isoform	chrom	strand	length	exons	structural_category	associated_gene	associated_transcript	ref_length	ref_exons	diff_to_TSS	diff_to_TTS	diff_to_gene_TSS	diff_to_gene_TTS	subcategory	RTS_stage	all_canonical	min_sample_cov	min_cov	min_cov_pos	sd_cov	FL	n_indels	n_indels_junc	bite	iso_exp	gene_exp	ratio_exp	FSM_class	coding	ORF_length	CDS_length	CDS_start	CDS_end	CDS_genomic_start	CDS_genomic_end	predicted_NMD	perc_A_downstream_TTS	seq_A_downstream_TTS	dist_to_cage_peak	within_cage_peak	pos_cage_peak	dist_to_polya_site	within_polya_site	polyA_motif	polyA_dist	ORF_seq	TSS_genomic_coord	TTS_genomic_coord	experiment_id	entry_id	LRGASP_id
tx.1	SIRV1	-	379	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3552	111	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49998	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5	GGTGTCGTTTGCTTTCTCGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6814	6338	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV1_-_6464_6560
tx.10	SIRV1	+	741	3	NNC	SIRV1B	novel	464	3	NA	NA	-64	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	5801	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GCAACTTCGGCTAATCATGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10647	11643	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV1_+_10792_10882_11240_11403
tx.12	SIRV2	-	647	2	NNC	SIRV2A	novel	740	3	NA	NA	306	0	intron_retention	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	10522	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTTTGTTATCCTATATCGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4426	3643	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV2_-_3831_3966
tx.14	SIRV2	-	548	4	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	-69	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	33490	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTAATTGACGTGGACGTTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4801	3665	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV2_-_3831_3966_4095_4338_4480_4687
tx.15	SIRV2	-	190	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	0	-1086	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	26973	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTAAAACATACCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5895	4751	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV2_-_4790_5743
tx.16	SIRV3	-	395	2	ISM	SIRV3B	SIRV308	479	3	224	-2	224	2	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	46822	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1758	998	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV3_-_1168_1532
tx.17	SIRV3	-	481	3	FSM	SIRV3B	SIRV308	479	3	0	-2	0	2	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	1339947	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TTTTATTTGTATGGCGGACA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1982	998	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	FSM_SIRV3_-_1168_1532_1765_1902
tx.18	SIRV3	+	275	2	NNC	SIRV3A	novel	436	3	NA	NA	-1	-1943	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	111544	1	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TATGGTGTCTGCTATCGAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	4775	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV3_+_4081_4578
tx.19	SIRV3	-	282	2	Genic_Genomic	SIRV3D	novel	161	1	NA	NA	-13	599	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	28918	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATAGAACAATATGTTTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4775	4002	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Genic_Genomic_SIRV3_-_4081_4571
tx.20	SIRV3	+	289	2	ISM	SIRV3A	SIRV305	436	3	-1	1939	-1	-1939	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	49074	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	GTGTCTGCTATCGAGTCCCT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4002	4779	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV3_+_4081_4568
tx.21	SIRV3	+	297	2	ISM	SIRV3A	SIRV303	2018	3	2604	1680	564	-576	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	77256	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TGATGATTCACGTAAGGAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	4567	6142	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV3_+_4780_6057
tx.22	SIRV3	+	1022	2	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5103	731	3044	-84	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	48479	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TATTTTGACGTATAGGGAGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7047	8208	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV3_+_7989_8127
tx.23	SIRV3	+	1081	3	ISM	SIRV3A	SIRV301	2467	5	5103	124	3044	-122	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50462	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	TATTTATGTTGATTCGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7047	8815	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV3_+_7989_8127_8208_8755
tx.24	SIRV3	+	237	2	ISM	SIRV3A	SIRV304	1083	8	6192	-3	4152	1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	75061	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGTTAACGTCTCGTAAGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8155	8940	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV3_+_8208_8755
tx.25	SIRV4	+	946	2	NNC	SIRV4C	novel	950	2	NA	NA	-1	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18617	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TTCTTTATATGTTGTTGCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1454	2771	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV4_+_1881_2251
