEVPGKRTSIVSLMTWKPSKSMLLADDLEIKLFESNENTDDSNNPKTEKSKDQVNGTSEDSADRSTIGTAVSSSDDADLPLPPPLFDLEGQENKQSDKPTMTIVSPLPNDSTNLPPPPDCLNQACEDHNSEIKQSFSLSI	1295688	1303734	ont_cdna_manatee	iso_detect_de_novo_birol_ont	Intergenic_contig_6576_pilon_+_1295761_1301211_1302417_1302801