tx.26	SIRV4	+	259	2	Antisense	novelGene_SIRV4B_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3599	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	19	60	60	119	4057	5018	FALSE	40	TAGTGCTAAAGACATATTAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PVTVSEKPLPLPPIVFIGDMASPPGMTEAGPIGTSSLY	3997	5158	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV4_+_4106_5007
tx.27	SIRV4	-	221	2	FSM	SIRV4B	SIRV406	617	2	0	396	0	-396	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	223944	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	coding	39	120	2	121	5157	5038	TRUE	20	GCAATGGAAGTGGTTTTTCG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSDVNDLTIIVLNNVYDNINLCKDWSNINVKHVQIKAKR	5158	4033	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	FSM_SIRV4_-_4104_5007
tx.28	SIRV4	-	412	2	ISM	SIRV4A	SIRV404	592	4	5632	0	4946	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	70916	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	GATTTGATATTTAGAGCGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8991	8322	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV4_-_8373_8629
tx.29	SIRV4	-	164	2	ISM	SIRV4A	SIRV408	570	5	-1	5445	-1	-5139	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10005	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGCGAATTAACATCGGGTTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15123	13768	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV4_-_13829_15019
tx.3	SIRV1	-	353	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	2988	111	2714	-111	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	34555	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTAGGTTTGTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7652	6560	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV1_-_6814_7552
tx.30	SIRV5	+	137	2	NNC	SIRV5A	novel	2029	16	NA	NA	0	-253	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	1636	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGGTGCAATGGTATAACTTC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1000	3345	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV5_+_1091_3298
tx.31	SIRV5	+	197	3	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	897	1277	868	-77	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	58766	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	0	CGGGTGGCGGCGTTTCCGCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1924	2321	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV5_+_2034_2119_2157_2270
tx.32	SIRV5	+	267	2	ISM	SIRV5A	SIRV507	533	6	2271	-46	2242	46	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	5248	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTTATAACTTGTTGCGTTCC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3298	3644	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV5_+_3405_3483
tx.33	SIRV5	-	152	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	4062	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAGGCCATAACTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5627	5379	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV5_-_5451_5546
tx.34	SIRV5	+	501	2	NNC	SIRV5A	novel	885	4	NA	NA	-186	-2403	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	22514	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAGCTAAGAGTAGGCCGGGA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8015	8586	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV5_+_8385_8454
tx.35	SIRV5	-	203	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	116815	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	AGGGCACCGCGTTTTGAAGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10991	8521	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV5_-_8590_10856
tx.36	SIRV5	+	200	2	NNC	SIRV5A	novel	526	3	NA	NA	206	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	259663	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GTTTACCGCCAAAAAATGGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8521	10991	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV5_+_8589_10858
tx.37	SIRV6	-	163	2	Genic_Genomic	SIRV6B	novel	276	1	NA	NA	84	77	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	9526	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TGTATTTACAACTCCAAATT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	1736	1467	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Genic_Genomic_SIRV6_-_1542_1647
tx.38	SIRV6	+	442	3	NNC	SIRV6A	novel	485	4	NA	NA	164	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	10415	1	1	FALSE	0	NA	NA	C	coding	39	117	324	440	2002	2118	FALSE	30	GTCACAAGTCAAGCCATTGC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAIVGLDASTNVVIRLVCAIIYAIEAPAVVEAEDAISVA	1467	2120	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV6_+_1535_1640_1741_1845
tx.39	SIRV6	-	106	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2308905	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGATACGTCCCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3164	2779	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV6_-_2826_3104
tx.4	SIRV1	-	516	2	ISM	SIRV1A	SIRV105	670	5	2825	111	2551	-111	internal_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	143835	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	20	GTCGTAGGTTTGTGAGAAGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7815	6560	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV1_-_6814_7552
tx.40	SIRV6	-	109	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	987448	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TAACGATACGTCCCACGACG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3164	2779	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV6_-_2829_3104
tx.41	SIRV6	-	466	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	442	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	CACCGCCGCGCCTTGCGGAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	7923	7099	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV6_-_7451_7808
tx.42	SIRV6	+	246	3	FSM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	51	486	0	multi-exon	TRUE	canonical	0	0	junction_1	0	2860641	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	18	57	1	57	10724	10780	TRUE	15	TAGCCTGCCTAATTGTTGGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVRIIDERVEVEVVQQES	10723	11279	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	FSM_SIRV6_+_10819_11031_11109_11205
tx.43	SIRV6	+	395	2	ISM	SIRV6A	SIRV615	783	3	486	-1	486	0	intron_retention	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	145376	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	18	57	1	57	10724	10780	TRUE	45	GGAAAGAGCAATCAACTCAC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVRIIDERVEVEVVQQES	10723	11331	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV6_+_10819_11031
tx.44	SIRV6	-	400	2	Antisense	novelGene_SIRV6A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	6986	1	1	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TTCTTTTTCCAGGTAACTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	11331	10723	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV6_-_10825_11032
tx.47	SIRV6	+	1005	2	ISM	SIRV6A	SIRV610	1163	5	8251	-135	486	0	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	103005	0	NA	FALSE	0	NA	NA	C	coding	52	159	591	749	11411	11569	FALSE	35	TAGAAGACCGGGAGTATACT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEQEERDLFVGVNGYVEKHELPNSANQPEMVMENSCVKVRGDVYEEAKLVLV	10723	11825	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV6_+_11109_11205
tx.48	SIRV7	-	420	1	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	113492	4	113314	-1	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	174	1	NA	NA	0	NA	NA	B	coding	40	120	300	419	1125	1006	NA	40	TAATTAGTGTTAATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAEIKVKIIVTIVPGENYLIPTTVIAKIDEIERIKPILPS	1424	1004	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV7_-_1000_1400
tx.49	SIRV7	-	1790	2	ISM	SIRV7A	SIRV702	2247	6	111804	4	111626	-1	3prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	18671	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	coding	40	120	1670	1789	1125	1006	FALSE	40	TAATTAGTGTTAATATGAAT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAEIKVKIIVTIVPGENYLIPTTVIAKIDEIERIKPILPS	3112	1004	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV7_-_2676_2993
tx.5	SIRV1	+	442	2	Antisense	novelGene_SIRV1A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	981919	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TAAAGCATGTACATCGCAAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6634	7815	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV1_+_6811_7549
tx.50	SIRV7	+	1786	2	Antisense	novelGene_SIRV7A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	210	0	NA	TRUE	0	NA	NA	A	coding	22	69	2	70	1007	1075	TRUE	45	TTCTGATATTATAATGAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LGRIGFIRSISSILAITVVGIK	1005	3112	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV7_+_2673_2993
tx.51	SIRV7	-	110	1	NIC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	43750	-14841	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	199	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGTATCGATAAATAGCTTTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	70988	70878	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_70900_71000
tx.52	SIRV7	-	123	1	NIC	SIRV7A	novel	428	3	NA	NA	35775	-22803	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	111667	1	NA	NA	0	NA	NA	B	coding	12	39	65	103	78899	78861	NA	35	TCATCCCCGAAGATTAAGTA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IIKIKLIFVVSGADLNEQSGEMEVIDDSWTISH	78963	78840	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_78800_79000
tx.53	SIRV7	-	310	1	NIC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	-73	-58642	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	541	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTCTTATCGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	114679	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_114700_115000
tx.55	SIRV7	-	350	1	NIC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	-91570	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	369	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATGGTAAAAAGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147607	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_147600_148000
tx.57	SIRV7	-	349	1	ISM	SIRV7A	SIRV706	949	5	0	91577	0	-91571	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	130	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	GTCATGGTAAAAAGACACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147608	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV7_-_147600_148000
tx.58	SIRV1	-	277	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	3552	1	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	10703	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	GCCTGGAAGTCAAAAGACTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6814	6448	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV1_-_6474_6562
tx.6	SIRV1	-	155	2	NNC	SIRV1A	novel	1300	4	NA	NA	-1	-1292	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	43271	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	CTGTCGGGCCCAAATCCTAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10367	7741	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV1_-_7812_10282
tx.60	SIRV4	-	314	3	NNC	SIRV4A	novel	570	5	NA	NA	4946	0	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	12	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	GGATTTGATATTTAGAGCGT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8991	8323	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV4_-_8373_8629_8748_8844
tx.61	SIRV5	-	327	4	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	848	1	1	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	35	TCGCAGGCCATAACTAACAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	6440	5379	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV5_-_5451_5546_5627_6114_6179_6328
tx.62	SIRV5	-	483	2	Antisense	novelGene_SIRV5A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	3995	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	45	AGGACATGTAGAGAAAGATC	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8586	8021	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV5_-_8382_8463
tx.63	SIRV7	-	350	1	NIC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	-91570	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	194	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATGGTAAAAAGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147607	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_147600_148000
tx.64	SIRV2	+	637	2	Genic_Genomic	SIRV2C	novel	424	1	NA	NA	-390	-34	multi-exon	FALSE	non_canonical	0	0	junction_1	0	2026	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TACTGGTTCGACTATTATAG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	3643	4423	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Genic_Genomic_SIRV2_+_3823_3965
tx.65	SIRV2	-	195	2	NNC	SIRV2A	novel	686	5	NA	NA	0	-1081	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	50776	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	coding	46	141	51	191	5845	4751	FALSE	60	AAACATACCAAATGGTAAAA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YVVDEHGCERHFEIYAMISNPTETAIIVEGSISCRVIDMPLSTHDVIVYYVVASLVEIVCDV	5895	4746	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV2_-_4798_5751
tx.66	SIRV2	-	169	2	NNC	SIRV2A	novel	1971	11	NA	NA	0	-1086	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	80089	0	NA	TRUE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	55	AACTAAAACATACCAAATGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	5911	4751	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV2_-_4798_5788
tx.67	SIRV4	+	417	2	Antisense	novelGene_SIRV4A_AS	novel	NA	NA	NA	NA	NA	NA	multi-exon	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	30	0	NA	FALSE	0	NA	NA	A	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	25	TAGCATTATATCCTAGCCTG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	8322	8991	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	Antisense_SIRV4_+_8372_8623
tx.68	SIRV7	-	310	1	NIC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	-73	-58642	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	205	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTCTTATCGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	114679	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_114700_115000
tx.69	SIRV7	-	310	1	NIC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	-73	-58642	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	160	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTCTTATCGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	114679	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_114700_115000
tx.7	SIRV1	+	137	2	NNC	SIRV1B	novel	702	3	NA	NA	-301	-965	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	434732	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TCACACCTTCTGTTGTTGTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10281	10641	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV1_+_10369_10591
tx.70	SIRV7	-	310	1	NIC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	-73	-58642	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	280	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTCTTATCGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	114679	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_114700_115000
tx.71	SIRV7	-	310	1	NIC	SIRV7A	novel	2498	5	NA	NA	-73	-58642	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	288	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10	TAGCTCTTATCGTCTTTTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	114989	114679	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_114700_115000
tx.72	SIRV7	-	350	1	NIC	SIRV7A	novel	949	5	NA	NA	0	-91570	mono-exon	FALSE	NA	NA	NA	NA	NA	186	1	NA	NA	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	40	TCATGGTAAAAAGACACTTT	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	147957	147607	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NIC_SIRV7_-_147600_148000
tx.8	SIRV1	-	128	2	NNC	SIRV1A	novel	670	5	NA	NA	-1	366	at_least_one_novel_splicesite	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	21768	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	15	TCTGGATCCTATTCCAGCGG	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10641	10281	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	NNC_SIRV1_-_10360_10591
tx.9	SIRV1	+	456	2	ISM	SIRV1B	SIRV109	464	3	-64	449	-64	-412	5prime_fragment	FALSE	canonical	0	0	junction_1	0	68884	0	NA	FALSE	0	NA	NA	B	non_coding	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	30	TGGTGACCACGATGCAGATA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	10647	11194	manatee_cDNA_ONT	iso_detect_de_novo_Bambu_cDNA_ONT	ISM_SIRV1_+_10792_10882
